یکی از علل مرگبار بودن سرطان ریه و بیماری های ریوی، عدم تشخیص آنها در مراحل ابتدائی بعلت کمبود علائم بیماری است. تشخیص این بیماری ها در مراحل اولیه در روند درمان بسیار موثر است و احتمال درمان را بسیار افزایش می دهد. سیستم های آشکارساز کامپیوتری یا cad، جهت آشکارسازی و طبقه بندی نواحی در رادیوگرافی های قفسه سینه به لحاظ موارد غیر عادی (مثل برآمدگی ها) که ممکن است هشدار دهنده سرطان ریه باشند، طراحی شده اند. بدین منظور در این پایان نامه رویکردی ارائه شده که به تحلیل سه بعدی و خودکار تصاویر ctقفسه سینه می پردازد. رویکرد معرفی شده شامل مراحل زیر می باشد: در مرحله اول بعد از استاندارد سازی شدت روشنایی تصاویر، به صورت اتوماتیک بافت اصلی ریه از پس زمینه جدا می شود. در این مرحله روشی جهت بازسازی دیواره ریه و بازیابی نقاط حذف شده مشکوک متصل به دیواره ریه ارائه شده است. در مرحله دوم کاندیدهای ندول ها استخراج می گردند. بدین منظور ابتدا پیش پردازشی بر روی تصاویر اعمال شده و سپس با استفاده از روشهای فیلتر کردن تصاویر با هسته های گوسی و شاخص شکل و یک روش ترکیبی پیشنهادی، کاندیدهای ندول ها استخراج می شوند. در ادامه جهت بازسازی کاندیدهای ندول ها و یافتن حجم کامل آنها، از دو روش رشد ناحیه استفاده شده است. در مرحله سوم ویژگی های بهینه متمایز کننده ندول ها از غیر ندول ها، از نواحی کاندید استخراج می گردند. در مرحله چهارم با استفاده از طبقه بندی کننده ماشین بردار پشتیبان و ویژگی های استخراج شده، کاندیدهای ندول ها به دو دسته ندول و غیر ندول طبقه بندی می شوند. در مرحله پنجم ویژگی ها جهت طبقه بندی ندول ها بررسی می شوند. در این پروژه از تصاویر ct قفسه سینه 57 بیمار، که از کنسرسیوم پایگاه داده تصاویر ریه (lidc) گرفته شده، استفاده کرده ایم. میانگین تعداد برشها برای هر سوژه 254 برش می باشد. بهترین نتایج بدست آمده برای جداسازی ندول از غیر ندول ها دارای حساسیت6/87 با میانگین تعداد خطای مثبت یا fp، 9/8 برای هر سوژه می باشد. با توجه به استفاده از تصاویر متنوع پایگاه داده معتبر lidc که شامل تعداد سوژه های کافی برای سنجش الگوریتم ارائه شده و ندول ها با اندازه و اشکال گوناگون است، نتایج حاصل شده از این سیستم قابل قبول خواهد بود.

اگروباکتریوم تومفاشینس یک باکتری گرم منفی منحصر به فرد خاکزی است که در طیف عظیمی از گیاهان تک لپه و دولپه، به وسیله وارد کردن dna خود بیماری گال طوقه را ایجاد می کند. اگروباکتریوم توانایی درک مولکول های سیگنال آزاد شده از گیاهان مثل ترکیبات فنولی و مواد قندی را برای فعال سازی مسیر آلوده کردن بیماری زایی را دارد. تراریزش گیاهان عموما با استفاده از اگروباکتریوم صورت می گیرد. کارایی انتقال به مقدار بیان ژن های بیماری زایی در اگروباکتریوم بستگی دارد که به طور سیس وترانس عمل می کنند. ترکیبات فنولی و قندها از عوامل مهم القاکننده این دسته از ژن ها هستند. . در این مطالعه برخی از منوساکاریدهای القا کننده vir regulone شناسایی شدند. بدین منظور سویه های متفاوتی از اگروباکتریوم شامل c58 و a348 در حضور 4 غلظت متفاوت استوسیرینگون (صفر، 10، 50 و 100m µ) و سه منوساکارید (گالاکتوز، گلوکز و زایلوز) کشت شدند. از سویه c58 بعد از تیمار کردن، استخراج rna صورت گرفت و بیان ژن ها با qpcr سنجیده شدند. از دو سویه a348 که دارای ترانسپوزون tn3 hoho1 هستند برای مانیتور کردن میزان فعالیت ژن virb2 وvird2 استفاده شد. این ترانسپوزون دارای ژن lac z است. در این مطالعه نشان داده شد که قند های گالاکتوز و زایلوز قادر به القای ژن های virb2 و vird2 در فقدان استوسیرینگون هستند. هم چنین قند گالاکتوز بهترین قند برای القا این دو ژن شناخته شد. برای بررسی بیشتر این نتیجه ترانسفورماسیون گیاه آرابیدوپسیس به روش floral dip با استفاده از 4 تیمار متفاوت اگروباکتریوم انجام شد. پس از بررسی گیاهان تراریخته، قند گالاکتوز بهترین قند از نظر القا ژن virb2 و vird2، هم چنین بهترین قند برای افزایش درصد ترانسفورماسیون انتخاب شد.

چکیده ندارد.