امروزه بزرگترین مشکلی که بانکداری الکترونیکی با آن مواجه است و سبب نگرانی می شود، اعتماد و امنیت در تراکنش های آنلاین است. در واقع اعتماد و امنیت، توانمندساز های کلیدی جامعه اطلاعاتی و به ویژه اولین و مهمترین الزامات مورد نیاز در سیستم های بانکداری الکترونیکی می باشند. برای مشتریان سهولت استفاده از خدمات بانکداری الکترونیکی این است که آنها اطمینان کنند که خدمات آنلاینشان ایمن و با قابلیت اعتماد است. به طور مشابه برای بانک ها هم که اینگونه خدمات را ارائه می کنند، اطمینان در امنیت تراکنش های آنلاین امری ضروری محسوب می شود. در این پایان نامه مروری بر انواع مکانیزم های امنیتی موجود در سیستمهای بانکداری الکترونیکی داشته و به بررسی و مقایسه نقاط ضعف و قوت آنها پرداخته خواهد شد. پس از آن بیان می گردد که یک مدل کارای امنیتی در بانکداری الکترونیکی شامل چه مکانیزم هایی می باشد. با توجه به نتایج حاصله سعی بر آنست که مدل امنیتی جدیدی در بانکداری الکترونیکی ارائه گردد. مدل ارائه شده مبتنی بر بکارگیری امنیت در سه لایه شبکه، انتقال و کاربرد بوده و مکانیزم های امنیتی مختلفی در هر لایه اجرا می شود. نشان داده شده است که امنیت چند لایه برای حفظ اطلاعات محرمانه مشتریان در بانکداری اینترنتی بسیار کاراتر خواهد بود. مقایسه نتایج نشان می دهد که مدل پیشنهادی اعتماد و امنیت را در تراکنش های بانکداری اینترنتی افزایش می دهد.