به منظور شناسایی ویژگی های مدارس اسلامی در ایران و ارائه الگوی مدرسه اسلامی مطلوب، این پژوهش به روش توصیفی- پیمایشی و با استفاده از ابزارهای گردآوری اطلاعات شامل مصاحبه عمیق، مشاهدات میدانی از امکانات، تجهیزات و کلاس های درس و یادداشت برداری از آن ها و بررسی اسناد، در میان مدارس اسلامی که به صورت کاملاً غیردولتی و زیر نظر موسسات فرهنگی- آموزشی اداره می شوند، اجرا شد. روش نمونه گیری از نوع در دسترس و حجم نمونه 23 مدرسه از تهران، اصفهان و مشهد بود. برای تجزیه وتحلیل داده ها از روش توصیفی و ارائه درصد فراوانی در هر کدام از ویژگی های احصاشده استفاده به عمل آمد. نتایج نشان داد که مدارس اسلامی مورد بررسی دارای ابعادی از جمله: ارتباطات، فوق برنامه و پرورشی، مولفه هایی از قبیل: نمادهای هویتی سازمانی و تنوع برنامه درسی و ویژگی هایی مثل ملاک های خاص گزینش کارکنان و دانش آموزان و تأکید بر تربیت دینی و اخلاقی و اجتماعی و سیاسی دانش آموزان هستند. این ابعاد، مولفه ها و ویژگی های احصاشده در قالب الگوی یک مدرسه اسلامی مطلوب ارائه شد.