نام پژوهشگر: محمدعلی آموزگار

جداسازی باکتری های نمک دوست متحمل به نیکل از دریاچه آران و بیدگل وشناسایی نسبی آن با استفاده از ژنs rdna 16 وتست های بیوشیمیایی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1389
  فرناز خدابخش   سنبل ناظری

فلزات سنگین برای انسان، حیوانات و حتی گیاهان سمی هستند. بطور مثال آالودگی به نیکل در انسان می تواند به ازدیاد حساسیت تماسی و سرطانزایی منجر گردد. جهت زدودن فلزات سنگین از محیط زیست، روش های فیزیکو - شیمیایی به همراه روشهای بیولوژیک استفاده می-گردد. برخی باکتری ها به این فلزات مقاوم بوده و در حضور آنها قادر به رشد هستند. این باکتری ها قادر به حذف فلزات سنگین از طریق تجزیه زیستی هستند. در این پژوهش، باکتری های نمک دوست نسبی از دریاچه شور آران و بیدگل جداسازی شده و مقاومت آنها در ابتدا به نیکل و سپس به سرب، کادمیوم، کبالت، نقره، مس و روی بررسی شد. کارایی پاکسازی و توان جذب باکتری های های مقاوم به نیکل مورد بررسی قرار گرفت. بررسی های مرفولوژیکی، بیوشیمیایی و نیز فیلوژنتیکی بر روی این باکتری ها صورت گرفت. چهل و شش ایزوله باکتری، از نمونه های انتقال یافته به محیط کشت حاوی 10 درصد نمک جداسازی شد. در آزمایش مقاومت به فلز نیکل، چهار باکتری مقاوم به نیکل مشخص گردید. این چهار باکتری برای آزمایشات بعدی انتخاب شدند. ایزوله های فوق همگی کوکوباسیل، گرم منفی، فاقد اندوسپور و بی هوازی اختیاری بودند. همگی توانایی استفاد از قند ترهالوز را به عنوان منبع کربوهیدرات داشتند و همگی کاتالاز، اکسیداز، اوره آز مثبت بودند. ایزوله ها مقاوم به پنی سیلین و به اریترومایسین حساس و همگی به سرب مقاوم و به نقره حساس بودند. آزمایش نحوه جذب نیکل نشان داد که باکتری ها به روش غیر فعال نیکل را از محیط کشت جذب می کنند.به این معنی که نه تنها سلول های زنده، بلکه سلول های مرده این باکتری ها نیز توانایی جذب نیکل را در محیط دارند. بررسی بر اساس تعیین توالی ژن کد کننده s rrna16 نشان داد که دو ایزوله از جنس salinivibrio بودند و یکی از ایزوله ها شباهت 99 درصد با costicola salinivibrio داشت.

استخراج و تخلیص پروتئین hu از باکتری halobacillus karajensis
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه الزهراء - دانشکده علوم پایه 1390
  رعنا صمدی پاکچین   پریناز قدم

میکروارگانیسم ها برای فشرده کردن dna سلولی از گروهی از پروتئین های بازی استفاده می کنند. این گروه از پروتئین ها اثرات عمیقی بر روی بیان ژن ها، نوترکیبی، همانندسازی dna، رشد و توانایی حیات دارند و به عنوان پروتئین های شبه هیستونی شناخته می شوند. از جمله ی این پروتئین ها می توان به hu، h-ns، fis و اشاره کرد. پروتئین های hu برای نگهداری ساختار نوکلئوئید ضروری هستند. بعلاوه آنها در وظایف وابسته به dna شامل همانندسازی، ترمیم، نوترکیبی و تنظیم ژن ها نیز شرکت می کنند. با توجه به این توانایی ها، پروتئین های hu بیشتر به عنوان عوامل ساختاری عمل می کنند و با ایجاد یک توپولوژی ویژه از dna، گردهمایی ساختارهای پیشرفته ی نوکلئوپروتئینی را ارتقاء می بخشند. اگرچه پروتئین های hu از لحاظ تکاملی در بین یوباکتری ها بسیار حفاظت شده هستند با این وجود هر کدام ازآنها به مناطق ویژه ای مربوط به خود تمایل دارند و متصل می-شوند. وجود این چنین تفاوت هایی نشان دهنده ی تکامل وظایفی این پروتئین ها و نقش های متفاوت آنها در داخل سلول است. با توجه به اهمیت این پروتئین و اینکه این پروتئین تا کنون در یک باکتری هالوفیل بررسی نشده است لذا ما در این پژوهش این پروتئین را در باکتری halobacillus karajensis مورد بررسی قرار دادیم. در این پژوهش باکتری halobacillus karajensis در نوترینت براث حاوی 10% nacl کشت داده شد بیومس در فاز لگاریتمی رشد جمع آوری شد. پروتئین ها بوسیله ی ترسیب با آمونیوم سولفات رسوب داده شدند (40-%90). سپس پروتئین های استخراج شده بر روی ژل sds page مورد بررسی قرار گرفت، درصد مناسب از آمونیوم سولفات انتخاب شد و رسوب آن بر روی ستون deae-sepharose cl-6b برده شد. سرانجام فرکشن های حاصل از کروماتوگرافی بوسیله ی وسترن بلاتینگ چک شدند تا آنهایی که دارای پروتئینی با خواص ایمنولوژیکی مشابه hbsu هستند مشخص شوند و مشاهده شد که فرکشن های ابتدائی چنین هستند. pi پروتئین خاص شده تعیین گردید. نتیجه گیری: باکتری halobacillus karajensis دارای یک پروتئین مشابه از لحاظ ایمنولوژیکی با hbsu است که دارای pi برابر با 5/9 می باشد.

کلونینگ، بیان و بررسی خصوصیات بیوشیمیایی و ساختاری آنزیم لاکاز جداشده از باکتری باسیلوس آنتراسیس سویه ی qza2
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پایه 1392
  طیبه فروغی پردنجانی   محمدعلی آموزگار

لاکازها آنزیم های چند مسی متعلق به گروه اکسیداز های آبی اند. سوبستراهای مختلف (برای مثال فنول ها و ترکیبات آروماتیک یا آمین های آلیفاتیک) را اکسید کرده و اکسیژن مولکولی را به عنوان پذیرنده نهایی الکترون استفاده می کنند. در این پژوهش ژن لاکاز از باکتری bacillus .anthracis سویه qza2 تکثیر و سپس در ناقل بیانی کلون و به باکتری e.coli انتقال یافت و آنالیز توالی انجام گرفت. ژن لاکاز جدا شده از سویه qza2 دارای 16% شباهت آمینواسیدی به پروتئین cota از باسیلوس سوبتیلیس و57% شباهت به لاکاز باسیلوس هالودورانت می باشد. بمنظور به دست آوردن پروتئین فعال، بیان تحت شرایط هوازی و در دمای پایین انجام گرفت. پروتئین نوترکیب بوسیله ستون تمایلی تخلیص و جرم مولکولی آنزیم تعیین گردید. تعیین خصوصیات بیوشیمیایی آنزیم با استفاده از سوبسترای معمول لاکاز ¬¬2,2?-azino-bis(3-ethylbenzothioazolin-6-sulphonic acid) (abts) انجام گرفت. آنزیم دردمایc?55 بهترین فعالیت را دارد. در مطالعات سینتیکی km و kcat این آنزیم برای abts¬µm 111 و s-1 130 تعیین گردید. یون کلراید اثر مهار کنندگی شدیدی بر روی آنزیم دارد. ph بهینه فعالیت آنزیم 2 میباشد. این خصوصیت غیر معمول آن را نسبت به سایر لاکازهای باکتریایی شناخته شده متمایز می کند. پایداری حرارتی و اثر یون های فلزی مختلف بر فعالیت آنزیم نیز بررسی شد.

بررسی حذف و احیای تلوریت پتاسیم در اکتینومیست ها
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تهران 1386
  مریم خشنودی   محمدعلی آموزگار

چکیده ندارد.

بهینه سازی تولید آنزیم پروتئاز نمک - قلیادوست تولیدشده توسط باکتری salinivibrio sp. af-2004
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تهران 1386
  مهبد حاجی قاسمی   محمدعلی آموزگار

چکیده ندارد.

جداسازی و شناسایی اولیه باکتریهای نمک دوست و تحمل کننده نمک تولیدکننده اگزوپلی ساکارید بومی ایران
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تهران 1385
  شیما صفاییان   محمدعلی آموزگار

چکیده ندارد.

ارزیابی تولید دانه های beta-پلی هیدروکسی بوتیرات به وسیله باکتری های نمک دوست و تحمل کننده نمک بومی ایران
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تهران - دانشکده علوم 1387
  محدثه رمضانی   محمدعلی آموزگار

چکیده ندارد.

جداسازی و شناسایی اولیه باکتریهای نمک دوست نسبی و ارزیابی آمیلاز و مقاومت به فلزات و اکسی آنیونهای سمی در آنها
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تهران - دانشکده علوم 1362
  محمدعلی آموزگار   فریدون ملک زاده

دراین پژوهش ، باکتریهای نمک دوست نسبی هوازی بومی از مناطق مختلف در ایران جدا گشت. یکی از سویه ها بنام سویه ‏‎ma-2‎‏ براساس مطالعات ژنتیکی، فیزیولوژیک و بیوشیمیایی انجام شده ، یک گونه جدید باکتری شناخته و ‏‎halobacillus karajensis‎‏ نامیده شد. یک سویه باکتری گرم مثبت نمک دوست نسبی دارای اسپور از خاک شور سطحی منطقه ای در کرج جدا گشت و سویه ‏‎ma-2‎‏ نامیده شد.باکتری میله ای شکل و هوازی اجباری بوده و در زیر میکروسکوپ بصورت تک، جفت مشاهده شد.در قسمتی دیگر از کار پژوهشی یک سویه باکتری نمک دوست نسبی بنام ‏‎halomonas‎‏ سویه ‏‎mam‎‏ از خاک پرشور در گرمسار جدا شد. آزمایشهای اولیه نشان داد که این سویه مقاومت بالایی به اکسی انیونها دارد.نتایج بدست آمده نشان داد که سویه ‏‎mam‎‏ تراکم های بیش از 500 میلی مول مولیبیدات و تنگستات ، تراکمهای 450 میلی مول ارسنات و سلنیت ، تراکم 400 میلی مول سلنات ، تراکم 100 میلی مول بی سلنیت ، تراکم 25 میلی مول کرومات و تراکم 1 میلی مول تلوریت را تحمل می کند، در حالیکه در محیط دارای تنها آنیون تلوریت مقاومت حداکثر یک میلی مول می باشد. مقاومت به بی سلنیت نیز هنگامی که در محیط همراه سدیم سلنیت می شود از 100 میلی مول به 200 میلی مول افزایش می یابد.