هدف از انجام این تحقیق، اندازه گیری سطح بهره وری نیروی کار در شرکتهای داروسازی و شناسایی تفاوت بهره وری آنها و همچنین شناسایی عوامل موثر بر بهره وری نیروی کار شرکتهای داروسازی می باشد. برای بررسی نقش عوامل تعیین کننده از روش اقتصاد سنجی پانل دیتا استفاده شد. در ضمن از نرم افزار eviews, ver7 برای تخمین مدلها استفاده شد. جامعه آماری شامل صنعت داروسازی کشور است که 20 شرکت پیشگام در صنعت داروسازی فعال در بورس اوراق بهادار کشور در دوره زمانی 89-79 به عنوان نمونه انتخاب شده است. برای شناسایی علل تفاوت بهره وری بین بنگاه ها. به لحاظ آمار و ارقام، شرکتها با هم مورد مقایسه قرار گرفتند بر طبق نتایج تحقیق مبنی بر رابطه مثبت متغیرهای عنوان شده، شرکت اکسیر در همه زمینه ها جزء شرکت های برتر بوده است و بالاترین بهره وری نیروی کار را از میان 20 شرکت به خود اختصاص داد. همچنین دلایل پایین بودن بهره وری نیروی کار در شرکت تولید دارو، پایین بودن شاخصهای فناوری، سرمایه انسانی و مدیریتی است. برآورد مدل اصلی تحقیق با استفاده از روش اثرات تصادفی نشان داد که ارتقای سرمایه انسانی، سرمایه فیزیکی سرانه، افزایش سهم صادرات از ارزش افزوده، خصوصی بودن مالکیت بنگاه و ارتقای سرمایه تحقیق و توسعه موجب افزایش بهره وری نیروی کار در صنایع داروسازی می شود. از میان متغیرهای مورد بررسی، سرمایه تحقیق و توسعه دارای بیشترین تاثیر بر بهره وری نیروی کار و متغیر اندازه بنگاه دارای کمترین تاثیر بر بهره وری نیروی کار در صنایع داروسازی است. بر طبق نتایج بدست آمده فرضیات تحقیق مورد آزمون قرار گرفت، نتایج گویای آن است که هیچ یک از فرضیات تحقیق رد نمی شود، به عبارت دیگر نتایج اثر مثبت سرمایه تحقیق و توسعه، سرمایه فیزیکی و سرمایه انسانی بر بهره وری نیروی کار را تایید می نماید.