نام پژوهشگر: سجاد احراری
سجاد احراری نوید مقرب
پروتئین مارک2 به ابرخانواده پروتئین کینازها تعلق دارد. این پروتئین نقش بسیار مهمی در تنظیم فعالیتهای حیاتی سلول همچون ایجاد قطبیت، تنظیم اتصالات سلولی، تنظیم اسکلت سلولی و تمایز سلول ایفا میکند.کارکرد نامناسب این پروتئین در حالتهای پاتولوژیکی چون بیماری آلزایمر، آتیسم، برخی سرطانها و توسعه بیماریزایی توسط هلیکوباکتر پیلوری، گزارش شدهاست. درک جزئیات ساختاری این پروتئین و بویژه جزئیات حرکتی آن در عبور از حالت غیر فعال به فعال، گامی مهم در توسعه درمانهای اختصاصی و موثر بر علیه رفتارهای بیماریزای این پروتئین به شمار میآید. در این مطالعه تلاش نمودیم تا با استفاده از تکنیک شبیهسازی دینامیک مولکولی و با تبدیل باقیمانده ترئونین 208 به گلوتامات، که یک موتاسیون فعالساز در جهت کارکرد آنزیم به شمار میآید، رفتار آنزیم در مسیر فعالسازی را بررسی نمائیم. نتایج حاکی از آن است که قسمتهای مختلف پروتئین، رفتاری یکنواخت و همسو در جهت فعال شدن مارک2 نشان نمیدهند. بطوریکه نواحی دور از دومین uba و دارای حرکت مستقل از این دومین، اغلب در جهت فعال شدن آنزیم حرکت کردهاند اما نواحی مجاور دومین uba و تحت تاثیر برهمکنش با این ناحیه، رفتاری منظم و در جهت فعال شدن آنزیم مارک2 از خود نشان نمیدهند. این نتایج، همسو با نتایج مطالعاتی است که کارکرد بازدارندگی به دومین uba نسبت دادهاند.
سجاد احراری مجید میرزاوزیری
در این پایان نامه ابتدا مفهومی ازf-متریک به عنوان نگاشتی با فاصله تابع مقدار، روی مجموعه x معرفی می شود و نظریه فضاهای $f$-متریک بررسی میشود. نشان می دهیم که هر فضای متریک می تواند به عنوان یک فضای f-متریک تلقی شود و هر فضای f-متریک می تواند به عنوان یک فضای توپولوژیک در نظر گرفته شود. علاوه بر این نشان می دهیم که رسته ی موسوم به گسترش یافته فضاهای -fمتریک، شامل رسته ی فضاهای متریک است. در ادامه یک فضای fمتریک را معرفی می کنیم که به عنوان مکمل فضای -fمتریک است. به عنوان کاربردی در توپولوژی نشان می دهیم که هر فضای توپولوژیک نرمالf-متریک پذیر است.