ماهی کفال طلایی از گونه های تجاری ارزشمندی است که در نواحی جنوبی دریای خزر به علت طعم خوب گوشت دارای تقاضای زیادی می‏باشد. شناخت تنوع ژنتیکی منابع دریایی اهمیتی حیاتی در مدیریت و حفاظت از آنها دارد زیرا این مسئله اولین پیش نیاز برای حفظ سازگاری جمعیت ها تحت شرایط محیطی در حال تغییر است .در این مطالعه از 6 جایگاه ریزماهواره به منظور بررسی تنوع ژنتیکی ماهی کفال طلایی در مناطق گمیشان و میانکاله در استان گلستان، بابلسر و چالوس در استان مازندران و کیاشهر، انزلی و آستارا در استان گیلان با استفاده شد. طبق نتایج حاصله میزان fst در محدوده 010/0-054/0 به دست آمد که نشان از تمایز ژنتیکی پایین جمعیت های مورد نظر می باشد. نمونه های مورد بررسی در اکثر لکوس ها انحراف از تعادل هاردی- واینبرگ را نشان دادند که دلیل ان را می توان به کاهش هتروزایگوسیتی نسبت داد. تعداد الل ها در محدوده 26 – 11 و هتروزایگوسیتی مشاهده شده و مورد انتظار به ترتیب در دامنه464/0-911/0 (میانگین: 732/0) و 856/0-900/0 (میانگین: 885/0) به دست آمد. که این مطلب نشان دهنده، تنوع ژنتیکیاین گونه در سطح مطلوب می باشد. همچنین طبق نتایج به دست آمده به نظر می رسد بیش از یک جمعیت در سواحل جنوبی دریای خزر وجود دارد.محافظت و بازسازی زیستگاه ها می تواند به افزایش اندازه جمعیت و کاهش خطر آسیب پذیری این گونه در آینده کمک کند.