چکیده در این پایان نامه، مطالعات qsar سه بعدی بر روی 2 سری از بازدارنده های کربنیک انهیدراز ? و dhfr انجام شده است. در مطالعه اول قانون تراز شدن برای ترکیبات با دو روش انجام شد.در روش اول تراز شدن با استفاده از الگوریتم دیستیل در مجموعه نرم افزاری sybyl 7.3 تعیین گردید و در روش دوم ابتدا آنالیز الحاق نمودن جهت تعیین جنبه های ساختاری ضروری جهت اتصال بازدارنده ها به گیرنده، پیشگویی صورت بندی فعال زیستی و همچنین تراز نمودن ترکیبات بر روی یکدیگر در سایت فعال پروتئین مورد استفاده قرار گرفت. سپس این ترکیبات دوباره با روش ریجید بر روی هم تراز شدند. در مطالعه دوم، تراز شدن به روش فارماکوفوری انجام شد، سپس مدلسازی کامپیوتری در هر دو مطالعه از طریق روش های کومفا، کومفا – تمرکز میدانی، و کومسیا انجام گرفت. قابلیت پیشگویی خارجی مدل های ساخته شده، از طریق مجموعه آزمون مورد ارزیابی قرار گرفت. همچنین پارامتر های آماری مدل های بدست آمده نشان می دهد که آنها قابلیت پیشگویی خوبی داشته و کاربردی هستند. به علاوه کانتور های سه بعدی حاصل از فرایند مدلسازی، خطوط راهنمای خوبی جهت طراحی بازدارنده-های بسیار فعال را فراهم می آورند. کلمات کلیدی: کومفا، کومفا – تمرکز میدانی، کومسیا، بازدارنده های کربنیک انهیدراز ? ، بازدارنده های dhfr ،الحاق شدن