در این پایان نامه اثر دما روی پروتیین پلاستوسیانین توسط شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد مطالعه قرار گرفت. در مورد دماهای مورد مطالعه تنها تغییرات معنی دار مربوط به منحنی rmsd و rg در دمای 453k مشاهده شد. در این دما, met 92 پایداری کمتری نسبت به سایر باقیمانده ها دارد.نواحی با انعطاف پذیری زیاد مربوط به باقیمانده های 40-56 می باشد. سه حالت شامل حالت طبیعی , واسطه و حالت غیر طبیعی شده و همچنین 2 حالت گذار در دمای 453k مشاهده گردید. آنالیز ساختار دوم نشان داد که اولین حالت گذار شبیه به حالت طبیعی بوده در حالیکه دومین گذار شباهت زیادی به حالت غیرطبیعی دارد.

چکیده: انتقال پروتون، بین شاخه های جانبی اسید آمینه در محاسبات تیتراسیون پروتئین و محاسباتpka پروتئین، نقش دارند لذا دانستن مکانیسم انتقال پروتون بین شاخه های جانبی اسید های امینه از اهمیت خاصی برخوردار است. در این تحقیق با استفاده از روشهای محاسباتی (روش b3lyp وتابع پایه 6-311++g** ) مکانیسم انتقال پروتون و تشخیص حالت وا سط بین اسیدآمینه های هیستیدین، وآسپارتیک اسید، مورد بررسی قرار گرفت،و ویژگیهای ساختاری که شامل طول و زوایای پیوندی مولکولهای مذکور می باشد، بدست آمد. و همچنین با استفاده از محاسبات ترمودینامیکی، ثابتهای سرعت و ثابت تعادل در فاز گاز و محلول وهمچنین pka بدست آمد. کلمات کلیدی: هیستدین،آلانین، آسپارتیک اسید، انتقال پروتون، dft ،b3lyp

چون انتقال پروتون بین شاخه های جانبی اسید آمینه در محاسبات تیتراسیون پروتئین ومحاسبات pka نقش دارند، لذا دانستن مکانیسم انتقال پروتون بین شاخه های جانبی اسیدهای آمینه از اهمیت خاصی برخوردار است. در این تحقیق با استفاده از روشهای محاسباتی(روشb3lyp وتابع پایه ?????????) مکانیسم انتقال پروتون وتشخیص حالت واسطه بین اسید آمینه های لیزین وگلوتامیک اسید مورد بررسی قرار گرفت و ویژگیهای ساختاری که شامل طول وزوایای پیوند مولکولهای مذکور می باشد به دست آمد. همچنین با استفاده از محاسبات ترمودینامیکی ،ثابت های سرعت در فاز گاز و محلول و همچنین مقدارpka به دست آمد.

در کار حاضر فرمالدئید به عنوان یک آلوده کننده ی سمی در آبهای خلیج چابهار به روش میکرو استخراج مایع - مایع پخشی مورد انداز ه گیری قرار گرفته است در این کار از دستگاه اسپکتروفتومتری برای اندازه گیری استفاده شده است که از نظر هزینه مناسب می باشد شرایط انجام واکنش در آب دریای مصنوعی بهینه سازی شد و نتایج با دستگاه اسپکترو فتومتر گزارش شد که مقدار ماکسیمم طیف در 405 نانومتر ظاهر شد .برای انجام استخراج مخلوطی از 1 میلی لیتر از متانول به همراه 80 ماکرو لیتر از کلروفرم به عنوان حلال استخراجی به سرعت به داخل نمونه ی حاوی اب دریا تزریق شد و بعد از تزریق فاز رسوبی به وسیله ی دستگاه اسپکتروفتومتر اندازه گرفته شد نمودار کالیبراسیون در محدو ده ی 100-0/1 رسم شد و lod=0/02 و loq=0.08 نانو گرم بر میلی لیتر گزارش شد.روش میکرو استخراج مایع - مایع پخشی یک روش ساده و سریع و ارزان و با حساسیت بالا میباشد