برای نقد و بررسی عملکرد تاریخ قرآن پژوهان میرمحمدی و زنجانی، با محوریت جستجو از موضوعات اصلی تاریخ قرآن در ابتدا ساختار و محتوایی منطقی با تکیه بر تفکر شخصی و بررسی انتقادی اهم کتاب های تاریخ قرآن موجود عرضه شده است، هفت موضوع اصلی تاریخ قرآن به ترتیب عبارتند از: ارتباط، انتقال، حفظ و نگهداری، سازماندهی، کیفیت تلفظ و تاثیر لهجه ها، اصلاح شیوه ی نگارش و ترجمه. سپس بر این اساس، در بعد ساختاری مشخص شده است که نحوه ی عرضه تعداد وترتیب موضوعات اصلی تاریخ قرآن، در این کتاب ها، منطقی نیست و قابلیت کم، زیاد شدن و جابجایی دارد. همچنین در بعد محتوایی، بعضی دیدگاه های دو مولف درباره ی این موضوعات اصلی، صحیح نیست.