باکتری کلستریدیوم پرفرینجنس جزئی از فلور طبیعی روده انسان و حیوانات است، اما به دلیل تولید توکسین ها و آنزیم های مختلف، عامل بیماریزایی در انسان و گونه های مختلف حیوانات است. این باکتری براساس تولید چهار توکسین اصلی به پنج تیپ مختلف تقسیم می شود که هر کدام بیماری خاصی را ایجاد می کنند. هدف از انجام این مطالعه تعیین درصد تیپ های مختلف کلستریدیوم پرفرینجنس با استفاده از روشهای نوین مولکولی است. در این مطالعه 122 نمونه به طور تصادفی از مرغداری های اطراف کرمان گرفته شد. کلونی های حاصل از کشت نمونه ها از نظر شکل ظاهری و رنگ آمیزی گرم بررسی شدند. پس از خالص سازی با استفاده ازآزمون های بیوشیمیایی گونه های آنها شناسایی شد. تقریبا از 86/77 درصد کل نمونه ها گونه های مختلف باکتری کلستریدیوم جدا شد که عبارت بودند از: باکتری های کلستریدیوم پرفرینجنس، کلستریدیوفرم، لپتوم، باراتی، نوآی، سابترمینس،celatum و chauvoeri. همچنین 63/52 درصد از کل کلستریدیوم های جدا شده از نوع پرفرینجنس بود که نشان دهنده اهمیت بیشتر این گونه باکتری در طیور می باشد. پس از استخراج dna جهت تعیین تیپ، واکنش multiplex pcr با پرایمرهای اختصاصی هر تیپ انجام گردید. تمامی باکتری های کلستریدیوم پرفرینجنس جدا شده از نوع تیپ a بودند. در این تحقیق، پراکندگی باکتری کلستریدیوم پرفرینجنس در بخش های مختلف روده بررسی شد. نتایج حاصل نشان داد، پراکندگی این باکتری در بخش ژوژنوم- ایلئوم نسبت به سکوم بیشتر است. با توجه به نتایج حاصل از این تحقیق، کلستریدیوم پرفرینجنس شایع ترین گونه کلستریدیوم در روده طیور بود که نشان دهنده اهمیت بیشتر این باکتری در طیور می باشد.