نام پژوهشگر: رضا شیرکوهی

شناسایی عفونت hcmv در نمونه های مختلف بافتی تومورهای مغزی گلیوما
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پزشکی 1392
  محمدرضا جباری   فرزانه صباحی

مقدمه: ویروس سایتومگال انسانی (hcmv) بتاهرپس ویروسی است که باعث عفونت پایدار در افراد شده و بیماریهای شدیدی را در جنین و افراد مبتلا به نقص سیستم ایمنی ایجاد میکند. اگر چه hcmv به عنوان یک ویروس عامل در سرطانهای انسانی شمرده نمیشود، مطالعات جدید نشان می دهد عفونت با hcmvممکن است به طور اختصاصی باعث بعضی از سرطانهای انسانی از جمله گلیوما باشد.گلیوما یکی از شایعترین سرطانهای مغزی است که در کودکان و بزرگسالان دیده می شود و دارای 4 grade است. در این پژوهش در راستای شناسایی و تشخیص عفونت با ویروس سایتومگال انسانی (hcmv) در نمونههای گلیومای مغزی، روش real-time pcr و ihc راهاندازی شد و مورد استفاده قرار گرفت. مواد و روشها: نمونه های پارافینه تومور مغزی گلیوما از بیماران مراجعه کننده به بخش جراحی اعصاب بیمارستان امام خمینی انتخاب و به قطعات 5 میکرومتری برش داده شدند. از این قطعات برای استخراجdna و انجام ihc استفاده شد. از آنتی بادیpp65 و ie72-86 سایتومگالوویروس انسانی برایihc استفاده شد. پس از طراحی آغازگرهای اختصاصی برای ناحیه us28hcmv اقدام به بهینه سازی و انجام واکنش realtimepcr گردید. نتایج: نتیجه real- time pcr کیفی روی 4 بیمار از 18 بیمار (2/22) مثبت شد.همچنین13نفر از 18 بیمار از نظر pp65 (72 %) و 7 نفر از 18 بیمار (39 %) از نظر ie72-86 سایتومگالو ویروس انسانی مثبت شدند. نتیجهگیری: این اولین مطالعه جهت ردیابی وجود ژنها و پروتئینهای سایتومگالوویروس انسانی در نمونههای مغزی بیماران مبتلا به گلیوما در ایران است.این مطالعه نشان داد که پروتئینهای سایتومگالوویروس انسانی در بیشتر تومورهای مغزی گلیومی بیان میشوند.با توجه به یافتههای این گزارش و گزارشات دیگران مطالعات گستردهتری با استفاده از روشهای دیگر تشخیصی پیشنهاد می گردد.

بررسی میزان بیان ژن های ezh2 و igfbp2 درتومورهای مغزی گلیوبلاستوما مولتی فرم در بیماران ایرانی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه زابل - دانشکده علوم پایه 1392
  نرگس آهنی   محسن کریمی ارزنانی

تومورهای مغزی شایع ترین علت مرگ و میر ناشی از علل نورولوژیک، بعد ازسکته های مغزی هستند. بدخیم ترین و کشنده ترین تومور مغزی، گلیوبلاستوما مولتی فرم (glioblastoma multiforme) (gbm) است. mgb یکی از تومور های سیستم عصبی مرکزی (cns) است که از بافت گلیال مغز نشات می گیرد. بر اساس طبقه بندی سازمان بهداشت جهانی (who)،gbm آستروسیتوما درجه iv می باشد. آستروسیتوما یکی از ? نوع مختلف تومورهای گلیال مغز است. شیوع گلیوبلاستوما مولتی فرم 4 نفر از هر ?????? نفر می باشد و میزان بروز gbm در مردان نسبت به زنان 3 به 2 است. gbm در هر سنی بروز می کند اما در مردان بین 46 تا 52 سال شایع تر از زنان می باشد. سیر کلینیکی این تومور معمولا خیلی سریع است به طوریکه طول عمر این بیماران بدون هیچ درمانی حداکثر سه ماه است و با درمان، میانگین طول عمر بین 12 تا 17 ماه می باشد. دهها سال است که ارتباط بین سرطان وhuman cytomegalovirus (hcmv) موضوع تحقیقات تعداد قابل توجهی از دانشمندان بوده است. تا کنون نقش hcmv در علت بروز بعضی از سرطانها از جمله سرطانهای کلون، سینه و پروستات تایید شده است. سایتومگالوویروس از طریق چند مسیر می تواند در پیشرفت تومور گلیوبلاستوما مولتی فرم نقش ایفا کند. یکی از این مسیرها، pi3-k/akt pathway است که در مطالعه حاضر، بیان ژنهای ezh2و igfbp2 (که بیومارکرهای pi3-k/akt pathway می باشند) در بیماران مبتلا به گلیوبلاستوما مولتی فرم بررسی گردید. به این منظور، پس از گرفتن رضایت نامه کتبی از بیماران قسمتی از تومور آنها در حین عمل جراحی گرفته شد و سپس 2 عمل بر روی این نمونه ها صورت گرفت: 1- استخراج dna از بافت توموری و بافت غیر توموری و بررسی حضور ژنوم ویروس hcmv با استفاده از pcr 2- استخراج rna از بافت های توموری و غیر توموری ، سنتزcdna و انجام real time pcr. در نهایت آنالیز آماری و تفسیر داده ها انجام شد. نتایج حاصل از pcr نمونه های بافت مغزی گلیوبلاستوما مولتی فرم نشان داد که 12 نمونه از 16 نمونه گلیوبلاستوما مولتی فرم، hcmv مثبت بودند و 4 تا از آنها، hcmv منفی بودند و نتایج حاصل از pcr نمونه های بافت مغزی غیر توموری نشان داد که همه آنها hcmv منفی بودند. نتایج به دست آمده از real time pcr نشان داد که : 1. بیان ژن igfbp2 نسبت به ژن gapdh ( کنترل داخلی) در بافت تومور گلیوبلاستومامولتی فرم hcmv منفی 486/5 برابر نسبت به بافت مغز غیر توموری بیشتر است. 2. بیان ژن igfbp2 نسبت به ژن gapdh در بافت مغز تومور گلیوبلاستومامولتی فرم hcmv مثبت 032/15 برابر نسبت به بافت مغز غیر توموری بیشتر است. 3. بیان ژن ezh2 نسبت به ژن gapdh در بافت مغز تومور گلیوبلاستومامولتی فرم hcmv منفی 053/6 برابر نسبت به بافت مغز غیر توموری بیشتر است. 4. بیان ژن ezh2 نسبت به ژن gapdh در بافت مغز تومور گلیوبلاستومامولتی فرم hcmv مثبت 098/41 برابر نسبت به بافت مغز غیر توموری بیشتر است. امید است با استفاده از درمانهای آنتی ویرال و همچنین واکسیناسیون بتوان جلوی پیشرفت تومور گلیوبلاستوما مولتی فرم را گرفت و به این ترتیب بتوان کمک به افزایش طول عمر این بیماران کرد.

بررسی ارتباط میان بیان ژن اوکلودین ومشخصات بالینی و مورفولوژیک بیماران مبتلا به سرطان پستان
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم پایه 1392
  فاطمه گنج زاده   رضا شیرکوهی

چکیده سرطان پستان، دومین شکل شایع سرطان پس از سرطان ریه در جهان بوده و پنجمین علت شایع مرگ در اثر سرطان است. سرطان پستان، رشد مهار نشده ی سلول های غیر طبیعی است که در نواحی مختلف پستان ایجاد می شود. 90% از سرطان ها براثر متاستاز رخ می دهند و غلبه بر اتصالات سلولی بدن از جمله اتصالات محکم یکی از راه های ایجاد متاستاز می باشد. اوکلودین یک پروتئین سرتاسری غشایی می باشد که در محل اتصالات محکم وجود دارد. بدیهی است غلبه بر اتصالات محکم برای ایجاد متاستاز در سلول های سرطانی بسیار با اهمیت است. لذا هدف از این تحقیق بررسی میزان بیان اوکلودین در سرطان پستان انسان بود. در این تحقیق 30 بیمار مبتلا به سرطان پستان مراجعه کننده به انستیتوکانسر بیمارستان امام خمینی پس از اخذ رضایتنامه اخلاقی مورد بررسی قرار گرفتند. ابتدا استخراج rna کمی صورت گرفت و سپس با استفاده از رونویسی معکوس و pcr معمولی وreal time pcr بیان ژن اوکلودین در این بیماران مورد بررسی قرار گرفت. در 30 بیمار مورد بررسی، بیان این ژن در بیماران با گرید و stage بالاتر بیماری و رفتن به سوی تهاجم تومور و مرگ نسبت به حالت کنترل بالاتر رفته است. بنابراین افزایش بیان این ژن را می توان به عنوان یکی از فاکتورهای تاثیر گذار، در تبدیل بافت به سمت سرطانی شدن بدانیم زیرا بیان این فاکتور در افرادی با گرید و stage بالاتر بیماری و رفتن به سوی تهاجم تومور و مرگ، نسبت به حالت کنترل بالاتر رفته است. کلید واژه ها: سرطان پستان، بیان، اوکلودین

بررسی فراوانی موتاسیون ژن cdkn2a در بیماران مبتلا به ملانومای پوستی خانوادگی مراجعه کننده به انستیتوکانسر و بیمارستان تخصصی پوست رازی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم پایه 1392
  سمیرا فردوسی   علیرضا قنادان

سرطان پوست یکی از شایع ترین انواع سرطان ها در سراسر جهان می باشد. سه نوع اصلی سرطان پوست وجود دارد و یکی از آنها ملانوم می باشد. ملانوم خانوادگی در حدود 10-5 درصد از بیماران رخ می دهد که در میان این دسته از بیماران به نظر می رسد حدود 40-35 درصد از مسئولیت انتقال بیماری به دلیل جهش در ژن cdkn2a می باشد، این ژن نقش مهمی در کنترل چرخه سلولی بازی می کند. ژن cdkn2a شامل 3 اگزون می باشد که نتیجه بیان آنها ایجاد دو پروتئین p16 و p14arf می باشد عملکرد p16 و p14 روی هم موثر می باشد و اختلال در بیان هر کدام روی عملکرد و بیان دیگری تاثیر دارد. در نهایت اختلال در بیان آنها موجب ملانوم بدخیم می باشد که این اختلال می تواند به صورت یک حذف یا جهش باشد. باتوجه به اینکه بیشترین آمار مرگ و میر در بیماران مبتلا به سرطان پوست مربوط به این بیماری می باشد و از طرفی دیگر این بیماری در مراحل ابتدایی مانند بسیاری دیگر از انواع سرطان ها قابل درمان است، یافتن بیماران فامیلیال و بررسی خانواده آنان از نظر بررسی ژن های درگیر و غربالگری آنان نقش مهمی در شناسایی افراد پرخطر، پیگیری، تشخیص زودرس و درمان به موقع آنان و در نتیجه کاهش میزان مرگ و میر آنان خواهد داشت. معمولا"روند بررسی جهش در بیماران سرطان فامیلی با استفاده از استخراج dna از خون صورت می گیرد. این روش مطلوب و راحتی است که در آن dna به مقدار کافی برای انجام توالی نوکلئوتیدی استخراج می گردد. از آنجا که بسیاری از بیماران در طول روند غربالگری در دسترس نخواهند بود بنابر این یک روند بر اساس استخراجdna از بلوک های پارافینی بیماران پایه ریزی گردید. dna از 5 نمونه بافت پارافینی و 10 نمونه خون افراد زیر 45 سال به عنوان واجد شرایط ورود به مطالعه استخراج گردید و به روش سنگر توالی یابی انجام شد. تمامی توالی ها با استفاده از نرم افزار کروماز بررسی گردیدند و همگی نتایج توالی نرمال را نشان دادند. هر چند در تمامی نمونه های آزمایش شده جهشی شناسایی نشد ولی کیفیت توالی dna استخراج شده از بافت پارافینی و خون کاملا" مشابه بود. در نتیجه در بیمارانی که در دسترس نیستند می توان از بافت پارافینی استفاده نمود و در صورت مثبت بودن از نظر جهش در دیگر اعضاء خانواده می توان از بافت خون استفاده کرد. برای به دست آوردن درصد قابل اعتماد شیوع جهش نیاز به یک مطالعه آینده نگر 5 ساله می باشد که در حال انجام است.

بررسی بیان mmp2 و mmp11 در تغییر رفتار تهاجمی سلولهای سرطانی در میان بیماران مبتلا به سرطان پستان
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم پایه 1392
  محدثه محب شاهدین   رضا شیرکوهی

سرطان بیماری بسیار پیچیده ایست که اغلب با به هم خوردن تنظیمات هموستاتیک داخل سلول و بین سلول شروع می شود. سرطان پستان در زنان هر ساله بیشترین آمار مرگ و میر ناشی از سرطان را به خود اختصاص می دهد. بیشتر سرطان های پستان از سلول های سنگ فرشی که لوبول ها و مجاری غدد پستانی را مفروش می کنند منشا می¬گیرند. توانایی مهاجرت و هجوم سلول های توموری عامل طبقه بندی آنها به دو دسته خوشخیم و بدخیم است. در بسیاری از موارد بعد از شروع مرحله اول درمان، تومور رفتاری متفاوت یافته و نمی توان ادعا نمود که خطر بیماری به طور کامل ریشه کن شده است. از این رو، پیگیری طولانی مدت جهت بررسی نتیجه درمان و مهار بستر این بیماری مفید می باشد. به همین دلیل امروزه یافتن مارکرهایی جهت ردیابی و پیگیری وضعیت درمان، برای دانشمندان به عنوان یک هدف مطرح است.mmp2 وmmp11 جز خانواده ماتریکس متالوپروتئیناز ها می باشند که پس از فعال شدن در سلول های سرطانی از طریق هضم نمودن ماتریکس خارج سلولی شرایط را برای متاستاز و تهاجم سلول فراهم می آورند. در مطالعه ی حاضربیان دو ژن mmp2 وmmp11 در بافت توموری 30 بیمار مبتلا به سرطان پستان و ارتباط آن با ویژگی های بالینی – آسیب شناسی از جمله اندازه تومور، وضعیت متاستاز، stage و grade با استفاده از تکنیک real-time pcr مورد ارزیابی قرار گرفت. نتایج حاصل از این مطالعه نشان داد که میزان بیان mmp2 و mmp11 با وضعیت متاستاز و اندازه تومور، stage و grade ارتباط مستقیمی دارد(0/05>p). به طور کلی نتایج حاصل از این مطالعه پیشنهاد می کند که mmp2 و mmp11 می توانند به عنوان مارکر ارزیابی وضعیت تهاجمی تومور در پستان مهم باشند. اگرچه مطالعات وسیع تر جهت تائید این موضوع مورد نیاز می باشد.

بررسی بیان انکوژن axl و لیگاند gas6 در بیماران مبتلا به سرطان پستان
thesis دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران شرق - دانشکده علوم انسانی و پایه 1392
  فاطمه امامقلی   رضا شیرکوهی

سرطان پستان یکی از شایع ترین سرطانها در میان زنان می باشد که عوامل مختلفی باعث بروز این نوع سرطان می شود. یکی از عوامل مهم در توسعه و پیشرفت انواع سرطان بخصوص سرطان پستان رسپتورهای تیروزین کینازی می باشد. انواع مختلفی از اعضا خانواده رسپتورهای تیروزین کینازی به عنوان اهداف درمانی به خدمت گرفته می شوند یکی از مهمترین اعضای این خانواده axl می باشد که برروی مسیرهای سیگنالینگ از جمله pi3k ، ras و nf?b و.. تاثیر گذاشته و نقش مهمی در پیشرفت ، تهاجم ، انتقال اپیتلیال به مزاننشیم ، تضعیف بقا و متاستاز و... ایفا کرده و به عنوان یک انکوژن شناخته می شود. تنها لیگاند شناخته شده برای axl , gas6 بوده که با القا فسفریلاسیون به axl باعث فعالسازی آن می شود و بعد از اتصال به رسپتور قادر به انجام فعالیتهای میتوژنیک می باشد.

بررسی 5 ساله ی موارد ابتلا به fap و الگوی وراثتی موارد سندرم گاردنر در این بیماران و خانواده ایشان در انستیتو کانسر بیمارستان امام خمینی تهران
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم پایه 1392
  مهسا غفاری مقدم   صنمبر صدیقی

پولیپوز آدنومایی خانوادگی (fap) با شیوه اتوزومال بارز به ارث می رسذ. سندرم گاردنر که مشتقی از fap است نیز با همن شیوه به ارث می رسد. این بیماری با تعداد زیادی پولیپ در حفره شکمی، چندین استئوما در نواحی کاسه سر و فک و آرواره ها، چندین توده زیرجلدی یا روی پوستی (دسموئید و اپیدرموئید) شناخته می شود که با جهشی در ژن apc واقع در کروموزوم شماره 5 و موقعیت q21 قرار دارد، ایجاد می شود. در این مطالعه ما به دنبال بررسی بیماران مبتلا به سرطان روده ی بزرگ با پولیپ های آدنومایی و سابقه ی فردی یا خانوادگی تومورهای دسموئیدی بودیم. یک خانواده به جهت یافتن جهش در ژن apc یا mutyh غربال شد.