دانشگاههای کشور تا قبل از انقلاب اسلامی بر اساس مصوب هییتهای امناء به صورت مستقل اداره می شدند از سال 1358 به بعد امور این قبیل موسسات تابع مقرارت عمومی کشور گردید با تصویب قانون اهداف و تشکیلات وزارت علوم و همچنین قانون برنامه چهارم توسعه که از ابتدای سال 1384 اجرایی گردید مجددا استقلال مالی، اداری، استخدامی و تشکیلاتی به موسسات مزبور اعطا گردید. تا قبل از استقلال اداره امور حسابداری و نظارت مالی این موسسات و به تبع آن مسیولیت پاسخگویی مالی انها به عهده ذیحساب منصوب وزارت امور اقتصادی و دارایی بود از سال 1384 و در اجرای قانون برنامه چهارم سیستم نظارت مالی تغییر و مدیر امور مالی توسط روسای دانشگاههای منصوب و جایگزین ذیحساب منصوب وزارت امور اقتصادی و دارایی گردید با این ترتیب، از آن زمان تاکنون روسای این نهادها در قبال هیاتهای امنا و دیوان محاسبات کشور مسیولیت پاسخگویی مالی حاکم بر مصرف منابع مالی عمومی را بر عهده دارند. از آنجا که روسای این قبیل موسسات به دلایل وظایف سنگین و احتمالا عدم تخصص مالی، فرصت کافی برای نظارت بر امور مالی را ندارند، به نظر می رسد تشکیل کمیته حسابرسی و استقرار واحد حسابرسی داخلی مستقل جهت ارتقای سطح مسیولیت پاسخگویی از اهمیت در خور ملاحظه ای برخوردار باشد در این تحقیق با استفاده از ابزار پرسشنامه و توزیع بین اشخاص متخصص و ذیربط در دانشگاهها ضرورت تشکیل کمیته حسابرسی و استقرار واحد حسابرسی داخلی جهت ارتقای سطح مسیولیت پاسخگویی مالی موسسات مزبور مورد بررسی قرار گرفت یافته های تحقیق بیانگر آن است که استقرار واحد حسابرسی داخلی و تشکیل کمیته حسابرسی در دانشگاهها و موسسات آموزش عالی و تحقیقاتی ضروری بوده و موجب ارتقای سطح مسیولیت پاسخگویی در این قبیل موسسات می گردد.