در این تحقیق برای تحلیل عملکرد کانال اصلی شیب آب و پشت آب با استفاده از مدل hec-ras سه سناریوی مختلف مدیریت بهره برداری در کانال اصلی شیب آب و پشت آب بررسی گردید. نتایج شبیه سازی سناریو های مختلف نشان می دهد که بدون مدیریت بر روی سازه های کنترل جریان امکان تخصیص مناسب دبی به کانال های درجه 2 مستقر در طول کانال اصلی شیب آب و پشت آب میسر نمی باشد و خطای نسبی کل تحویل جریان به این کانال ها در شرایط نرمال مورد بررسی برابر53 درصد می باشد. با اعمال مدیریت بر روی سازه های آب بند و آبگیر کانال اصلی شیب آب و پشت آب خطای نسبی کل تحویل جریان به 14 درصد کاهش می یابد. نتایج تحقیق بیانگر آن است که سازه آببند شماره یک شیب آب بدلیل موقعیت نامناسب نصب، دارای عملکرد پایینی می باشد. پیشنهاد می گردد با توجه به توانایی خوب نرم افزار hec-ras در شبیه سازی عملکرد سازه های کنترل جریان و سطح آب در شبکه های آبیاری، از این نرم افزار برای شبیه سازی سایر شرایط محتمل جریان در رودخانه سیستان استفاده گردد.