سرطان کولون یکی از شایع ترین انواع سرطان در کشورهای صنعتی است. شیوع سرطان کولون در ایران در مقایسه با کشورهای غربی کمتر است. این سرطان در ایران به ترتیب پنجمین و سومین سرطان شایع در مردان و زنان است. البته شیوع آن در سه دهه اخیر افزایش چشمگیری داشته است. جهش در ژن p53 مهم ترین تغییر ژنتیکی در پیشرفت سرطان کولون گزارش شده است. جهش در این ژن اغلب در اگزون های 5 تا 8 این ژن اتفاق می افتد . پروتیئن جهش یافته در هسته سلول تجمع می یابد. افزایش بیان آنزیم cox-2 در مراحل اولیه سرطانزایی کولون اتفاق می افتد. پلی مورفیسم در ناحیه پروموتری 765- این ژن بر بیان آن اثر دارد. توزیع ژنوتیپ این آنزیم به صورت gg : 22.6 %، cc: 9.7% و gc: 67.7% بوده است. در بررسی جهش های ژن p53 در نمونه های مورد مطالعه ، در 46.7 % نمونه ها جهش مشاهده شد و 53.3 % بقیه فاقد جهش بودند. همراهی بین جهش در ژن p53 و ژنوتیپ های ژن cox-2 تنها در اگزون 8 ژن p53 از لحاظ آماری معنی دار بوده است.همراهی بین تجمع نسبی پروتئین p53 و ژنوتیپ ژن cox-2 دیده نشد. این داده ها می تواند به فهم بهتر فرآیند ملکولی سرطان کولون کمک نماید.

آنزیم های آمیلاز (e.c.3.2.1.1)، یکی از مهم ترین آنزیم های صنعتی محسوب می شوند و در حدود 25% از بازار آنزیم های صنعتی مورد استفاده در صنایعی مانند نساجی، کاغذ سازی، نانوایی، داروسازی و غیره را به خود اختصاص داده است. در این تحقیق، یک سویه باکتریایی ترموفیل تولید کننده آمیلاز از چشمه آب گرم محلات در ایران جداسازی شده است. مشخصه های مورفولوژیکی سویه zk07 مطابق با جنس باسیلوس ها است. پس از تعیین توالی جزیی ژن 16s rrna این سویه و الایمنت آن با سایر سویه ها، مشخص می شود که سویهzk07 ارتباط بسیار نزدیکی (99%) با باسیلوس های لیکنی فرمیس دارد. بدین سان این سویه را با عنوان " bacillus licheniformis zk07 " رده بندی کردیم. بیشترین فعالیت آنزیم به طور جزیی خالص سازی شده این سویه، در ph محیط بازی برابر با 10 و دمای60 درجه سانتیگراد انجام می شود. هم چنین پایداری آنزیم در رنج دمایی و ph بین80-40 درجه سانتیگراد و 11-6 به مدت 24 ساعت بررسی شد. تکنیک تثبیت به روش منفرد و ترکیبی برای محصورسازی سلول و آنزیم تولید شده توسطbacillus licheniformis zk07 به منظور بهبود روند تجزیه نشاسته به کار گرفته شد. تثبیت منفرد به وسیله پلیمرهای آلژینات و پکتین وسیستم تثبیت ترکیبی متشکل از پلیمرهای آلژینات-pva وآلژینات-گلیسرول می باشد. سلول های آزاد سویهzk07 می توانند در شرایط مشابه با سلول های تثبیت شده، میزان 1% نشاسته را به مدت32 ساعت مصرف نمایند. تجزیه میزان مشابه نشاسته توسط سلول های محصور شده در آلژینات-pva وآلژینات-گلیسرول پس از20 ساعت انجام گرفت. هم چنین سلول های تثبیت شده در ماتریکس های آلژینات و پکتین توانستند همین میزان نشاسته را به ترتیب پس از 28 و24 ساعت تجزیه کنند. هم چنین میزان فعالیت آنزیم تولید شده توسط سلول ها تحت شرایط تثبیت، به طور چشمگیری افزایش یافت. عصاره آنزیمی نیز در ماتریکس های گفته شده تثبیت و میزان کارایی تثبیت آنزیم در آن ها محاسبه شد. نتایج ما نشان می دهد که تثبیت سلول و آنزیم آمیلاز با استفاده از حاملین منفرد و ترکیبی می تواند روش جدیدی برای بهبود تجزیه نشاسته در مقایسه با سلول های آزاد باشد.

اسپورهای باکتریایی، حالتی مقاوم و خاموش (خفته) از سلولهای زنده هستند که امروزه کاربرد فراوانی در تحقیقات کاربردی از جمله در سیستم بیان روی سطح (surface display) پیدا کرده اند. این سیستم، در موارد زیادی از جمله آفت کش بیولوژیک، پروبیوتیک و در تولید آنزیمها و آنتی بیوتیکها و اخیرا بعنوان حامل برای تحویل واکسنها و آنتی ژنها استفاده شده است. اما تاکنون قطعات جاذب فلز بر روی سطح اسپور بیان نشده اند. در این تحقیق از cotb و cotg، ترکیبات اصلی پوشش اسپور باسیلوس سوبتیلیس، بعنوان پروتئینهای حامل برای بیان قطعه پلی هیستیدینی بر روی پوشش اسپور استفاده شد. ابتدا از ژن cotg برای این امر استفاده شد اما نه در بخش بررسی بیان با استفاده از آزمایش وسترن بلات و نه در آزمایش جذب فلز نیکل، موفقیتی به دست نیامد. در ادامه ژن cotb مورد بررسی قرار گرفت و قطعه پلی هیستیدینی در آزمایش وسترن بلات مشاهده شد. با انجام آزمایش جذب فلز نیکل نیز در حدود 20% جذب به دست آمد. امید است با انجام آزمایشات بیشتر، نتایج مطلوبتری به دست آید.

کیتین n(c8h13o5n ) دومین پلیمر مهم از نظر فراوانی درجهان است. کیتین از پیش ساز فعالudp-n- acetylglucoseamine به وسیله آنزیم کیتین سینتاز، سنتز می شود. مقدار کیتین از سخت پوستان در کل محیط های دریایی 1560 میلیون تن تخمین زده شده است. اسکلت خارج سلولی سخت پوستان (پوسته خرچنگ، لابستر ومیگو) به طور متداول از اصلی ترین منابع زیستی کیتین می باشد. میکروارگانیسم ها اولین تجزیه کننده های کیتین در طبیعت می باشند که دارای منابع با ارزشی از آنزیم هایی با ویژگی های مطلوب و جدید برای استفاده های کاربردی از کیتین، کیتوالیگوساکاریدها و کیتوزان هستند. خالص سازی و تغییر شیمیایی کیتین مشکل می باشد از این رو شناسایی آنزیم های میکروبی تغییردهنده کیتین و توضیح فعالیت این آنزیم ها در تولید محصولات خاص از کیتین می تواند تسهیلاتی ایجاد کند. باکتری ها و قارچ ها سیستم هایی هستند که برای دپلی مریزاسیون، انتقال و متابولیسم کیتین و کیتوالیگوساکاریدها گسترش یافته اند. بنابراین غربالگری و جداسازی باکتری های تولید کننده آنزیم کیتیناز موجود در استخرهای پرورش میگو منجر به شناسایی باکتری cohnella sp.a01گردید. بهینه سازی محیط کشت باکتری در راستای افزایش تولید آنزیم کیتیناز با استفاده از روش آماری تاگوچی انجام گرفت. در این روش با آرایه متعامد l27 هشت فاکتور در سه سطح مطالعه شد. نتایج مطالعه نشان داد که هشت فاکتور دما، ph، inoculation، trace element، nh4no3، k2hpo4، nacl، chitin در سه سطح از آرایه متعامد l27 روش آماری تاگوچی استفاده شد. با توجه به 27 آزمایش انجام شده، اطلاعات بدست آمده با نرم افزارهای minitab 14 و spss آنالیز شد. آنالیز واریانس ( anova ) داده ها توسط نرم افزار spssنشان داد که سه سطح فاکتورهای inoculation، trace element، temprature و nacl در سطح احتمال 1% اختلاف معنی دار داشتند که نشان دهنده فعالیت-های متفاوت سه سطح فاکتورهای inoculation، temprature ، trace element و nacl نسبت به هم بودند. در شناشایی بیوشیمیایی آنزیم کیتیناز ph و دمای بهینه آنزیم 5 و 70 درجه سانتی گراد بدست آورده شد. آنزیم کیتیناز تولید شده به وسیله این باکتری .زمانیکه از کیتین کلوئیدی به عنوان سوبسترا استفاده گردید km محاسبه شده برای این آنزیمmg/ml 024/0 و vmax آن unit/min 67/4 بدست آمد.

مزایای چشمگیر آنزیم های تثبیت شده از قبیل پایداری بیشتر آنزیم ،امکان استفاده چند باره از یک منبع آنزیمی و جداسازی آسان آن از مخلوط واکنش، سبب جلب توجه محققان در جهت گسترش روشهای تثبیت و استفاده از آنزیم های تثبیت شده گشته است. آنزیم آلفا آمیلاز یکی از پر کاربردترین آنزیم های صنعتی است که در صنایع مختلف، از جمله صنایع غذایی، نساجی،کاغذ سازی و تخمیری کاربرد دارد و تا کنون بر روی سطوح مختلف و با روش های متفاوت تثبیت شده است که هر یک از آنها مزایا و معایبی را به همراه داشته است. در پژوهش حاضر، آنزیم آلفا آمیلاز برای اولین بار به صورت غیر ژنتیکی و به دو روش برگشت پذیر و برگشت ناپذیر بر روی سطح اسپور باسیلوس سوبتیلیس تثبیت شده است. در روش برگشت پذیر آنزیم آلفا-آمیلاز از طریق میانکنش های الکترواستاتیک و هیدروفوبیک به صورت جذب سطحی بر روی سطح اسپور تثبیت شد و در روش برگشت ناپذیر، آنزیم با استفاده از n هیدروکسی سوکسین آمید و اتیل دی متیل آمینو پروپیل به صورت کوالان به سطح اسپور تثبیت شد. سپس ویژگی های کاتالیتیک آنزیم آزاد با آنزیم های تثبیت شده مورد بررسی و مقایسه قرار گرفت. میزان آنزیم تثبیت شده به روش جذب سطحی 22/21 درصد و برای آنزیم تثبیت شده به روش کوالان 5/94 درصد مشاهده شد. ph بهینه فعالیت آنزیم آزاد برابر با 6 و ph بهینه فعالیت آنزیم تثبیت شده برابر با 8 بود. فعالیت آنزیم آزاد u/l 5/6073 و فعالیت آنزیم تثبیت شده به روش جذب سطحی و کوالان به ترتیب u/l 1728 و u/l 2134 به دست آمد. دمای بهینه فعالیت آنها بدون تغییر و در هر دو حالت 60 درجه سانتی گراد است اما آنزیم تثبیت شده به روش کوالان فعالیت بهتری نشان می دهد. آنزیم تثبیت شده به روش کوالان پس از 10 سیکل استفاده 68% فعالیت خود را حفظ می کند. واژه های کلیدی: آنزیم آلفا-آمیلاز، تثبیت اسپور، جذب سطحی، پیوند کوالان، nhs و edc

فعالیت های اقتصادی طی قرن گذشته افزایش یافته که این منجر به مشکلات به هم مرتبطی شده که نیازمند توجه فوری هستند. امروزه با توجه به مصرف بیش از حد پلاستیک ها، توسعه ی پلیمرهای زیستی قابل تخریب در طبیعت یک عنصر با اهمیت برای توسعه اقتصادی به شمار می رود. بین بیوپلیمرهای زیست تجزیه پذیر، پلی هیدروکسی آلکانوات ها (phas ) یک خانواده از پلی هیدروکسی استرهای 3- 4 – 5 و 6 هیدروکسی آلکانوئیک اسیدها هستند که توسط تعداد متنوعی از باکتری ها تحت شرایط محدود کننده رشد با کربن اضافی به صورت گرانول هایی در سیتوپلاسم این سلول ها تولید می شوند. این پلیمرهای ذخیره ای کربن و انرژی، نامحلول در آب و زیست تجزیه پذیر هستند، خواص ترموپلاستیک نشان می دهند و می توانند از منابع کربن تجدیدپذیر تولید شوند. در این مطالعه ابتدا تولید pha به وسیله سویه باکتری سودوموناس پوتیدای بومی با استفاده از روش متانولایزز و ft-ir مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که باکتری مذکور قادر به تولید pha است. سپس با استفاده از پرایمرهای مناسب و واکنش زنجیره ای پلیمراز ژن pha سنتاز این باکتری فزونسازی و تعیین توالی شد.

باکتری xanthomonas citri subsp. citri (xcc)، عامل بیماری شانکر آسیایی مرکبات می¬باشد که از بیماری¬های خسارت¬زا در بسـیاری از کشور¬های تولیدکننـده مرکبـات از جمله ایـران محسـوب می¬گردد. از اهداف بسیار مهم از گذشته تا به حال در زمینه بیماری¬شناسی مولکولی گیاهان، شناسایی عوامل دخیل در بیماری¬زایی می¬باشد، تا از این طریق راهی برای کنترل و ریشه¬کن کردن بیماری بیابیم. در این مطالعه از روش پروتئومیکس به¬منظور شناخت تفاوت-های ژنتیکی و اختصاصیت میزبانی سویه¬های تیپ a و a* در محیط تغذیه¬ای محدود (محیط کشت mm1) و محیط غنی (محیط کشت yp) استفاده شده است. بررسی پروتئین¬‎های بیماری‎زا در این باکتری با محدودیت زیادی روبرو است و در مقایسه با مطالعه ژنوم بر روی این پروتئین ¬ها و مخصوصاً پروتئین¬‎های ترشحی آن مطالعه کمتری صورت گرفته است. با کشت باکتری در یک محیط القایی فاقد فعالیت پروتئولیتیکی، پروتئین‎¬ها به درون محیط ترشح می¬شوند آن‎گاه می‎توان با بررسی پروتئوم خارج سلولی پروتئین¬‎های افکتور را شناسایی و مورد بررسی قرار داد. همچنین با استخراج پروتئین¬های سیتوزولی و غشایی می¬توان تغییر در بیان این پروتئین¬ها را نیز بررسی نمود و برای مقابله با بیماری تصمیم مناسب اتخاذ کرد. نتایج نشان می¬دهند که علی¬رغم وجود پروتئین¬های مشابه در پروفایل پروتئین¬های سیتوپلاسمی، غشایی و به¬ویژه ترشحی سویه¬های مورد مطالعه، تفاوت¬های معنی¬داری نیز در میان آن¬ها در شرایط مذکور دیده می¬شود. امید است که بتوان با شناسایی پروتئین¬های دخیل در بیماری¬زایی گامی در راستای پیشگیری و درمان این بیماری برداشت.