طیف سنجی جرمی یکی از حساس ترین روش ها درآنالیزمواداست.دراین روش مولکول هاو اتم های خنثی یونیزه می شوند. سپس در میدان الکتریکی، مغناطیسی و یا الکترومغناطیسی جداسازی و توسط آشکارساز، شناسایی می شوند. طیف سنج جرمی زمان پرواز یکی از ساده ترین، پرکاربردترین وسریعترین دستگاه های تجزیه گر جرمی است. در این پایان نامه از طیف سنج جرمی زمان پرواز ساخته شده در آزمایشگاه لیزر دانشکده شیمی دانشگاه صنعتی اصفهان برای بررسی طیف جرمی آمینواسیدهای فنیل آلانین، آلانین، والین و پرولین استفاده شده است. در طیف سنج جرمی زمان پرواز مورد استفاده در این تحقیق، از لیزر nd:yag با طول موج nm 1064 به عنوان منبع یونیزاسیون استفاده شده است. در این تحقیق، از روش جدیدی که برای اولین بار در آزمایشگاه لیزر دانشکده شیمی دانشگاه صنعتی اصفهان معرفی شد استفاده شد. در این روش نور لیزر به پشت صفحه استیلی حاوی اسیدآمینه و نمک قلیایی تابانده شد و به دلیل عدم برهمکنش مستقیم نور و نمونه، قطعه قطعه شدن مولکول اسیدآمینه به حداقل رسیده یا اصلا مشاهده نگردید. با تابش لیزر به پشت صفحه، مولکول اسیدآمینه به همراه نمک قلیایی از سطح تبخیر شده و کاتیون های قلیایی به اسیدآمینه متصل می شوند. در این تحقیق ابتدا طیف صفحه از جنس استیل نازک (mm0/1) بدون نمونه ثبت شد که شامل یون های+k+،cr+، mnو+fe بود که از این یون ها برای کالیبراسیون جرمی استفاده شد. همچنین طیف دو نمک سدیم فلوراید و لیتیم کلراید بر روی صفحه استیل نیز، هرکدام جداگانه ثبت گردید و یونهای +na+ na.naf+ li+ li.licl مشاهده شدند.سپس فنیل آلانین و سدیم فلوراید بر روی صفحه گذاشته شدند و طیف آن ثبت شد. در این طیف گونه+[phe+2na-h] مشاهده شد. آزمایش با نمک لیتیم کلراید نیز تکرار شد و این نتیجه بدست آمد که لیتیم بهتر از سدیم به اسیدآمینه ها متصل می شود. از این رو راندمان یونش بیشتری دارد. همچنین طیف فنیل آلانین، آلانین، والین و پرولین با نمک لیتیم کلراید ثبت شد. در این روش یون هایی مشابه یون های مشاهده شده در روش maldi مشاهده شدند. تمام اسیدهای آمینه یون هایی به فرم+[amino acid+2li-h] تشکیل دادند.