مشکلات متعددی مانند: عدم توسعه و وضعیت بد اقتصادی و کمبود منابع آبی که در زمینه سکونتگاه-های روستایی مرزی سیستان وجود دارد زمینه بیکاری و فقر بوده و به مهاجرت جمعیت مرزنشینان منجر می¬گردد. که به تبع آن جمعیت این نواحی تخلیه شده و این به نوبه خود باز باعث کاهش امنیت این مناطق می¬گردد که این یک سلسله زنجیر وار می¬باشد که بر هم اثر می¬گذارند لذا سکونتگاه¬های روستایی در مناطق مرزی از عوامل مهم تاثیر گذار بر امنیت پایدار منطقه می¬باشند. از آنجا که حفاظت از مرزهای هرکشور از مهم¬ترین مسایل کشور است، و امنیت مرزی با امنیت هر کشور مرتبط است لذا بررسی مسائلی که بر امنیت مناطق مرزی موثر هستند ضرورت می¬یابد. از این رو هدف این تحقیق، تعیین اثرات سکونتگاه¬های روستایی در امنیت پایدار مناطق مرزی سیستان می¬باشد. این تحقیق از نوع توصیفی تحلیلی است که با استفاده از اطلاعات میدانی و مطالعات نقش سکونتگاه¬های مرزی روستایی بر امنیت پایدار بررسی گردیده است. اطلاعات میدانی با استفاده از پرسشنامه و بررسی¬های محلی جمع¬آوری و با استفاده از آزمون¬های آماری مورد تحلیل و بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد پراکندگی روستاها با امنیت پایدار رابطه منفی و معناداری در سطح 1 درصد دارد. از میان متغیرهای فرعی امنیت پایدار، متغیرهای امنیت جانی، امنیت مالی، امنیت انتظامی، امنیت دفاعی، امنیت شغلی، امنیت زیست محیطی با پراکندگی روستاها رابطه منفی و معناداری در سطح 1 درصد داشتند، ولی رابطه امنیت اخلاقی و امنیت اعتقادی با پراکندگی روستاها معنادار نشد. ازآنجایی که مهاجرت¬های روستایی و تخلیه روستاها سبب تخلیه جمعیت روستایی گردیده است. لذا باید راهکارهایی برای ماندگاری جمعیت روستایی در نظر گرفته شود.