هدف از انجام این پژوهش شناسایی و اولویت بندی موانع پیاده سازی مدیریت کیفیت جامع بر اساس استاندارد ایزو 9001 در صنایع غذایی ایران و شناساندن آن ها به مدیران صنایع غذایی می باشد. در راستای دست یابی به این هدف مطالعه گسترده ای در زمینه مبانی موضوع و پژوهش های پیشین انجام و به دنبال آن پژوهش از نوع توصیفی ـ پیمایشی و از شاخه کاربردی و با بکار گیری پرسشنامه به عمل آمد. جامعه آماری پژوهش را مدیران کیفیت شرکت های صنایع غذایی دارنده گواهینامه ایزو 9001 تشکیل می دهد. از میان 150 پرسشنامه توزیع شده تعداد 60 عدد تکمیل و دریافت شد که نرخ بازگشت 40 درصدی پرسشنامه را نشان می دهد. فرضیات تحقیق با استفاده از آزمون کولموگروف ـ اسمیرنوف، آزمون میانگین t و فریدمن مورد بررسی و تجزیه و تحلیل قرار گرفته اند. یافته های این پژوهش نشان دهنده اینست که مهمترین موانع پیاده سازی مدیریت کیفیت جامع بر مبنای استاندارد ایزو 9001 و از دیدگاه مدیران کیفیت صنایع غذایی ایران به ترتیب عبارتند از: 1- عدم تعهد مدیریت به کیفیت، 2- تلقی نشدن کیفیت به عنوان مسئولیت همه افراد، 3- عدم اندازه گیری کیفیت به نحو اثربخش، 4- مقاومت کارکنان به تغییر و 5- عدم آموزش کارکنان در زمینه مهارت های بهبود کیفیت. نتایج این تحقیق تجربی می تواند به عنوان راه کاری برای موانع پیش روی مدیران در زمان پیاده سازی و نیز استمرار مدیریت کیفیت جامع مورد استفاده قرار گیرد.