در بررسی علل اختلافات ثبتی می توان گفت: 1-اختلافات ثبتی بین افراد و اداره ثبت در جریان عملیات مقدماتی ثبت، بر سر قبول یا عدم قبول تقاضای ثبت یا به صورت اعتراض بر نظریه رئیس ثبت ایجاد می شود. 2- در مواقعی که در اثر حوادث غیر مترقبه که آثار اعیان املاک و مدارک ثبتی از بین رفته، بین اشخاص در تصرف یا مالکیت اختلاف حاصل شود. 3-موقع تعیین وضع ثبتی اعیان املاکی که اشخاص تا تاریخ 1/1/1370 بر روی زمینها ایجاد کرده و نتوانسته اند به واسطه موانع قانونی سند رسمی دریافت دارند، بین اشخاص در تصرف اختلاف ایجاد شود. 4- به منظور صدور سند مالکیت املاک واقع در بافت مسکونی روستاها، در مالکیت و تصرف اشخاص اختلاف باشد.5- نسبت به املاک مجهول المالک که به زارعی واگذار می شود ، اختلافاتی در تحدید حدود قطعات تقسیم شده ایجاد شود. همچنین در بررسی موارد اشتباهات ثبتی:اشتباهات ممکن است 1- در جریان عملیات مقدماتی ثبت 2-در مرحله قبول تقاضای ثبت 3-در ثبت ملک 4- صدور سند مالکیت5- در جریان تفکیک املاک 6-در تنظیم اسناد رخ دهد. مراجع رسیدگی به این اختلافات و اشتباهات ثبتی:1- هیأت نظارت موضوع ماده 6 ق.ث 2-هیأت حل اختلاف موضوع ماده 5 قانون نحوه صدور اسناد مالکیت املاکی که اسناد ثبتی آنها از بین رفته اند3- هیأت حل اختلاف مواد 147 و 148 4-هیأت حل اختلاف موضوع بند 2 ماده 140 قانون برنامه سوم توسعه اقتصادی، اجتماعی و فرهنگی 5- هیأت تشخیص موضوع ماده 145 ثبت اسناد و املاک است