نام پژوهشگر: علی اسمعیلی زاده

مکان یابی جایگاه های ژنی مرتبط با رشد بلدرچین ژاپنی روی کروموزوم شماره ی 3 با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان - دانشکده کشاورزی 1391
  رقیه جباری عوری   علی اسمعیلی زاده

بلدرچین علاوه بر تولید گوشت و تخم به دلیل اندازه کوچک بدن و فاصله نسلی کوتاه به عنوان حیوان آزمایشگاهی کاربرد های فراوانی دارد. شناسایی ژن های کنترل کننده صفات مهم اقتصادی در حیوانات و گیاهان یکی از موضوعات اصلی در تحقیقات ژنومیکس کشاورزی است. تاکنون، پژوهش های ژنومی اندکی برای یافتن جایگاه های موثر بر صفات کمی (qtl) مرتبط با رشد در بلدرچین ژاپنی صورت گرفته است. هدف از این تحقیق، پویش کروموزوم شماره سه بلدرچین ژاپنی به منظور تشخیص qtl موثر بر صفات رشد بلدرچین، با استفاده از یک طرح f2 بود. داده-های فنوتیپی، که شامل اندازه گیری های وزن تولد تا پنج هفتگی، وزن قبل از کشتار، میانگین افزایش وزن روزانه و نسبت کلیبر محاسبه شده برای محدوده های سنی مختلف بود روی جمعیت نسل دوم جمع آوری شد. کل جمعیت (472 پرنده) برای 3 نشانگر ریز ماهواره ای تعیین ژنوتیپ شدند. آنالیز qtl به روش مکان یابی درون فاصله ای مبتنی بر رگرسیون و یک مدل تک qtl انجام گردید. qtl های معنی داری برای صفات وزن تولد، وزن یک، دو، سه و چهار هفتگی، میانگین افزایش وزن روزانه تولد تا 1 هفتگی، 1 تا 2 هفتگی و 3 تا4 هفتگی، نسبت کلیبر محاسبه شده برای 3 تا 4 هفتگی شناسایی شد.

تکثیر و همسانه سازی بخش ابتدایی ژن کشنده آلفا-توکسین (?-toxin) باکتری کلستریدیوم پرفرِینجنس در باکتری e. coli
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان - دانشکده کشاورزی 1392
  مهین رسانی   علی اسمعیلی زاده

باکتری کلستریدیوم پرفرینجنس تیپ a یک تولید کننده سم آلفا توکسین می باشد که عامل ایجاد بیماری گازگانگرن است. این بیماری یک عفونت تهدید کننده حیات با تب، درد، ورم میکرونکروز و تولید گاز می باشد. پروتئین آلفا توکسین دارای فعالیت های فسفولیپازی و اسفنگولیومینازی می باشد که همولیز، مرگ و نکروز پوستی را سبب می شود. اثر کشندگی آلفا توکسین نیز به خاطر تخریب غشای سلولی می باشد به همین جهت این سم نقش مهمی در ایجاد قانقاریای گازی دارد. هدف از انجام این پژوهش، تکثیر و همسانه سازی بخش ابتدایی ژن کشنده آلفا توکسین(?-toxin) باکتری کلستریدیوم پرفرِینجنس در باکتری e.coli بود. جهت مطالعه بخش n ترمینال ژن کدکننده آلفاتوکسین، استخراجdna ژنومی با استفاده از کیت کیا ژن صورت گرفت سپس با استفاده از آغازگرهای اختصاصی بخش ابتدایی ژن با استفاده از تکنیک pcr تکثیر و در ناقل e.colipet28a کلون شد. با استفاده از هضم آنزیمی توسط آنزیم های hindiii و xhoi کلون مورد نظر تأیید شد. با توجه به موفقیت آمیز بودن کلونینگ ژن آلفا توکسین در باکتری های میزبان می توان گفت که اولأ پرایمرهای طراحی شده برای تکثیراین ژن اختصاصی اند، ثانیأ به عنوان یک مارکر جهت شناسایی و طبقه بندی این باکتری ها می توانند مورد استفاده واقع شوند. ثالثأ با ساخت واکسن های نوترکیب ژنتیکی مهندسی شده می توان راه کنترل و مقابله با پاتوژن های مهمی همچون باکتری کلستریدیوم پرفرینجنس را امکان پذیر ساخت.

مطالعه جهش نقطه ای c/t در موقعیت 1184 اگزون 1 ژن gdf9 و تاثیر آن بر صفت چندقلوزایی در گوسفند نژاد آرمان
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان - دانشکده کشاورزی 1392
  محسن رحیم پور   علی اسمعیلی زاده

هدف از این تحقیق شناسایی چندشکلی های آللی موجود در ژن فاکتور رشد و تمایز 9(gdf9) در گوسفند نژاد آرمان و تاثیر آن بر میزان بره دهی در گوسفند آرمان بود. نمونه های خون از 140 راس میش آرمان که درای رکورد زایش بودند جمع آوری شد. استخراج dna به روش نمکی از خون کامل انجام شد. در این تحقیق از روش pcr-rflp برای شناسایی برای شناسایی ژنوتیپ ها استفاده شد. واکنش pcr با استفاده از پرایمر های اختصاصی برای تکثیر قطعه 139 جفت بازی اگزون یک ژن gdf9 انجام شد. هضم آنزیمی محصول pcr با استفاده از آنزیم برشی ddei انجام شد. نتایج نشان داد، همه افراد برای جهش fecgh آلل وحشی را دارندو تنها قطعه 108 جفت بازی را تولید کردند. هضم آنزیمی با ddei برای محصولات pcr در حیوانات با ژنوتیپ وحشی منجر به تقسیم محصول 139 جفت بازی به دو قطعه با اندازه های 31 و 108 جفت بازی می گردد. در بخش دوم تحقیق، جهت بررسی توان بره دهی در سه نژاد گوسفند بلوچی، ایران بلک و آرمان از تعداد 1860 رکورد (834 راس میش بلوچی، 600 راس میش ایران بلک و 426 راس میش آرمان) مربوط به سال های 1352 تا 1390 استفاده شد. صفت مورد مطالعه توان بره دهی بود. با استفاده از رویه glm نرم افزار sas عوامل ثابت موثر بر توان بره دهی شناسایی شدند. میانگین حداقل مربعات (اشتباه معیار) توان بره دهی به طور کلی در سه نژاد بلوچی، ایران بلک و آرمان به ترتیب 1.46، 1.58 و 1.70بود. توان بره زایی نژاد آرمان به طور معنی داری بیشتر از نژاد بلوچی بود.شکم زایش و سال تولد اثر معنی دار بر صفت بره دهی در هر سه نژاد داشت.