نام پژوهشگر: سونیا زکی زاده

چند شکلی آللی (پلی مورفیسم) ژن cd14 و ارتباط آن با نمره سلول های سوماتیک در گاوهای نژاد هلشتاین و براون سوئیس خراسان
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بیرجند - دانشکده کشاورزی 1390
  حسن همتی   محمدباقر منتظر تربتی

ژن cd14 از مهمترین عوامل شروع کننده واکنش های التهابی است که در نوتروفیل ها (به فرم mcd14) و در سلول های اندوتلیال و اپیتلیال بافت پستان (به فرم scd14) بیان می شود. نتیجه این بیان تولید فرآورده هایی است که منجر به بروز واکنش های التهابی شده و تجمع سلول های دفاعی در محل آلوده را باعث می شود. در این مطالعه فراوانی snp (g.a1908g) در اگزون 2 ژن cd14 و ارتباط آن با نمره سلول های سوماتیکی شیر مورد بررسی قرار گرفت. نمونه های خون، از دو نژاد هلشتان و براون سوئیس به ترتیب از 44 و 59 راس گاو گاوداری های مشهد جمع آوری گردید. نمونه ها پس از استخراج dna به روش نمکی بهینه یافته تکثیر و با استفاده از مارکر sscp تعیین ژنوتیپ شدند. فراوانی ژنوتیپ های به دست آمده برای aa، ag، و gg به ترتیب 54، 39، و 10 تا مشاهده شدند. آنالیز سازه های محیطی و ژنوتیپ نشان داد که اثر سازه های نژاد، نوبت شیردهی، و ماه شیردهی در سطح )%5 (p< و روزهای شیردهی در سطح )%5 (p< بر مقدار نمره سلول های سوماتیکی معنی دار شده است، نتایج تحقیق حاضر نشان داد که سازه ژنوتیپ بر صفات تولیدی درصد چربی، درصد پروتئین و نمره سلول های سوماتیکی اثر معنادار آماری نداشت و اثر سازه مزبور بر صفت تولید شیر به لحاظ آماری معنی دار بود)%5 (p<.

تجزیه و تحلیل ژنتیکی درصد چربی شیر با مدل تابعیت تصادفی و بررسی چندشکلی ژن1 dgat با روش pcr-rflp در گوسفند کردی شیروان
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه علوم کشاورزی و منابع طبیعی گرگان - دانشکده کشاورزی 1392
  زینب رحمانی   سعید حسنی

هدف از این تحقیق برآورد پارامترهای ژنتیکی درصد چربی شیر با مدل تابعیت تصادفی با استفاده از نرم افزار wombat بود که برای این منظور تعداد 1096 رکورد روزآزمون درصدچربی شیر مربوط به 250 رأس میش در سال 1391 در ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد کردی واقع در شهرستان شیروان جمع آوری شد. در تحقیق حاضر متوسط درصد چربی شیر نژاد مزبور 6/53 بدست آمد. مدل مورد استفاده جهت تجزیه داده ها شامل عوامل ثابت (نوع تولد بره، ماه رکوردگیری و شکم زایش)، روز شیردهی به عنوان متغیر کمکی و عوامل تصادفی (اثر ژنتیکی افزایشی مستقیم، اثر محیطی دائمی و باقی مانده) بود. تابع چندجمله ای با درجات برازش مختلف برای مدل های تصادفی و ثابت در خصوص تنوع ژنتیکی افزایشی و محیط دائمی در نطر گرفته شد که مدل با درجه برازش 3 به عنوان بهترین مدل انتخاب شد. متوسط وراثت پذیری مستقیم برآورد شده در طول دوره شیردهی با مدل رگرسیون ثابت و تصادفی برای درصدچربی شیر به ترتیب 0/015و 0/12 برآورد شد. تکرار پذیری نیز در نیمه اول شیردهی روند کاهشی و سپس تا انتها دوره روند افزایشی داشت. همچنین با افزایش فاصله بین روز های شیردهی، همبستگی های ژنتیکی افزایشی و محیط دائمی کاهش یافتند. از طرفی شناسایی چندشکلی ژن دی آسیل گلیسرول آسیل ترانسفراز (dgat1) در گله گوسفند کردی ایستگاه اصلاح نژاد شیروان با روش pcr-rflp و بررسی ارتباط آن با درصد چربی شیر در کل دوره شیردهی این میش ها صورت گرفت. بدین منظور در این تحقیق از 100 رأس میش نژاد کردی ایستگاه پرورش و اصلاح نژاد گوسفند کردی شیروان نمونه های خون تهیه و استخراج dna انجام شد. واکنش زنجیره ای پلیمراز جهت تکثیر قطعه 309 جفت بازی اگزون 17 ژن dgat1 انجام گرفت. سپس با آنزیم alui قطعه تکثیرشده مورد هضم قرار گرفت و دو آلل tوc به ترتیب با فراوانی های 0/35و 0/65شناسایی شدند. نتایج بدست آمده تعادل هاردی-واینبرگ را برای این جایگاه تأیید نکرد (05/0p<). متوسط هتروزیگوسیتی هم برای این جایگاه 45/0 بود. جهت بررسی ارتباط چندشکلی ژن dgat1 با رکوردهای درصدچربی شیر میش های مورد مطالعه از رویه glm نرم افزار sas9.1 استفاده شد. نتایج نشان داد که بین ژنوتیپ های ژن dgat1 و رکوردهای درصدچربی شیر میش های نژاد کردی ایستگاه اصلاح نژاد شیروان ارتباط معنی-داری وجود دارد و میش های با ژنوتیپ tt درصد چربی شیر بیشتری نسبت به میش ها با ژنوتیپ tc و cc داشتند (01/0p<). نتایج تحقیق حاضر بیانگر آن است که آنالیز رکوردهای درصد چربی شیر با مدل رگرسیون تصادفی پارامترهای ژنتیکی را با برآورد دقیق تری نسبت به مدل های حیوانی در اختیار قرار می دهد.