در مطالعه حاضر برای شناسایی چند شکلی ناحیه اگزون 2 ژن mhc (مجتمع اصلی سازگاری بافتی) در جمعیت گوسفندان نژاد ماکوئی مرکز پرورش و اصلاح نژاد استان آذربایجان غربی، از تعداد 90 گوسفند خون گیری انجام گرفت. dna ژنومی از نمونه های خون استخراج گردید و قطعه ای به اندازه 279 جفت باز از ناحیه اگزون 2 ژن mhc با استفاده از واکنش زنجیره ای پلی مراز تکثیر شده و محصولات pcr بدست آمده به وسیله آنزیم برشی rsai هضم شدند و بر روی ژل آگارز دو درصد الکتروفورز گردیدند. نتایج بدست آمده حاکی از وجود 10 نوع آللa ،b ،e ،f ،i ،m ،o ،p ،q وv در این جایگاه بود که فراوانی آنها در کل جمعیت به ترتیب 56/47%، 76/9%، 83/1%، 66/3%، 49/5%، 22/1%، 98/10%، 15/9%، 54/8% و83/1% محاسبه شد. تعداد 18 ترکیب ژنوتیبی aa،ab ،ae ،ff ،am ،bo ،eo ،io ،om ap ،bp ،op ،pp ،aq ،oq ،pq ، qq وav شناسایی شدند که فراوانی ژنوتیپی محاسبه شده آنها در جمعیت به ترتیب برابر 70/31%، 85/15%، 21/1%، 65/3%، 21/1%، 43/2%، 43/2%، 97/10%، 21/1%، 87/4%، 21/1%، 65/3%، 65/3%، 87/4%، 21/1%، 21/1%، 87/4%، 65/3% بدست آمد. شاخص هتروزیگوتی و تعداد آلل موثر برای این جایگاه به ترتیب 7314/0%، 72/3% بدست آمد. آزمون مربع کای برای گوسفندان ماکوئی مرکز پرورش و اصلاح نژاد استان آذربایجان غربی نشان داد که جامعه در تعادل هاردی-واینبرگ قرار ندارد. بر اساس نتایج بدست آمده می توان نتیجه گیری نمود که ژنوتیپ های لوکوس مورد مطالعه تحت تأ ثیر عوامل تغییر دهنده مانند انتخاب، جهش و یا مهاجرت بوده است.