بیماری مالتیپل اسکلروزیس ((ms یک بیماری خود ایمنی تخریب کننده غلاف میلین سیستم عصبی مرکزی (cns) با سبب شناسی ناشناخته است. میزان شیوع این بیماری در قسمت های مختلف دنیا متفاوت است. متاسفانه در طی سال های اخیر نرخ ابتلا به این بیماری در ایران و سایر نقاط جهان به شدت در حال افزایش است. اخیرا مطالعات گسترده ژنوم پیشنهاد می کند که ژن انتقال دهنده سیگنال و فعال کننده رونویسی (stat3) یک ژن مستعد کننده ابتلا به مالتیپل اسکلروزیس است. stat3 روی کروموزوم 17q21.1قرار دارد و فاکتور رونویسی را کد می کند که در مسیرهای بیوشیمیایی متعددی مانند: مسیرjak-stat، آپوپتوزیس، تمایز th17، تکثیر سلولی، آنژیوژنزیس نقش دارد. در این پژوهش پس از مطالعات اپیدمیولوژیک و کسب رضایت نامه از افراد نمونه های خون محیطی 204 بیمار مبتلا به مالتیپل اسکلروزیس و 202 فرد سالم جمع آوری شدند. dna ژنومیک آن ها استخراج گردید و با استفاده از تکنیک pcr-rflp ژنوتیپ در اسنیپ rs744166 تعیین شد. داده های حاصل به روشspss (portable ibm spss (statistics v19 مورد آنالیز آماری قرار گرفت. با توجه به ضرورت و اهمیت مطالعه بیماری ms، در مطالعه حاضر همبستگی پلی مورفیسم rs744166در ژن stat3 با بیماری ms در جمعیت شرق ایران مورد بررسی قرار گرفت. در آنالیز آماری اسنیپ rs744166 که در اولین اینترون از ژن stat3 قرار دارد تفاوت معنی داری بین بیماران مورد مطالعه در مقایسه با افراد سالم مشاهده شد. پیشنهاد می گردد این پژوهش با در نظر گرفتن جامعه آماری بزرگتر و همچنین دیگر قومیت های موجود مجددا تکرار شود تا به نتایج و آمار دقیق تری دست پیدا کنیم.