نام پژوهشگر: مریم بادبر

بررسی تنوع ژنتیکی populus alba و populus caspicaدر مناطق غرب جنگل های هیرکانی ایران با استفاده از مارکر مولکولی trnl-f
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران - دانشکده علوم پایه 1391
  مریم بادبر   اباصلت حسین زاده کلاگر

سفیدپلت، بومی جنگل های هیرکانی شمال ایران است، که شباهت ریختی بسیاری با سپیدار دارد. هدف این تحقیق بررسی تنوع ژنتیکی populus alba و populus caspicaدر مناطق غرب جنگل های هیرکانی با استفاده از نشانگر مولکولیtrnl-f است. برای این منظور 12 نمونه برگی شامل 10 نمونه سفیدپلت و 2 نمونه سپیدار از 5 رویشگاه مختلف جمع آوری شدند. dnaی ژنومی از برگ نمونه ها با استفاده از ctab و sds- پتاسیم استات استخراج گردید. محصولات pfu-pcrی از قطعه trnl-f تکثیر شده توالی یابی شدند. نتایج نشان داد که تعداد نوکلئوتید های منطقه trnl-f تقریبا برای جمعیت های هر دو گونه در حدود 392 الی 394 نوکلئوتید بود. در بررسی حضور انواع نوکلئوتیدها، مقدار نوکلئوتید آدنین در سفیدپلت و سپیدار بیش تر و در نمونه های بانک ژن، نوکلئوتید تیمین بیش تر در ترکیب نوکلئوتیدی آن ها مشاهده گردید که تا حدی نشان دهنده تشابه حضور نوکلئوتیدی سفیدپلت و سپیدار است. پس از ردیف سازی توالی های هر دو گونه، ترسیم درخت فیلوژنی بر اساس نشانگر trnl-f انجام گرفت، نتایج نشان داد اگر چه این دو گونه با داشتن تفاوت های کم مورفولوژیکی دارای تفاوت کمی نیز در منطقه غیر کد کننده کلروپلاستی trnl-f شان هستند ولی این نشانگر کلروپلاستی تفاوت قابل ملاحظه ای را بر اساس مقادیر و درصد حضور نوکلئوتیدها و میزان جهش های منطقه trnl-f در میان این دو گونه نشان نمی دهد. در این مطالعه تک نیایی بودن سفیدپلت و سپیدار معین گردید و هم چنین مشخص شد که صنوبر بومی جنگل های هیرکانی، سفیدپلت، به بخش پوپولوس متعلق بوده و از میان گونه های موجود در این بخش، این گونه بیشترین قرابت ژنتیکی را با سپیدار دارد. اما در بین نمونه های مورد بررسی، دو نمونهsc1 و rh2، با قرار گرفتن در گروهی مجزا، دارای الگوی نوکلئوتیدی متفاوت تر و فاصله ژنتیکی بیش تری با گونه سپیدار و سایر سفید پلت ها بودند، که این امر می تواند در نتیجه هیبریداسیون وسیع و درون گونه ای بین صنوبرها باشد که به عنوان یکی از عوامل مهم و مشکل آفرین در شناسایی دقیق بین صنوبرها مطرح می باشد. از این رو به منظور تفکیک تاکسونومیکی بین این دو گونه انجام مطالعات بیش تر با نشانگر های هسته ای و یا کلروپلاستی پیشنهاد می گردد.