در این پژوهش ساختار مولکولی و انرژی پیوند هیدروژنی درون مولکولی 26 صورت بندی 3-آمینو-پروپن سلنال(aps) در سطوح محاسباتی b3lyp و mp2 با تابع پایه 6-311++g** و سطح g2mp2 به منظور تعیین مرتبه ی پایداری صورت بندی ها و امکان تشکیل پیوند هیدروژنی درون-مولکولی مختلف بهینه شده است. نتایج محاسبات در فاز گاز و آب نشان می دهد که صورت بندی های 3-آمینو-پروپن سلنال(aps) این ترکیب پایدارتر از بقیه هستند. این پایداری عمدتاً ناشی از تشکیل پیوند هیدروژنی درون مولکولی n-h…se است،که به وسیله رزونانس الکترون های ? کمک می شود. انرژی پیوند هیدروژنی برای صورت بندی های دارای پیوند هیدروژنی از روش های rrm، شوستر و اسپینوزا به دست آمده است. هم چنین اثر استخلاف های f، cl، br، cn، sh، sch3، oh، ch3، c2h5، ph، phoch3، cf3، ch2ch2oh،ch2cl ، ch2cooh، scf3، ochf2، ch2cf3 و ch2och3 در موقعیت r2 در ترکیب aps بررسی شده و سپس اثر هر کدام از این استخلاف ها بر روی قدرت پیوند هیدروژنی مطالعه شده است. مقادیر شاخص های مختلف آروماتیسیتی نظیر flu، flu?، ati، pdi، homa و nics برای تمامی استخلاف ها در موقعیت r2 به دست آمده است .طبیعت پیوند هیدروژنی درون مولکولی در صورت بندی های مختلف 3-آمینو-پروپن-سلنال و ترکیبات استخلاف دار شده آن به کمک محاسبات توپولوژیکی(aim) و نظریه اوربیتال های ظبیعی(nbo) تجزیه و تحلیل شد. در بخش دیگری از این پژوهش سدهای فعال سازی برای چرخش داخلی حول زاویه h-n-hدر صورت بندی aps و استخلاف های آن در فاز گاز و آب با استفاده از تئوری تابعی چگال(dft) با مجموعه پایه 6-311++g** محاسبه شد. در نهایت، برای واکنش های انتقال پروتون، محاسباتی پیرامون حالت گذار انجام و ساختارهای حالت گذار بهینه گردید. سپس انرژی فعال سازی، فاکتور فرکانس، ثابت سرعت و پارامترهای ترمودینامیکی حالت گذار محاسبه شد.