در پایان نامه حاضر با توجه به ناکارآمد بودن روش های تجربی برای به دست آوردن متغیرهای همودینامیکی شبیه سازی جریان خون در شریان مغزی میانی و شاخه های آن بررسی می شود. برای هندسه ی شریان سه گام طی شده است. ابتدا با سی تی آنژیوگرافی از عروق مغزی داوطلب مرد 74 ساله تصویربرداری شد، نرم افزار mimics10.01 در پردازش تصاویر آنژیوگرام و ایجاد مدل سه بعدی شریان های مغزی به کار رفت سپس در محیط نرم افزار catia v5r21 سطوح ساختار شریانی، منطبق بر خروجی سه بعدی فرآیند پردازش تصاویر آماده شده اند. قابل ذکر است که با این روش هیچ گونه ساده سازی اعم از فرض مقاطع دایره ای برای کل سطوح انجام نگرفته و هندسه ساخته شده کاملاً منطبق بر تصویر سه بعدی رگ است. همچنین موقعیت مقاطع ثبت سرعت میانگین خون در آزمایش داپلر تراجمجمه ای مشخص گردیده است. ایجاد شبکه و تحلیل جریان با نرم افزار comsol multiphysics4.3a بر اساس روش المان محدود انجام شده است. معادلات مربوط به روش گالرکین گسسته سازی شده و به روش نیوتون مستهلک شده حل شده و سپس به تحلیل و بررسی نتایج پرداخته شده است.