نام پژوهشگر: سمیه اسفندیاری
سمیه اسفندیاری غلام خداکرمیان
در بهار و تابستان 1389، نمونه های غده و بوته مشکوک به بیماری که دارای علائم بیماری پژمردگی بود از مزارع استان همدان گردآوری شدند. از نمونه های گردآوری شده? مجموعا 78 استرین باکتری r. solanacearum پس از کشت روی محیط pda و محیط کشت حاوی تری فنیل تترازولیوم کلراید ttc به دست آمد، استرین های جدا شده از نظر االگوی لعاب، شکل کلونی دارای تنوع بودند. پس از انجام آزمون بیماری زایی و بررسی ویژگی های فنوتیپی 65 استرین به عنوان باکتری r.solanacearum نژاد 3 بیوار 2 تشخیص داده شدند. تنوع بیماری زایی استرین ها در قالب طرح کاملاَ تصادفی با سه تکرار صورت گرفت و علائم زردی، اپی ناستی، پژمردگی و شادابی ارزیابی شد و آنالیز نتایج به دست آمده بیانگر تنوع بیماری-زایی?با توجه به منطقه جغرافیایی در میان استرین های باکتری بود. بررسی?الگوی پروتئین های محلول سلولی الکتروفورز شده استرین ها روی ژل پلی آکریل آمید تنوع الگوی باندی را بین استرین ها نشان داد و بر این اساس استرین ها در 5 گروه قرار گرفتند. برای بررسی تنوع ژنتیکی استرین های باکتریایی، dnaژنومی آن ها استخراج و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژن hrp ، ژن16srrna و توالی box به روش pcr تکثیر شد. استرین های بررسی شده دارای باند مربوطه بوده و اندازه باند به دست آمده از کاربرد آغازگر های مزبور با گزارش های منابع یکسان بود. آنالیز نتایج حاصل از باندهای ایجاد شده با آغازگرهای box و hrp نشان داد که استرین های جدا شده از مزارع سیب زمینی استان همدان دارای تنوع ژنتیکی هستند و در 6 گروه قرار گرفتند . رابطه ای میان تنوع در الگوی پروتئین و تنوع در الگوی ژنوم استرین ها و منطقه جغرافیایی برقرار نشد. باند dna حاصل از pcr ژن16srrna ، توالی یابی شد و نتیجه آنالیز آن با نرم افزار بلاست در سایت ncbi انجام گرفت.آنالیز نتایج حاصل از توالی یابی نشان داد که استرین es12 همولوژی بالایی(90 درصد) با استرین r.solanacearum strain pa1 16srrna دارد.