ارزیابی ژنتیکی ژن اعاده کننده باروری برای نر عقیمی نوع waدر برنج با استفاده از لاین نر عقیم سیتوپلاسمی ir58025a در ترکیب با آمل- 2 مورد مطالعه قرار گرفت. در این مطالعه تعداد 270 بوته از جمعیت f2 حاصل از تلاقی (آمل- 2 ×a25ir580) به طور تصادفی انتخاب و درصد باروری یا عقیمی این گیاهان مورد مطالعه قرار گرفت. نسبت باروری دانه گرده در گیاهان نسل f2 به صورت 143 گیاه بارور، 61 گیاه نیمه بارور، 55 گیاه نیمه عقیم و 11 گیاه کاملاً عقیم بودند. ارزیابی باروری در جمعیت f2نشان داد که صفت اعاده باروری در رقم آمل 2 توسط 2 ژن غالب کنترل می شود. در این مطالعه تعداد 20 نشانگر ssr و 2 نشانگر sts مورد استفاده قرار گرفت. نشانگرهای ssr پس از دیدن باند مورد نظر در ژل آگارز، جهت تفکیک باندی به ژل اکریل آمید برده شدند. نشانگرهای مورد استفاده ابتدا در والدین (آمل-2 و ir58025a) جهت مشاهده چندشکلی تست شده و در صورت مشاهده چندشکلی، برای امتیاز بندی در جعیت f2 مورد آزمایش قرار گرفتند. در این بررسی، نشانگرهای rm294، rm269، rm258، rm237، rm3510،rm271 ، چندشکلی ندادند و نشانگرهای rm307، rm401، rm311، rm302، rm304، rm490، rm580، rm243، rm23، rm228 و rm244 چندشکلی نشان دادند. مطالعات نشان می دهد که ژن باروری rf3 با نشانگرهای rm243 و rm490 روی کروموزوم یک پیوستگی داشته است و با استفاده از آزمون کای اسکور (18/2 =2x) دو ژنی بودن تأیید می شود. همچنین بررسی ژنتیکی ژن های برگرداننده باروری نشان داد نشانگر مولکولی rg140 با ژن rf3 روی کروموزوم 1 پیوسته می باشد و نشانگر sts (rg140) پیوستگی بالایی با ژن باروری نشان داده و فاصله آن 1 سانتی مورگان بدست آمده است و نشانگر خوبی جهت استفاده در انتخاب به کمک نشانگر به حساب می آید. همچنین فاصله ژن باروری rf4 با نشانگر rm244 روی کروموزوم 10، 7 سانتی مورگان بدست آمده است.