نام پژوهشگر: محمد رضا میرزایی

بررسی اثر مهار واریانت oct4b1 بر پروفایل بیانی ژنهای کنترل کننده مسیرهای سلولی مرگ برنامه ریزی شده و استرس در رده های سلولی u87mg (تومور بدخیم مغز)، 5637 (تومور مثانه) و ags (آدنوکارسینومای معده)
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم 1393
  محمد رضا میرزایی   جواد مولی

oct4 یکی از ژنهای مهم و کلیدی در سلولهای بنیادی است و کد کننده یک فاکتور رونویسی است که نقش کنترل بیان ژنهای مرتبط با بنیادی بودن (stemness) را به عهده دارد. با فرایند پیرایش افتراقیalternative splicing) ) حداقل سه واریانت مختلف با عملکرد متفاوت از این ژن سنتز میگردد. عمده ترین نقش این ژن کنترل پرتوانی (pluripotency) و خود باز آفرینی (self-renewal) در سلولهای بنیادی است، بطوریکه بیان این ژن نشان دهنده بنیادی بودن و کاهش یا توقف بیان آن نشانه شروع تمایز سلولی و تبدیل سلول بنیادی به یک سلول سوماتیک است. با ارائه نظریه سلول بنیادی سرطان (cancer stem cell) که بر اساس آن منشاء سرطان را سلولهای بنیادی موجود در بافت (adult stem cell) میدانند، یافتن مکانیسم های سلولی و ملکولی که سلول بنیادی را به سمت ایجاد سلول بنیادی سرطان هدایت میکند، میتواند در یافتن راههای تشخیص، درمان و پیشگیری از سرطان بسیار راهگشا باشد. مطالعات اخیر نشان داده است که واریانت oct4b1 در رده های سلول سرطانی بیان میشود و قدرت سرکوبگری مرگ برنامه ریزی شده (antiapoptotic) دارد، بنابراین این احتمال قوت گرفت که این واریانت با ممانعت از خود کشی سلول? به روند تومور زایی کمک میکند. اما با وجود اهمیت موضوع مکانیسم این عمل و ژنهای متاثر از این واریانت در مسیر مرگ برنامه ریزی شده مشخص نشده اند. از طرفی در مطالعه ای که اخیرا انجام شده است مشخص شده است بیان این واریانت (oct4b1) تحت تاثیر پروتئین های دخیل در استرس سلولی نیز قرار می گیرد? بطوریکه بیان این واریانت در پاسخ به استرس سلولی (شوک حرارتی ) افزایش میابد? اما پروفایل بیانی ژنهای کنترل کننده استرس و دخیل در این فرایند تعیین نشده است. با عنایت به اهمیت موضوع و ارتباطی که مرگ برنامه ریزی شده و استرس در شروع و پیشرفت سرطان دارند و نقشی که oct4b1 در بروز ژنهای این دو مسیر سلولی دارد، در این مطالعه، هدف تعیین پروفایل بیانی ژنهای کنترل کننده مرگ برنامه ریزی شده و استرس بدنبال سرکوب واریانت oct4b1، در رده های سلول سرطانی u-87mg (تومور بدخیم مغز)، 5637 (تومورمثانه) و ags (آدنوکارسینومای معده) میباشد .بدنبال کشت سلولهای مورد مطالعه، ابتدا با استفاده از پروب و پرایمرهای اختصاصی، بیان واریانت های مختلف oct-4 (oct-4a,oct-4b and oct-4b1) با روش real-time pcr مورد آنالیز قرارخواهد گرفت? سپس، با استفاده ازتکنولوژی sirna بیان واریانت oct-4b1 سرکوب می گردد? پس از اطمینان از سرکوب oct4b1? پروفایل بیانی ژنهای مورد نظر در دو مسیر سلولی مرگ برنامه ریزی شده و استرس تعیین میشود. با مقایسه پروفایل بدست آمده در دو گروه سلولی شاهد وکنترل، پروفایل بیانی ژنهای متاثر از مهارواریانت oct-4b1، مربوط به مسیرهای سلولی مورد مطالعه تعیین و گزارش خواهند شد.

بررسی پارامتری رفتار نیمه فضاهای غیرخطی دوبعدی تحت انفجار زیرزمینی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شیراز - دانشکده مهندسی 1392
  محمد رضا میرزایی   محمود رضا بنان

پیش بینی ناحیه آسیب دیده تحت انفجارهای زیرزمینی ناشی از انفجارهای تصادفی، حملات تروریستی یا انفجارهای صنعتی در مهندسی ژئوتکنیک حائز اهمیت فراوانی است. مطالعات متعددی با در نظر گرفتن رفتار خطی برای محیط اطراف انفجار انجام شده است. اما می دانیم که در نظر گرفتن رفتار خطی برای محیط سنگ یا خاک نمی تواند چندان دقیق باشد. در این تحقیق برای نزدیک شدن هر چه بیشتر به آنچه در واقعیت رخ می دهد با در نظر گرفتن یک محیط غیرخطی برای یک نیم فضای دوبعدی متقارن محوری به بررسی رفتار محیط سنگ یا خاک در اطراف محل انفجار پرداخته ایم. برای شبیه سازی از نرم افزار abaqus استفاده نموده ایم. بدین ترتیب که یک نیم فضای دوبعدی متقارن محوری را در این نرم افزار مدل کرده و رفتار غیرخطی محیط را توسط مدل ریاضی مور-کولمب و انفجار را به وسیله معادله حالت jwl شبیه سازی نموده ایم. برای حل مسئله در اطراف محل انفجار که جابه جایی های بزرگ رخ می دهد از مش بندی ale استفاده شده است. مدل به دست آمده نسبت به گام زمانی و سایز مش بندی کالیبره شده است. مطالعه پارامتری برای اندازه گیری تاثیر مشخصات محیط، شدت انفجار و عمق انفجار انجام پذیرفته است. پاسخ های مورد نظر برای اندازه گیری شامل سرعت اوج ذره (ppv)، فشار حداکثر در محیط و شعاع متوسط ناحیه پلاستیک (به عبارت دیگر ناحیه آسیب) بوده است. نتایج متعددی از مطالعه پارامتری به دست آمد، از جمله اینکه نرخ کاهش پاسخ ها در ناحیه الاستیک نسبت به ناحیه پلاستیک و همچنین روی سطح زمین نسبت به عمق زمین سریع تر می باشد. با افزایش سختی محیط، مقدار فشار حداکثر در آن افزایش یافته و مقدار سرعت حداکثر ذره و شعاع متوسط ناحیه پلاستیک کاهش می یابد. مقدار وزن ماده منفجره تاثیر زیادی روی نرخ کاهش پاسخ ها ندارد ولی دامنه آن ها را به شدت تغییر می دهد که البته این تغییر دامنه متناسب با تغییر وزن خرج است. در نهایت اینکه عمق انفجار اگر به اندازه کافی عمیق باشد تاثیر زیادی روی مقدار پاسخ ها نخواهد داشت.