آسیب¬شناسی آثار علمی، یکی از فعالیت های پژوهشی مهم است که می تواند علاوه بر روشن کردن نواقص و ضعف ها، راه برطرف کردن آنها را نشان دهد. اثر حاضر با هدف شناسایی و معرفی آسیبهای پایان¬نامه¬های علوم قرآنی نگارش یافته است و 62 پایان¬نامه کارشناسی¬ارشد دانشکده علوم و فنون قرآن تهران را مورد بررسی قرار داده است. آسیبهایی که در بخش¬های موضوعی، روشی و محتوایی مطرحند، برای این مهم انتخاب شده¬اند، زیرا یافتن موضوعی مناسب و اجرای آن با روشی کارآمد، موجب به وجود آمدن متنی با محتوای مستحکم خواهد شد. این اثر که با روش تحلیل محتوا انجام شده، طی مراحلی اطلاعات لازم برای شناسایی نحوه عملکرد دانشجویان در پایان¬نامه-نویسی را جمع¬آوری کرده است. ابتدا، با توجه به منابع روش تحقیق، معیارهای ارزیابی آثار علمی در زمینه¬ موضوع، روش و محتوا استخراج شده و طبق آن فرمی برای ارزیابی پایان¬نامه¬ها طراحی گردید. در ادامه، هر پایان¬نامه مورد مطالعه قرار گرفت و برای هر اثر، فرمی تهیه شد. بعد از اطمینان از صحت اطلاعات مندرج در فرمها، آمار هر بخش تهیه، و بر اساس آن، تحلیل نهایی صورت گرفت. بر اساس یافته¬های تحقیق، دانشجویان در انتخاب موضوعی سودمند، عملکرد مطلوبی دارند، اما اغلب از ارائه مطالب جامع ناتوانند. مهمترین آسیب در زمینه روشی عدم معرفی روش تحقیق و توضیح چرایی آن است. آسیبهایی چون: عدم انتخاب روش مناسب با مساله، عدم استفاده از استدلال¬های صحیح و عدم تنظیم مطالب فصول متناسب با فرضیه، از دیگر اشکالات روشی است. در بخش محتوایی با وجود عملکرد مطلوب در برخی موارد، آسیبهایی مشهود است که مهمترین آنها به شرح زیر می¬باشد: نواقص در نگارش پیشینه، کپی زیاد مطالب، نقلهای طولانی در برخی موارد، حضور کم¬رنگ دانشجو در خلال مطالب نقل شده، نداشتن جامعیت در تعدادی از آثار، رجوع نکردن به منابع اصیل و کم تنوعی منابع در تعدادی دیگر.