جهان واقع برای پیش بینی و کنترل به گونه ای که ما انتظار داریم ، بسیار پیچیده است و نگاه جزء نگر با مستقل فرض کردن بسیاری از پدیده ها ، قادر به درک کلیت و پیچیدگی مسائل نخواهد بود.استفاده از ابزارهای علمی مناسب می تواند ارائه کننده ی اطلاعات مفیدی برای مدیریت جهت تصمیم گیری به منظور بهبود شیوه های انجام عملیات و به کارگیری منابع باشد که یکی از این ابزار های علمی روش پویایی شناسی سیستم است . ازین رو در این پژوهش بر اساس مراحل متدولوژی پویایی شناسی سیستم و با بهره مندی از نظرات خبرگان به شناخت روابط علی میان عوامل موثر در بهبود خدمات گمرک پرداخته شده است . بطوریکه با دانستن این روابط،تخصیص منابع و اولویت دهی به فعالیت ها به شکلی انجام می پذیرد که با تاثیر بر سایر عوامل بهترین نتایج را به دنبال داشته باشد،سپس با اعتبار سنجی و تایید خبرگان مدل علت و معلولی برای بهبود خدمات گمرک ارائه شده است . ابزار گردآوری اطلاعات در این تحقیق،پرسشنامه و مصاحبه می باشد و برای تجزیه و تحلیل ، جمع بندی و نتیجه گیری پرسشنامه از روش ها و آزمون های آمار توصیفی ، استنباطی (آزمون ساین ، آلفای کرونباخ و آزمون تی ) استفاده شده است . این پژوهش از رویکرد پویایی سیستم به عنوان روشی برای غلبه بر محدودیت های سایر پژوهش ها و راه کارهای ارائه شده در زمینه ی بهبود خدمات گمرک بهره برده است .