نام پژوهشگر: فاطمه واحدی

کلونینگ و بیان آلرژنche a 1، گرده گیاه سلمه
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه رازی - دانشکده علوم 1388
  مریم محدث فر   فاطمه واحدی

chenopodium album(سلمه در فارسی) یک علف هرز متعلق به chenopodium ها که به صورت خودرو در تمام طول سال رشد می کند. گرده chenopodium album عامل اصلی آلرژی درایران است. مهمترین آلرژنهایی که به chenopodium album نسبت داده شده اند عبارتند از : che a 1 ،che a 2 و che a 3. هدف از این کار کلون کردن che a 1داخل باکتری escherichia coli (e. coli) برای تولید آلرژن نوترکیب می باشد. کلونینگ، تولید و خالص سازی آلرژن نوترکیب درباکتری e. coli یک روش اقتصادی درتهیه مقادیر زیاد پروتئین خالص شده برای مقاصد درمانی است. برای کلون کردن این آلرژن،ابتدا از گرده گیاه برای استخراج rna استفاده گردید.سپس با cdna ساخته شده از rna استخراج شده از گرده گیاه chenopodium album ، واکنش زنجیره ای پلی مرازی گذاشته شد. سپس کلونینگ با ورود cdna ساخته شده به داخل پلاسمید pet21b(+) و ترانسفرم کردن آن داخل باکتری e.coli سویه top10 انجام شد. برای بررسی کلونینگ انجام گرفته پلاسمید های حاوی che a 1 تولید شده تعیین توالی گردیدند. نتیجه آزمایشات، وجود قطعه che a 1 را در پلاسمید های قرار گرفته در باکتری e. coli سویه top 10تایید می کرد. نتیجه سکانس های بدست آمده شباهت زیاد این توالی را با توالی موجود در genbank نشان می داد. در نتیجه cdna آلرژن اصلی گرده گیاه chenopodium album، che a 1 با موفقیت کلون شد.در این مطالعه برای اولین از سیستم پروکاریوتی برای کلون کردن che a 1 استفاده گردید.

بررسی پاسخ ایمنی سلولی پس از تزریق داخل ماهیچه ای پلاسمید pcdna3.1+pa در موش
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان خراسان رضوی - دانشکده علوم 1390
  فاطمه عیدی زاده   فاطمه واحدی

پلاسمیدها به عنوان واکسن dna به صورت گسترده به منظور ایجاد پاسخ های ایمنی هوورال و سلولی، مورد استفاده قرار گرفته اند. ارایه ی یک واکسن منوط به کنترل و ایجاد یک پاسخ ایمنی مناسب است. در این تحقیق قابلیت پلاسمید pcdna3.1+pa کد کننده ی آنتی ژن حفاظتی باسیلوس آنتراسیس (pa) در تحریک پاسخ های ایمنی سلولی th1/th2 مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روشها : باکتریهای حاوی پلاسمید pcdna3.1+pa تکثیر شدند. پلاسمید به روش لیز قلیایی استخراج گردید. در این تحقیق از 18 موش استفاده شد که گروهی پلاسمید و گروهی واکسن زنده را بصورت داخل ماهیچه ای دریافت کردند. بعد از 2 هفته لنفوسیت های طحال جداسازی و کشت داده شدند و پس از تحریک با پروتیین pa، تکثیر سلولی با روش mtt بررسی گردید. محلول های کشت از نظر میزان il-4 و inf-? با الایزا بررسی شدند. نتایج : تکثیر لنفوسیت های طحال در گروههایی که پلاسمید و واکسن زنده را دریافت کرده بودند با روش mtt مشخص شد. افزایش میزان inf-? در کشت سلول های طحال حاصل از موش هایی که پلاسمید را دریافت کرده بودند بطور معنی داری (p<0/05) بالاتر از گروه های منفی و گروهی از موش ها بودند که واکسن زنده را دریافت کرده بودند. افزایش میزان il-4 تنها در کشت سلول های طحال حاصل از موش هایی که واکسن زنده دریافت کرده بودند (p<0/05) معنی دار بود. بحث : پلاسمید pcdna3.1+pa سبب تحریک هر دو نوع سلول های زیر رده ی th1 و th2 می شوند . در حالیکه واکسن زنده تنها سبب تحریک سلول های th2 می شود.

طراحی پلاسمیدهای یوکاریوتی کدکننده آنتی ژن های cfp-10 و esat-6 بر علیه سل گاوی و بررسی ایمنی زایی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه فردوسی مشهد - دانشکده کشاورزی 1393
  اعظم ترابی   مجتبی طهمورث پور

تلاش های بیشماری جهت تهیه واکسن موثر علیه بیماری سل گاوی انجام شده است که در این راستا ایمن سازی با پلاسمید نوترکیب حاوی آنتی ژن های هدف، راهکاری امید بخش به شمار می آید. این مطالعه با هدف کلونینگ، تایید بیان و ارزیابی ایمنی زایی پلاسمیدهای یوکاریوتی کد کننده ایمونوژن های هدف در مدل موش balb/c مورد بررسی قرار گرفت. آنتی ژن های 6 esat-و cfp-10 در پلاسمید بیانی یوکاریوتی pcdna3.1(+) کلون شدند. صحت و عملکرد پلاسمیدهای نوترکیب pcdna3.1(+)/esat-6 و pcdna3.1(+)/cfp-10در سطح dna با روش کلونی pcr، نقشه یابی آنزیمی و توالی یابی، در سطح rna باrt-pcr ژن esat-6 و cfp-10 از بافت ماهیچه مورد تزریق و در سطح پروتئین با وسترن بلات تایید شد. سپس موش هایbalb/c به 7 گروه تقسیم شدند و با تیمارهای پلاسمید نوترکیبesat-6 ، cfp-10، ترکیب دو پلاسمید، ppd، pbs، pcdna3.1(+) و گروه بدون تزریق ایمن شدند. بیست روز پس از تزریق، موش ها کشته و طحال و نمونه بافت ماهیچه آنها جدا شد. سپس سوسپانسیون لنفوسیتی تهیه و با ppd گاوی ppdانسانی مواجهه شد و پس از 72 ساعت به منظور سنجش تحریک سلول های لنفوسیت، تست mtt انجام شد. مایع رویی کشت لنفوسیت ها جهت بررسی الگوی ترشحی جمع آوری و با تست الایزا مقادیر ifn-y ، il-10 و il-4 اندازه گیری شد. همچنین سنجش بیان ژن های ifn-y ، il-10 و il-4 به وسیلهreal-time pcr صورت گرفت. آزمایشات الایزا وmtt تایید کرد که پلاسمیدهای نوترکیب کد کنندهesat-6 وcfp-10 توانایی القاء پاسخ ایمنی را در موش ها دارد و می توانند با القاء پاسخ ایمنی کاندید مناسبی برای dna واکسن علیه عفونت سل گاوی باشند.

معماری ایران بر اساس سفرنامه های اروپاییان در عصر صفوی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه الزهراء - دانشکده الهیات 1393
  فاطمه واحدی   فریبا پات

معماری آثار و ابنیه تاریخی ایران یکی از مهم ترین موضوعات مهم و قابل توجه برای سیاحان عصر صفوی بوده است. سیاحانی که با سفر به ایران و ارائه توصیفات خود موفق شده اند گنجینه های هنری و تاریخی باارزشی از خود برجای گذارند. امروزه بامطالعه این سفرنامه ها می توان به اطلاعات بسیاری در رابطه با وضعیت شهرهای ایران و ابنیه آن ها دست یافت که کمتر در منابع تاریخی آن دوره به چشم می خورد. سیاحان در سفرنامه های خود در این دوره تا حد زیادی موفق شده اند تصویر نسبتاً واقع گرایانه ای از این آثار و ابنیه بر اساس پیشه، هدف و مدت اقامت شان ارائه دهند. نکته قابل توجه این است که در میان توصیفات متفاوت و مشابه سیاحان از آثار و ابینه موجود در شهرهای ایران بیشترین توجه به اصفهان و سپس شهر قم است و بیشتر توصیفات آن ها در درجه نخست مربوط به کاخ های سلطنتی، کاروانسراها، مقابر، مساجد، پل ها و بازارها بوده است، درحالی که کمترین توصیف در سفرنامه ها مربوط به مدارس است. کلیدواژه ها: معماری (باغ، کاخ، کاروانسرا، مقبره، مسجد، پل، بازار)، سفرنامه های اروپایی، عصر صفوی

جداسازی، همسانه سازی و بیان ژن کنترل کننده پروتئین خارج غشایی omp 31 از منشأ brucella melitensis، مقدمه ای برای تولید واکسن بروسلوز
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه فردوسی مشهد - دانشکده کشاورزی 1388
  احمدفرهاد طالبی   فاطمه واحدی

بروسلوز با بیش از نیم میلیون مورد گزارش سالانه بیماری، از شایع ترین بیماری های مشترک بین انسان و دام می باشد. در جهت ساخت واکسنی ایمن و بدون عوارض جانبی بر علیه این بیماری، کلونینگ ژن یکی از شاخص های مهم ایمنی زایی به نام omp31 در باکتری اشریشیا کلی به عنوان هدف این مطالعه در نظر گرفته شد. در این پژوهش پس از جداسازی و تکثیر قطعه ژنیomp31 از باکتری بروسلا ملی تنسیس سویه ی revi با استفاده از روش pcr، این ژن برای درج در ناقل بیانی pet32b(+) آماده گردید. سپس سازه ژنی pet32b(+)-omp31 به داخل باکتری اشریشیا کلی سویه bl21 وارد شد. برای تولید پروتئین از القا پلاسمید توسط iptg استفاده گردید. پروتئین نوترکیب توسط متیل افینیتی کروماتوگرافی ni-nta خالص گردیده و به روش براد فورد میزان آن تعیین گردید. ترادف نوکلئوتیدی ژن کلون شده در ناقل pet32b(+) با ژن omp31 بروسلا ملی تنسیس مطابق بود. پروتئین نوترکیب omp31 بصورت یک فیوژن پروتئین با وزن مولکولی 47 کیلو دالتون و با 6x his tag در دو انتها، عمدتاً در فاز نامحلول، بیان گردید. در شرایط بهینه برای تولید پروتئین، ، عملکردی در حدود 0/4 میکروگرم پروتئین خالص به ازای 20 میلی لیتر محیط کشت بدست آمد. پروتئین نوترکیب omp31 در باکتری اشریشیا کلی به صورت یک پروتئین فیوژن تولید و خالص گردیده و جهت مطالعات بیوشیمیایی و آنتی ژنیک بعدی در اختیار است.

طراحی پلاسمید قابل بیان در سلول یوکاریوتی کد کننده آنتی ژن غشایی (omp31) بروسلا ملیتنسیس به منظور ساخت واکسن اسید نوکلئیکی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه الزهراء - دانشکده علوم پایه 1388
  الناز قربانی   فاطمه واحدی

بروسلوزیس یکی از بیماری های مهم مشترک بین انسان وحیوان است که عامل آن گونه های مختلف جنس بروسلا می باشند. بروسلاها باکتری های گرم منفی اختیاری درون سلولی هستند که طیف وسیعی از حیوانات و هم چنین انسان را آلوده می کنند، لذا این بیماری، ضررهای اقتصادی و بهداشتی زیادی به بار می آورد. از آن جا که واکسن های قبلی بروسلا، بازدهی ایده آل نداشته اند، ساخت نسل جدیدی از واکسن ها که فاقد معایب پیشین بوده و در عین حال موثر وایمن باشند، اهمیتی ویژه می یابد. واکسن های dna یا واکسن های نسل سوم به دلیل مزیت های فراوانی که نسبت به واکسن های سنتی نشان داده اند، به نحوی گسترده مورد مطالعه قرار گرفته اند. از جمله ویژگی های منحصر به فرد این واکسن ها که آنها را بسیار مورد توجه قرار داده است ایمن و بی خطر بودن آنها، کوتاه بودن روند طراحی و هزینه های پایین تولید وهم چنین توانایی ایجاد پاسخ های ایمنی سلولی و هومورال توسط این نوع واکسن ها می باشد. در این بررسی، ژن omp31 بروسلا ملی تنسیس که به دلیل توانایی اثبات شده آن در القای پاسخ ایمنی، به عنوان کاندیدایی مناسب جهت ساخت واکسن dna شناخته شده است، در وکتور بیانی مناسب pcdna3.1 قرار گرفته و باکتری های e .coli سویه top10 با این وکتور ترانس فورم شدند. سپس باکتری های ترانس فورم شده که بر روی پلیت آگار محتوی آمپی سیلین رشد کرده بودند انتخاب شده و خالص سازی پلاسمید جهت بررسی کارایی بیان آن صورت گرفت. بررسی استخراج rna بافتی پس ازتزریق این پلاسمید نوترکیب به موش، نشان دادکه بیان ژن omp31 با موفقیت انجام شده است. از آن جا که هدف نهایی این طرح، ساخت واکسن اسیدنوکلئیکی می باشد در مطالعات بعدی باید بیان پروتئین و هم چنین توانایی این واکسن در القای پاسخ های ایمنی مصونیت زا مورد بررسی قرار بگیرد.