اشریشیاکلی یکی از شایع ترین گونه های باکتریایی است که عامل عفونت های گوارشی و خارج گوارشی در انسان و دام ها می باشد. توزیع گروههای فیلوژنتیکی ایزوله های اشریشیاکلی کامنسال میان جمعیت انسانی از لحاظ جغرافیایی متفاوت می باشد. هدف این مطالعه بررسی تنوع ژنتیکی و فیلوژنتیکی ایزوله های اشریشیاکلی جمع آوری شده از نمونه های مدفوع در شهرستان زابل به ترتیب با روش rapd و triple-pcr بود. در این مطالعه 100ایزوله اشریشیاکلی با استفاده ازروش های رایج جدا گردیدند. ازمجموع 100 ایزوله اشریشیاکلی 28، 7، 48 و17 درصد به ترتیب به گروه های فیلوژنتیکی a، b1، b2 و d تعلق داشتند. نتایجrapd شباهت ژنتیکی بین 14 تا 100 درصد را نشان داد. در نتیجه ،گروههای فیلوژنتیکی aو b2 در ایزوله ها ی مدفوعی بیشتر بود و درصدی از ایزوله های مدفوعی هم به گروههای b1 و d تعلق داشتند که به طور قابل توجهی کمتر از گروههای دیگر بودند.