دراسفندماه 1364 کار تخلیه و بارگیری و نگهداری کالا در بندر خرمشهر به سازمان بنادر و کشتیرانی واگذار گردید. قبل از این تاریخ وظیفه اداره بندرمنحصر به بستن و بازکردن کشتی ها به اسکله و راهنمایی آنها در شطالعرب بود و تمام اموری که فعلا این سازمان در جهت تحویل و نگهداری کالا انجام میدهد بوسیله اداره گمرک صورت میگرفت.حدود اختیارات و وظایف هر یک از دو سازمان در بخشنامه ای بعنوان اداره گمرک در تاریخ فوق از طرف وزارت دارایی ارسال گردید و این دو کار خود را مستقلا شروع نمودند.صاحبان کالا جهت انجام تشریفات گمرکی به هر دو مراجعه می کنند. هدف بررسی مشکلاتی است که از رابطه این دو اداره ایجاد شده و نهایتا موجب کندی کار و سرگردانی ارباب رجوع میگردد.