در این پروژه روشهایی برای جداسازی ساختارهای خاص ، مانند تالاموس و هسته قرمز از تصاویر‏‎mri‎‏ مغزی پیشنهاد شده است .این روشها برای جداسازی ساختارهایی با کنتراست پایین ، لبه های ضعیف و ناپیوسته طراحی شده اند . بعد از تحقیق در باره روشهای مختلف شناسایی وجداسازی ساختارها از روی تصاویر ، روشهای معرفتی و کانتورهای دینامیکی مبنای کار قرار گرفتند. روشهای معرفتی به علت ترکیب اطلاعات تصویر با اطلاعاتی مثل اطلاعات پزشکی یا اطلس ، دید وسیعی در شناسایی ساختارها ایجاد می کنند. یکی از مزایای مهم کانتورهای دینامیک ایجاد یک مرز بسته برای محدوده مورد نظر می باشد. سابقه مدلهای کانتور دینامیک به مدل مار بر می گردد . این مدل براساس تعریف یک تابع انرژی و یافتن حالت مناسب از طریق حداقل کردن انرژی عمل می کند. در مدل مار انرژی مدل ، که یک کانتور بسته یا باز است با حرکت آن به طرف جنبه های تصویری تعریف شده ، کاهش می یابد. وجه تسمیه این مدل نیز به همین علت است . روش پیشنهادی بر مبنای شناسایی مطمئن ساختارها توسط روشهای معرفتی و جداسازی دقیق ساختارها با کانتورهای دینامیک می باشد. روشهایی استاندارد لبه یابی ، توزیع انرژی مناسبی برای جداسازی ساختارهایی مانند تالاموس ایجاد نمی کنند. لذا در این پروژه روشی جدید جهت ایجاد توزیع انرژی مناسب برای استخراج ویژگیهای مطلوب از تصویر و در نتیجه یافتن صحیح حداقل محلی انرژی در موقعیتهای لبه و هدایت کانتور به سمت لبه های ساختار مورد نظر پیشنهاد شده است . همچنین راه حلهایی برای بعضی مشکلات اعمال مدل مار برای این کاربرد و کاربردهای مشابه ارائه شده است.