نام پژوهشگر: علی‌اصغر کارخانه

استخراج و تخلیص لکتین از قارچ خوراکی دکمه یی (agaricus bisporus) و بررسی فعالیت هماگلوتینینی آن در مقابل سلول های گروه های خونی abo
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک وزیست فناوری 1390
  هانیه خورشیدی   کمال الدین حق بین

لکتین ها، پروتئین های غیرآنزیمی با منشأ غیر ایمونوگلوبولینی هستند که به طور اختصاصی و برگشت پذیر به بخش های کربوهیدراتی گلیکوپروتئین ها و گلیکولیپید ها متصل می شوند بدون این که ساختار کووالان لیگاند های گلیکوزیله را تغییر دهند. لکتین ها معمولاً از گیاهان به دست می آیند ولی در انواع مختلف جانوری نیز دیده شده اند. با توجه به افزایش کاربرد لکتین ها در بیوحسگرها و نیز در تشخیص های اختصاصی، استخراج و تخلیص لکتین به خصوص از یک منبع ارزان و در دسترس، می تواند برای اهداف گفته شده، مناسب باشد. طبق ادبیات علمی موجود، قارچ خوراکی دکمه ای حاوی نوعی لکتین به نام abl (agaricus bisporus lectin) می باشد. پروتئین abl، تترامری با وزن مولکولی kda 64 است (kda 16 برای هر مونومر) و به صورت 4 ایزوفرم i و ii و iii و iv در این قارچ وجود دارد که تمایل قندی همگی مشابه گزارش شده است. از طرفی همین نوع قارچ، تنها منبع مناسب برای آنزیم تایروزیناز نیز می باشد که چنان چه بتوان در کنار آن و با حفظ بازده فعالیتش، لکتین را نیز استخراج کرد، دو محصول بیولوژیکی مفید از این قارچ به دست خواهد آمد. در این تحقیق سعی شده است که با در نظر گرفتن ادبیات علمی معاصر در خصوص abl، روشی ساده و مقرون به صرفه، برای جداسازی همزمان لکتین و تایروزیناز از قارچ خوراکی دکمه ای مورد تحقیق قرار گیرد. بنابراین، روش هایی مانند رسوب دهی مرحله ای پروتئین ها با آمونیوم سولفات، حلال های آلی یا تغییر ph و کروماتوگرافی ژل فیلتراسیون مورد مطالعه قرار گرفتند. نتایج این آزمایشات نشان داد که صرفاً با به کارگیری کروماتوگرافی غربالی بر روی ستون sephadex g-75 برای پروتئین های رسوب داده شده با کمک استن در دامنه بین %50 تا 4 برابر از آن، می توان از عصاره پروتئین های سیتوپلاسمی قارچ خوراکی دکمه ای تا 80% لکتین را از تایروزیناز جدا نمود. این آزمایشات همچنین نشان داد که سرعت هماگلوتیناسیون گلبول های قرمز با آنتی ژن های (o) و (b) در مقایسه با (a)، در حضور غلظت ثابتی از abl، نسبتاً کندتر می باشد. تحقیقات برای افزایش درصد تخلیص این دو پروتئین و همچنین یافتن شرایط مناسب برای افزایش انتخاب گرائی abl بر روی گلبول های قرمز ادامه دارد.

بررسی تنوع میکروبی محیط اطراف معدن کرومیت فرومد در استان سمنان به روش متاژنومیکس
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1391
  معصومه سادات موسوی ملکی   باقر یخچالی

دانش تنوع زیستی با بررسی گوناگونی جمعیت های میکروبی، شناسایی آن ها و ارائه ی ذخیره ی ژنومی جدید امکانات مناسبی برای زیست فناوری فراهم می کند. علی رغم تعداد زیاد میکروارگانیسم ها دانش بشری تنها نسبت به بخش بسیار کمی از آن ها آگاهی دارد. چرا که شناسایی اکثریت آن ها به دلیل محدودیت های روش کلاسیک از جمله کندی و غیر قابل کشت بودن بسیاری از باکتری ها امکان پذیر نیست. معادن فلزی از جمله محیط های دارای شرایط سخت برای زندگی میکروارگانیسم ها می باشند و به همین دلیل منابع جذابی برای بررسی تنوع میکروبی موجود هستند. امروزه تاکسونومیک بر اساس تحلیل توالی های dna ژنومی وهمچنین توالی ژن 16s rrnaسریعتر و ارزانتربوده و تصویر نسبتاً کامل تری از اجتماعات میکروبی فراهم آورده و رابطه ی فیلوژنی بین آن ها را مشخص می سازد. از این رو در این پژوهش با استفاده از روش متاژنومیکس تنوع میکروبی محیط معدن کرومیت فرومد بررسی شد. پس از نمونه برداری از مناطق مختلف معدن و استخراج dna ، ژن 16s rrna با پرایمرهای مخصوص تکثیر و پس از کلونینگ محصول pcr در حامل پلاسمیدی، کتابخانه ی ژنی 16s rrna ساخته شد. کلون های حاوی dna خارجی بوسیله pcr غربال شدند. سپس 107 کلون (43?) بصورت تصادفی انتخاب و تعیین توالی شدند. از نظر فیلوژنتیک توالی های باکتری در جنس های thermosynechococcus , adhaeribacter ,cedecae ,rheinheimera ,phycisphaera polaromonas, curvibacter, aguabacterium, ralstonia, limnobacter, acidovorax bradyhizobium, runella, algoriphagus, sporocytophaga, rubrimanas, oscillatoria blastocatella , erythromicrobiom, pseudoxanthomonas, silanimonas, anaerobacillus, pseudomonas, georgfuchsia, opitutus, flavobacterium , sphaerobacter ,koribacter, delftia hydrogenophaga, arthrobacter, bosea, gemmatimonas, desulfotomaculum, و توالی های آرکی در جنس nitrososphaera قرار گرفتند. جنس های rheinheimera و cedecae غالب بودند. 27 سویه شباهت بالاتر از 98.7 درصد و 59 سویه شباهت کمتر از 98.7 درصد با سویه ی استاندارد ثبت شده داشتند که این 59 سویه می تواند معرف تاکسون های جدید باشند. بر اساس نتایج بدست آمده از این پژوهش باوجود فراوانی کم سویه های شناسایی شده محیط معدن کرومیت فرومد از تنوع میکروبی بالایی برخوردار می باشد.