به منظور بررسی اثر تنش خشکی بر صفات مرفوفیزیولوژیک و تعیین تنوع ارقام گلرنگ با استفاده از نشانگر ssr، آزمایشی بصورت کرت های خردشده در قالب طرح بلوک های کامل تصادفی با 3 تکرار در مزرعه تحقیقاتی دانشگاه زابل واقع در سد سیستان مورد مطالعه و مقایسه قرار گرفتند. عامل اصلی تنش خشکی شامل: آبیاری 50 درصد ظرفیت مزرعه (تنش شدید)، آبیاری 70 درصد ظرفیت مزرعه (تنش ملایم)، آبیاری 90 درصد ظرفیت مزرعه (شاهد) و عامل فرعی شامل رقم های گلدشت، نایین، ورزنه، اصفهان، فرامان، سینا، mec11، mce184، mce33) بود. صفات عبارتند از: ارتفاع بوته، تعداد ساقه جانبی، تعداد شاخه فرعی فرعی، قطر ساقه تعداد طبق در بوته، وزن هزار دانه، عملکرد دانه، عملکرد بیولوژیک، شاخص برداشت، درصد روغن، کربوهیدرات، پرولین، شاخص کلروفیل، کارتنویید، آنزیم های آنتی اکسیدانی بودند. همچنین جهت بررسی تنوع ژنتیکی نمونه ها از نشانگر ssr استفاده شد. طبق نتایج تجزیه واریانس اثر رقم ها بر تمامی صفات مورد اندازه گیری معنی دار بود. در بین ارقام مورد بررسی رقم فرامان بیشترین میزان تعداد ساقه جانبی، عملکرد، وزن هزاردانه و شاخص کلروفیل را داشت که این موضوع سازگاری بیشتر این رقم را به شرایط خشک منطقه سیستان نشان داد و رقم فرامان نسبت به دیگر ارقام برتری کافی از خود نشان داده است. همچنین بیشترین چند شکلی، pic و شاخص شانون در بین نشانگرهای مورد استفاده در نشانگر ssr33 مشاهده شد که این نشان دهنده برتری این پرایمرها نسبت به دیگر پرایمرهای مورد مطالعه می باشد. ابتدا تجزیه های آماری شامل تجزیه واریانس، مقایسه میانگین و محاسبه همبستگی بین صفات به وسیله نرم افزار sas انجام شد و جهت آنالیز داده های ژنتیکی از نرم افزار ntsys, genalexو popgen32 استفاده گردید.