کاپا کازئین یک پروتئین گلیکوزیله متعلق به خانواده فسفولیپیدها ) (αs1 ,αs2 ,β ,κ می باشد که نقش اصلی در ترکیب پروتئین های شیر را بازی می کند. کاپاکازئین همچنین در پایداری میسیلهای کازئین، اندازه و عملکرد اختصاصی آنها دارای اصلی ترین نقش در بین پروتئین های شیر می باشد. این تحقیق به منظور بررسی ژنتیکی و فیلوژنتیکی توالی نوکلئوتیدی ناحیه غیر کد کننده ژن کاپا کازئین به طول حدود 1200 نوکلئوتید قبل از شروع کدون آغاز در دو گونه شتر تک کوهانه و دو کوهانه ایران انجام گرفت. نمونه خون از 10 نفر شتر تک کوهانه از کشتارگاه مشهد و تعداد 5 نمونه خون شتر دو کوهانه از مرکز اصلاح نژاد شهر مشکین شهر استان اردبیل جمع آوری شد. ناحیه ی مورد نظر با استفاده از آغازگرهای اختصاصی تکثیر و توالی یابی شد. پس از تجزیه و تحلیل های بدست آمده، 3 هاپلوتایپ در نژادهای تک کوهانه و 4 هاپلوتایپ در نژادهای دو کوهانه مشاهده گردید. درخت فیلوژنتیکی با استفاده از روش neighbor-joining به روش هم ترازی توالی تعیین توالی شده با توالی های مشابه ثبت شده در بانک ژنی ترسیم شد. نتایج فیلوژنی مشخص کرد که گونه شتر در میانه گونه هایی که توالی آنها در بانک ژنی ثبت شده بودند بیشترین شباهت را با نژاد bos taurus از خانواده bovidae دارا می باشد.