تصمیمگیری جهت به کار بردن مناسبترین سیستم نمکزدایی، بستگی به پارامترهای متعددی دارد. به همین جهت، انتخاب بهترین روش ممکن برای شرایط خاص مورد نظر، امری پیچیده است. انتخاب سیستم بهینه، متکی بر یک سری تحلیلهای مفهومی و سپس تحلیل اقتصادی میباشد. در این پایان نامه، معیارهایی معرفی شده است که در انتخاب بهترین روش ممکن در هر شرایط خاص تاثیر گذارند. سپس به تشریح فرایند تحلیل سلسله مراتبی(ahp) پرداخته و با استفاده از این تکنیک و نرم افزار expert choice، بر اساس معیارهای معرفی شده برای تهیه آب شرب، اقدام به یافتن سیستم نمکزدایی بهینه برای نیروگاه سیکل ترکیبی قشم شده است و روش msf که یکی از روشهای حرارتی است، با اختصاص 0.248 بعنوان سیستم بهینه معرفی گردیده است. با بومی شدن روش ro شاهد کاهش هزینه های اجرا و نگهداری این روش خواهیم بود که به طبع رقابت نزدیکی با روش msf خواهد داشت.