به منظور بررسی تنوع ژنتیکی، تکامل مولکولی و ارزیابی ذخایر ژنتیکی ماهی صبور (tenualosa ilisha) از منطقه پراکنش گونه ی مذکور در رودخانه ها و سواحل جنوبی کشور ایستگاه هایی در استان های خوزستان و بوشهر و یک ایستگاه از سواحل مالزی جهت مقایسه به عنوان out group انتخاب گردید. تعداد کل 86 نمونه از گونه ی مذکور پس از صید از ایستگاه های انتخابی جهت انجام آنالیز ژنتیکی به آزمایشگاه انتقال داده شدند. جهت انجام مطالعات ژنتیکی، روش سلسله مراتبی برای مناطق نمونه برداری اعمال گردید. قطعات ژنوم ماهی صبور پس از استخراج با روش های معمول با استفاده از پرایمرهای اختصاصی f: l-12260 و r: h-1067 (martin et al., 1992 ) و همچنین f: l14841 و r: h15149 ( kocher et al., 1989 ) تکثیر گردید. قطعات تکثیر شده سپس توالی یابی شده و در نهایت آنالیز ژنتیکی با استفاده از نرم افزارهای ژنتیکی از قبیل bioedit، chromas pro، mega، arlequin وdnasp جهت پاسخ به سئوالات موردنظر انجام شد. نتایج بدست آمده از آنالیزهای آماری و ژنتیکی نشان می دهد که تعداد 8 هاپلوتایپ در سواحل ایران و ساحل غربی مالزی از بین نمونه های آنالیز شده بدست آمده است. آنالیز مولکولی بیانگر این است که چندین زیر جمعیت از ماهی صبور در منطقه خوزستان حضور دارند. همچنین کمترین میزان fst در بین ایستگاههای سواحل خوزستان (0fst=) و بیشترین میزان fst بین ایستگاه بوشهر با ساحل غربی مالزی می باشد 64/0 fst= ). درخت فیلوژنی نشان می دهد که جمعیت انتخاب شده از ساحل غربی مالزی دارای تمایز ژنتیکی نسبت به جمعیت بزرگ سواحل ایرانی می باشد. هر چند هر دو گروه نمونه های ایران و مالزی در یک شاخه فیلوژنی قرار می گیرند.