در این تحقیق از داده های مرکز اصلاح نژاد دام کشور طی سال های88-84استفاده گردید. فایل های تولیدی شامل گله های 3 بار و 4 بار دوشش در روز بودند که به منظور بررسی رابطه دفعات دوشش با شمار سلول های بدنی ومقدار پروتئین شیر با استفاده از مدل روزآزمون و تابعیت تصادفی مورد مقایسه قرار گرفتند. گله های سه بار دوشش شامل 185720 رکورد، سلول های بدنی (سوماتیک سل) بود وراثت پذیری 06/0و تکرارپذیری35/ برآورد گردید0 وبرای پروتئین با تعداد رکورد 275285 وراثت پذیری و تکرار پذیری به ترتیب 19/0و39/0و در گله های 4 بار دوشش برای سوماتیک سل با 27358 رکورد برآورد وراثت پذیری و تکرار پذیری به ترتیب 10/0و39/0 و4 بار پروتئین با 32639 رکورد وراثت پذیری و تکرار پذیری به ترتیب 34/0 و 46/0 برآورد گردید.همچنین میانگین واریانس فنوتیپی،ژنتیکی افزایشی ،محیطی دائم و باقیمانده برای سوماتیک سل در 3 بار دوشش به ترتیب 19/0، 08/0، 30/0، 021/0 و برای 4 بار دوشش به ترتیب16/0 ، 07/0 ، 36/0، 029/0 بود برای پروتئین نیز برای 3 بار به ترتیب 084/0، 018/0، 16/0، 050/0 و برای 4 بار نیز به ترتیب 064/0، 021/0، 0087/0، 032/0 برابر برآورد گردید.مقایسه میانگین رکوردهای روزآزمون روزهای شیردهی سوماتیک سل برای 3 بار و 4 بار دوشش نشان داد که افزایش دفعات دوشش از 3 بار به 4 بار تاثیری در کاهش سوماتیک سل و سلامت پستان نداشت. در مورد پروتئین هم افزایش دفعات دوشش از 3 بار به 4 بار تاثیری نداشت.

در این تحقیق به منظور برآورد اثر دفعات دوشش بر روی تولید شیر و چربی و همچنین شکل منحنی شیردهی گاوهای هلشتاین ایران از 374170 رکورد روزانه تولید شیر و چربی مربوط به 54580 حیوان از 205 گله جمع آوری شده توسط مرکز اصلاح نژاد دام کشور که طی سال های 1386تا 1388 جمع آوری شده بودند استفاده گردید. میزان وراثت پذیری و تکرار پذیری برای تولید شیر در گاوهای 3 بار دوشش به ترتیب 19/0 و 73/0 و برای گاوهای 4 بار دوشش به ترتیب 25/0 و 67/0 و برای تولید چربی در گاوهای 3 بار دوشش به ترتیب 11/0 و 33/0 و در گاوهای 4 بار دوشش 14/0 و 35/0 بود همچنین میزان واریانس فنوتیپی، ژنتیکی، محیطی دائم و خطا برای تولید شیر در گاوهای 3 بار دوشش به ترتیب 62/87، 44/18، 61/46 و 57/22 و در گاوهای 4 بار دوشش به ترتیب 43/59، 78/15، 84/23 و 8/19 و برای تولید چربی مقادیر این پارامترها در گاوهای 3 بار دوشش به ترتیب 11/0، 011/0، 024/0 و 072/0 و برای گاوهای 4 بار دوشش به ترتیب 11/0، 015/0، 025/0 و 07/0 بود. نتایج این تحقیق نشان داد از نظر تولید در کل دوره شیردهی و در پیک تولید گاوهای 4 بار دوشش به ترتیب 14 و 6/15 درصد شیر بیشتری را نسبت به گاوهای 3 بار دوشش تولید کردند. در رابطه با صفت تولید چربی نیز گاوهای 4 بار دوشش در تمام دوره تولید چربی بالاتری نسبت به گاوهای 3 بار دوشش داشتند به طوریکه در کل دوره تولیدی و پیک تولید به ترتیب 8/12 و 17 درصد چربی بیشتری را نسبت به گاوهای 3 بار دوشش تولید کردند.

برای طراحی صحیح و دقیق برنامه های اصلاح نژادی نیاز به تخمین پارامترهای ژنتیکی صفات اقتصادی در جوامع حیوانی می باشد. لذا در این پژوهش، پارامترهای ژنتیکی صفات اقتصادی بلدرچین سفید انگلیسی برآورد شدند. صفات مورد بررسی شامل اوزان بدن در هنگام تفریخ و هفته های 1، 2، 3، 4 و 5 و نیز صفات لاشه بود. برای این منظور، تعداد 105 جفت بلدرچین مولد بطور تصادفی از جمعیت پایه انتخاب و آمیزش به صورت یک نر با یک ماده در قفس انجام شد. سپس حدود 1200 بلدرچین در طی 5 تفریخ متوالی حاصل از آمیزش های فوق تولید شدند. رکورد برداری انفرادی از اوزان بدن در شش سن تولد، 7، 14، 21، 28 و 35 روزگی و صفات لاشه (شامل اوزان سینه، ران و لاشه) برای نتاج حاصل از آمیزش های فوق انجام شد. اجزای واریانس و کوواریانس صفات فوق به ترتیب با استفاده از مدل های دام تک و دو صفتی و روش حداکثر درستنمایی محدود شده برآورد شدند. برای صفات مورد مطالعه وزن ماده ها بیشتر از نرها و این اختلاف از 11/0 تا 28/12 گرم به ترتیب برای اوزان تولد و پنج هفتگی متغیر بود، در حالی که درصد لاشه نرها بیشتر از ماده ها بود. وراثت پذیری برای اوزان تولد، 7، 14، 21، 28 و 35 روزگی به ترتیب 014/0± 12/0، 06/0± 32/0، 06/0± 30/0، 05/0 ±22/0، 05/0 ± 22/0 و 06/0 ± 25/0 و برای اوزان سینه، ران، لاشه، درصد سینه، درصد ران و درصد لاشه به ترتیب 06/0±26/0، 06/0±28/0، 05/0±28/0، 04/0±127/0، 06/0±19/0 و 03/0±048/0 برآورد شد. بالاترین همبستگی ژنتیکی و فنوتیپی بین اوزان بدن در 28 و 35 روزگی با اوزان ران، سینه و لاشه مشاهده شد. بطور کلی نتایج این بررسی نشان داد با توجه به وراثت پذیری متوسط وزن بدن در چهار هفتگی و همبستگی ژنتیکی بالای این صفت با سایر اوزان بدن و لاشه و نیز امکان تشخیص جنسیت در این سن انتخاب بلدرچین ها بر اساس این صفت نسبت به سایر صفات می تواند ارجحیت داشته باشد.

در این تحقیق به منظور برآورد اثر دفعات دوشش بر روی تولید شیر و فاصله گوساله زایی و روزهای باز گاوهای هلشتاین ایران (استان اصفهان) از رکورد های مربوط به 48446 حیوان از 85 گله برای تولید شیر و 45306 حیوان از 84 گله برای صفات تولیدمثلی استفاده شد. رکوردها توسط مرکز اصلاح نژاد دام کشور طی سال های 1380تا 1390 جمع آوری شده بودند. در این تحقیق از مدل های تکرارپذیر و چند متغیره برای آنالیز داده ها استفاده شد. اثر دفعات دوشش بر روزهای باز معنی دار بود (p < 0.01). میزان وراثت پذیری با استفاده از مدل تکرارپذیر برای روزهای باز و فواصل گوساله زایی به ترتیب 0049/0±056/0، 0049/0±054/0 و میزان تکرارپذیری به ترتیب 0047/0±11/0، 0048/0±11/0 برآورد شد. دفعات دوشش بر تولید شیر اثر معنی داری داشت (p < 0.01). میزان وراثت پذیری و تکرار پذیری برای تولید شیر به ترتیب 0049/0±133/0، 002/0±376/0 برآورد شد.

برای بررسی ضریب هم خونی گاوهای هلشتاین استان کرمان، شجره تعداد 18206راس حیوان مربوط به 5 گله که طی سالهای 1370 تا 1390 توسط تولید کنندگان در نرم افزار مدیریت گاوداری’ مدیران’ جمع آوری شده، مورداستفاده قرار گرفت. میانگین ضریب هم خونی بر مبنای سال پایه 1370 برای کل جمعیت، 37/0 درصد برآورد شد. در این شجره تعداد 7771 راس حیوان (معادل 68/42 درصد کل شجره) هم خون بودند و متوسط ضریب هم خونی این گاوها 92/0 درصد بود. تعداد حیوانات ماده موجود در فایل داده 3332 رأس (30/18 درصد کل جمعیت) و متوسط هم خونی این گاوها 46/0 درصد بود. از جمعیت حیوانات هم خون، تعداد 1417 راس حیوان ماده بوده و میانگین هم خونی آنها 11/1 درصد بود. در بخش دوم تحقیق، برای بررسی اثر هم خونی بر تولید شیر و سقط و مرده زایی از تعداد 12550 رکورد شیر مربوط به اولین دوره شیردهی و 5608 رکورد نتیجه زایش در دوره اول تا پنجم زایش مربوط به 3332 حیوان در 5 گله استفاده گردید. برایبرآورد پارامتر های ژنتیکی (وراثت پذیری و تکرار پذیری) از یک مدل تابعیت تصادفی روزآزمون با درجه دوم چند جمله ایهای لژاندر و روش آماری reml برای تجزیه تک صفتی استفاده شد. در این مدل، ضریب هم خونی به عنوان منغیر کمکی در نظر گرفته شده بود. برآورد مولفه های واریانس در سطوح مختلف روزهای شیردهی دارای روندی نا منظم بود و وراثت پذیری و تکرار پذیری برای تولید شیر به ترتیب 06/0±301/0 و 04/0±795/0 و برای سقط و مرده زایی 01/0±118/0 و 07/0±344/0 برآورد شد. تابعیت خطی صفت تولید شیر و نتیجه زایش از ضریب هم خونی معنی دار نبود که ممکن است به دلیل عدم کامل بودن شجره و برآورد ضرایب هم خونی پائین در حیوانات مورد مطالعه در این تحقیق باشد.

به منظور برآورد میزان هم خونی و تاثیر آن بر روی تعداد روز های باز و تعداد سرویس به ازای هر آبستنی از اطلاعات جمع آوری شده در5گاوداری استان کرمان در طی سال های 1370 تا 1390 استفاده گردید. این اطلاعات برای تعداد روز های باز و تعداد سرویس به ازای هر آبستنی بترتیب 4431 و 6409 که از 1999 مادر و 445 پدر بودند. متوسط تعداد روز های باز و تعداد سرویس به ازای هر آبستنی بترتیب 94/135 و 06/2 برآورد گردید. و با استفاده از اطلاعات شجره، میانگین ضریب همخونی 377/0 درصد برآورد گردید. حداقل میزان همخونی صفر و حداکثر مقدار آن 25 درصد بود.این میزان همخونی برآورد شده روی تعداد روز های بازمعنی دار نبود اما روی تعداد سرویس به ازای هر آبستنی (01/0p<) معنی دار گردید. میزان افت هم خونی برای تعداد سرویس به ازای هر آبستنی به ازای هر یک درصد افزایش هم خونی 09/0+ بود. با استفاده از مدل تکرار پذیری، تک صفتی و روش reml وراثت پذیری تعداد روز های و تعداد سرویس به ازای هر آبستنی بترتیب 086/0 و 057/0 برآورد گردید. واژ های کلیدی: هم خونی ، تعداد روز های باز، تعداد سرویس به ازای هر آبستنی، گاوهای هلشتاین، استان کرمان

آنالیز ژنتیکی صفات رشد در بز کرکی راینی شامل وزن تولد، 3، 6، 9، و دوازده ماهگی با استفاده از4117رکورد مربوط به 206 پدر و 1402 مادر انجام شد. این رکورد ها از سال 1370 تا 1385جمع آوری شده بود. مولفه های(کو) واریانس با استفاده از مدل تابعیت تصادفی تخمین زده شد. اهمیت اثرات ثابت شامل سن، جنس، شکم زایش مادر، نوع تولد، سال و ماه تولد و اثرات تصادفی شامل اثرات ژنتیکی افزایشی، اثرات ژنتیکی مادری و اثرات محیط دایمی مادر با استفاده از مدل یک متغیره بررسی شد. وراثت پذیری مستقیم صفات رشد از تولد تا نه ماهگی(وزن دوازده ماهگی بعلت کم بودن تعداد رکورد ها از محاسبات در مدل تابعیت تصادفی حذف گردید) به ترتیب 26/0، 24/0، 31/0 و 29/0 برآورد گردید. بنابراین با انجام انتخاب می توان این صفات را از نظر ژنتیکی بهبود بخشید. همچنین وراثت پذیری مادری برای سنین تولد و شش ماهگی با استفاده از مدل تابعیت تصادفی 19/0 و 04/0 تخمین زده شد. به طور کلی همبستگی ژنتیکی بین صفات رشد مثبت و از نظر مقدار متوسط تا زیاد برآورد گردید. بطوریکه همبستگی ژنتیکی بین وزن سه ماهگی با وزن شش ماهگی و وزن نه ماهگی به ترتیب، 98/0 و86/0 برآورد گردید.

در روش های ارزیابی و انتخاب حیوانات بر اساس اطلاعات فنوتیپی، نیاز اساسی در برآورد صحیح ارزش های اصلاحی وجود رکوردهای دقیق از صفات مورد نظر است. با گسترش ژنتیک مولکولی، امکان استفاده از اطلاعات در سطح dna و نشانگرهای ژنتیکی جهت برآورد صحیح تر ارزش-های اصلاحی و بهبود ژنتیکی سریعتر دام ها فراهم شده است. در این مطالعه جهت برآورد صحت ارزش های اصلاحی واقعی و برآورد شده از دو روش استنباط بیزی لاسو و ریج استفاده شد. ژنومی باطول 20 مورگان و تعداد10 کروموزوم با طول یکسان 2 مورگان شبیه سازی شد. به منظور ایجاد تراکم نشانگری cm4 تا cm066/0، به ترتیب تعداد 50- 3000 نشانگرsnp در فواصل مساوی بر روی هر کرموزوم قرار گرفت و تعداد 5، 10، 15 و 20 qtlو وراثت پذیری 05/0-5/0به عنوان فرضیات شبیه سازی صفات در نظر گرفته شدند. ارزش های اصلاحی برآورد شده توسط لاسو و ریج در تمامی صفات شبیه سازی شده، همبستگی بسیار بالایی با ارزش های اصلاحی واقعی نشان دادند. برآورد ارزش های اصلاحی توسط دو روش نشان داد که هر دو روش عملکرد مشابه ای دارند. حساسیت ریج نسبت به تغییر تعداد ژن عمده اثر و نشانگر بالا بود. در کل افزایش تراکم نشانگری و وراثت پذیری صفات باعث افزایش صحت ارزیابی ها شد. همچنین این افزایش در صحت ارزیابی ها، در افزایش ژن های عمده اثر نیز دیده شد.

در این مطالعه ژنومی متشکل از 10 کروموزوم هر یک به طول 200 سانتی¬مورگان شبیه¬سازی شد. نشانگرها بر روی ژنوم با فواصل 2/0 سانتی¬مورگان طراحی شدند و جایگاه‏های ژنی مؤثر بر صفات بر روی ژنوم با توزیع تصادفی و تعداد متغیر شبیه¬سازی شدند و تنها اثرات افزایشی ژنها در نظر گرفته ¬شد. در ابتدا جمعیت پایه¬ای از حیوانات با اندازه مؤثر 100 (50 نر و 50 ماده) شبیه¬سازی شد و این ساختار جمعیتی برای 50 نسل با آمیزش تصادفی ادامه یافت تا عدم تعادل پیوستگی بین نشانگرها و qtl ایجاد شود. پس از این اندازه جمعیت به 1000 فرد در نسل 51 (نسل مرجع) گسترش یافت. در نسل مرجع از اطلاعات ژنومیک و فنوتیپی اثرات نشانگری محاسبه گردید. در نسل 52 تا 57 (نسل هدف) ارزش اصلاحی ژنومی محاسبه شد. هدف از این تحقیق بررسی اثر سه توزیع کای‏اسکور، بتا و گاما به طور جداگانه بر صحت ارزیابی ژنتیکی و صحت انتخاب بود. در همه توزیع¬ها، با گذشت نسل¬ها از زمان برآورد اثرات نشانگری صحت برآورد ارزش های اصلاحی کاهش یافت. نتایج نشان داد که هر چه از جمعیت مرجع دور می¬شویم با افزایش نسل¬ها از نسل 51 به 57 صحت برآورد ارزش¬های اصلاحی ژنومی کاهش می¬یابد. همچنین وراثت پذیری بالا (2/0) نسبت به وراثت پذیری پایین (05/0) در تعداد qtl مشابه در نسل¬های 51 تا 57 از صحت بیشتری برخوردار می¬باشد. در مقایسه توزیع ها در وراثت پذیری پایین با تعداد 20، 50 و 100qtl، بترتیب توزیع گاما 4 (shape=0.4 , scale=1.66)، توزیع گاما 1 (shape=1.48 , scale=11.2) و توزیع بتا 2 (shape1=3.11 , shape2=1.16)و در وراثت پذیری بالا با تعداد 50 و 100 qtl توزیع گاما 5 (shape=0.4 , scale=1) در هر دو روشlasso و ridge برتری داشتند. با چهار تعداد ژن عمده اثر (10،20، 50و100) تعداد 50 و توزیع اثرات گاما باعث افزایش صحت برآوردها می¬شوند.

در این پژوهش چند شکلی ژن bmp15 با استفاده از تکنیک pcr-sscp در گوسفندان آمیخته حاصل از تلاقی قوچ های نژاد رومانف با میش های نژاد کرمانی و لری بختیاری بررسی شد. بر اساس فرم باندهی بدست آمده از تکنیک pcr-sscp، 5 نمونه از فرآورده pcr، تعیین توالی شد، پس از بررسی، دو جهش تک نوکلئوتیدی در جایگاههای bp32 وbp 95 پیدا شد، جهش اول در موقعیت bp 32 تغییری در توالی اسید آمینه ها ایجاد نمی کرد اما جهش تک نوکلئوتیدی دوم در جایگاه bp 95، منجر به تغییر در اسید آمینه شماره 40 گردید که بر اساس آن یک اسید آمینه لایزین را جایگزین یک اسید آمینه آسپارژین می کرد. با توجه به جایگزینی یک اسید آمینه باردار به جای یک اسید آمینه بدون بار، به نظر می رسد که این جهش موجب اختلال در دایمریزاسیون می شود، به گونه ای که سبب تغییر در پتانسیل سطح الکتریکی در این جایگاه می گردد، که این رخداد فعالیت زیستی را به چالش می کشد. فراوانی الگوهای ژنوتیپی aa، ab، bb، ac، ad، ae، af و ag در آمیخته های رومانف-کرمانی به ترتیب 0/24، 0/17، 0/24، 0/08، 0/05، 0/10 0/09، 0/03 و در آمیخته های رومانف_ لری بختیاری فراوانی الگوهای ژنوتیپی aa، ab به ترتیب 0/2، 0/8 بود و فراوانی¬ های آللی برای آلل های a، b، c، d، e، f وg به ترتیب 0/500، 0/3250، 0/0417، 0/0250، 0/0500، 0/0458 و 0/0125 و برای آلل های a و b به ترتیب 0/6و 0/4بدست آمد. تمامی میش های لری بختیاری و کرمانی نیز برای این جایگاه منومورف بودند. شاخص شانون و میزان هتروزگوسیتی مشاهده شده در آمیخته های رومانف –کرمانی و رومانف_ لری بختیاری، بر اساس ژنوتیپ های دیده شده در این جایگاه به ترتیب 1/2823، 5167/ 0و 0/6730، 0/8000بدست آمد که گویای تنوع بسیار بالای این جایگاه در جمعیت مورد بررسی می باشد. انتظار می رود این آمیخته ها باروری و رکوردهای بالاتری نسبت به گوسفندان کرمانی و لری بختیاری داشته و صفات برترگوسفندان رومانف مانند چند قلوزایی و بلوغ زود رس را داشته باشند. می توان با وارد نمودن این ژنها و برنامه ریزی برای تکثیر و تثبیت جهش های اتفاق افتاده مرتبط با ژنهای باروری کمک قابل توجهی به افزایش تولید و درآمد دامداران کشور انجام داد.

هدف از این پژوهش، بررسی چند شکلی ژن گیرنده هورمون محرک فولیکول (fshr) در بره های آمیخته حاصل از میش های بومی کرمانی با قوچ های رومانوف و میش های بومی کرمانی و بره های نر بومی-پاکستانی بود. برای این منظور نمونه های خون 173 راس گوسفند شامل بومی و بومی- رومانوف و هفت راس بره نر بومی-پاکستانی ازگله ای در کرمان، جمع آوری و با حفظ زنجیره سرد به آزمایشگاه منتقل شد. dna به روش نمکی بهینه یافته استخراج شد و سپس با استفاده از دو جفت آغازگر اختصاصی دو قطعه از جایگاه تنظیمی ژن به طول 205 و 247 جفت باز به کمک واکنش زنجیره ای پلی مراز (pcr) تکثیر شد، و با روش sscp آنالیز شد، بدین صورت که الگوها از dna تک رشته ای جدا شده توسط الکتروفورز ژل پلی اکریل آمید، به دست آمد و توسط رنگ آمیزی نیترات نقره مشاهده شدند.

هدف از پژوهش حاضر، بررسی چند شکلی در ژن گیرنده آلفای استروژن (esr?) در بره های آمیخته حاصل از قوچ های رومانف و میش های بومی ایران بود. برای این منظور نمونه های خون 172 راس گوسفند از گله ای در اطراف شهر کرمان، متشکل از 52 راس میش بومی، 57 راس بره ماده آمیخته رومانف- بومی و 64 راس بره نر آمیخته رومانف- بومی، جمع آوری شد. استخراج dna به روش نمکی بهینه یافته از خون کامل انجام شد. سپس با استفاده از یک جفت آغازگر طراحی شده تکثیر قطعه ی 258 جفت بازی این ژن با واکنش زنجیره ای پلی مراز (pcr) انجام گردید. پس از تعیین چند شکلی فضایی تک رشته ای (sscp) محصولات pcr، الگوهای باندی مربوط به ژن گیرنده ی آلفای استروژن با استفاده از ژل آکریل آمید و رنگ آمیزی نیترات نقره به دست آمد. نتایج به دست آمده نشاندهنده مونومورف (یک شکل) بودن dna ژنومی برای ژن esr? در این گله گوسفند می باشد.

در این تحقیق به منظور برآورد پارامترهای ژنتیکی صفات تولیدی و تولیدمثلی گاوهای هلشتاین در استان اصفهان از اطلاعات جمع آوری شده طی سال های 1380 تا 1390 توسط تعاونی وحدت اصفهان استفاده گردیدکه شامل اطلاعات مربوط به شجره، داده های تولیدمثلی و تولید شیر مربوط به گله های گاو شیری هلشتاین استان اصفهان بودند. آنالیز داده ها با استفاده از الگوریتم حداکثر درست نمایی محدود شده (reml) انجام شد. میزان وراثت پذیری برای تولید شیر، پروتئین، چربی، روزهای باز و فاصله گوساله زایی به ترتیب 30/0، 08/0، 06/0، 02/0 و 07/0 بود.