نام پژوهشگر: سهیلا طالش ساسانی

بررسی امکان شناسایی 30 سیب محلی ایران با مارکر مولکولی ssr
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم کشاورزی 1388
  سید ابوالفضل حسنی   منصوره کشاورزی

انواع مارکرها برای شناسایی صحیح ژنوتیپ ها و ارقام گیاهی قابل استفاده هستند. از آنجایی که مارکر ریزماهواره هم بارز و فراوانند و نیز قابلیت تکثیر قابل اطمینانی دارند، در تحقیق حاضر، برای بررسی امکان شناسایی 33 ژنوتیپ سیب (malus domestica borkh) بومی ایران مورد استفاده قرار گرفتند. نمونه های گیاهی در سال 1388 از کلکسیون موسسه تحقیقات و اصلاح نهال و بذر کرج تهیه شدند و در دانشگاه گیلان مورد بررسی قرار گرفتند. ژنوتیپ های مذکور به وسیله 14 جایگاه ژنی توصیفی ssr جهت تعیین هویت مولکولی تفکیک شدند. در مجموع، 83 آلل چند شکل در این 14 جایگاه ژنی (به طور متوسط 5/92 آلل در هر جایگاه ژنی) نمایان شدند و محتوای اطلاعات چند شکلی به طور میانگین 0/71 بود. دندروگرام به طور یکسان برای داده های مورفولوژیک و مولکولی بر اساس روش upgma رسم شد و ژنوتیپ ها در 7 و 6 گروه اصلی قرار گرفتند. همسانی بالایی میان نتایج مشاهده شد. نشانگر های ریزماهواره مورد استفاده در این مطالعه توانستند با دقت بالاتری تنوع ژنتیکی میان ژنوتیپ ها را نشان دهند. تجزیه به مختصات اصلی، تجزیه کلاستر را جهت مشخص نمودن ارتباط مابین ژنوتیپ ها تایید نمود

بررسی تنوع ژنتیکی کیفیت نانوایی ارقام گندم با استفاده از آغازگرهای اختصاصی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان 1389
  هیرسا مصطفی پور کندلوس   حسن حسنی کومله

جهت تعیین تنوع ژنتیکی تعدادی از لاین ها و ارقام گندم نان از نظر ژن های کنترل کننده زیرواحدهای گلوتنین با وزن مولکولی بالا (hmw-gs)، 37 رقم گندم هگزاپلوئید، از نظر شش جفت آغازگر اختصاصی برای مکان های ژنی glu-a1 ، glu-b1، glu-d1استفاده شد. برای تفکیک محصولات واکنش pcr از ژل آگارز دو درصد استفاده شد. ارقام گندم با استفاده از روش تجزیه خوشه ای همبستگی متوسط و بر مبنای ضریب تطابق ساده، در 10 گروه قرار گرفتند. روش همبستگی متوسط به خوبی توانست ارقام دارای آلل های مشترک را در یک گروه قرار دهد. ارقام نیک نژاد، شیرودی، تجن، اترک، نوید، 11199 دارای ترکیب آللی مناسب (ax1+ax2* ،bx7 ،dx5+dy10) از نظر ژن های کنترل کننده کیفیت نانوایی بودند. بالاترین محتوای اطلاعات چندشکلی در ارقام مورد مطالعه مربوط به آغازگر ax1+ax2* (برابر با 491/0) و کمترین آنها مربوط به آغازگر dy12 (برابر با 368/0) بود.

بررسی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های مختلف توتون (nicotiana tabacum l.) از طریق نشانگرهای مرفولوژیکی و مولکولی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان 1390
  محمد محسن زاده گلفزانی   علی اعلمی

تنوع ژنتیکی 49 ژنوتیپ منتخب از موسسه تحقیقات توتون رشت با استفاده از 12 نشانگر issr، 3 نشانگر رتروترانسپوزون و یک نشانگر ترکیبی issr و رتروترانسپوزون مورد ارزیابی مولکولی و همچنین با 14 صفت مورد ارزیابی مرفولوژی قرار گرفت. با استفاده از 16 آغازگر تعداد 147 نوار چندشکل به دست آمد، که از بین آغازگرهای مورد استفاده، آغازگر tos-2 با 16 نوار و بعد از آن، آغازگرهای ubc811 و tos-1 با 14 نوار بیشترین و آغازگرهای ubc825 و tos-3 با 4 نوار کمترین تعداد نوار چندشکل را ایجاد نمودند. pic نشانگرها بین 27/0 تا 46/0 و mi از 15/1 تا 87/5 متغیر بود. تجزیه به مختصات اصلی نشان داد که دو مولفه اول توانستند مجموعا 75/16 درصد از واریانس کل را توجیه کند. تجزیه خوشه ای به روش upgma، 49 ژنوتیپ مورد مطالعه را در پنج گروه قرار داد، به ترتیب شامل 9، 4، 1، 13 و 22 ژنوتیپ شدند. صحت گروه بندی حاصل از تجزیه خوشه ای توسط تابع تشخیص کانونی به روش خطی فیشر با 6/79 درصد تائید شد. نتایج حاصل از تجزیه واریانس صفات مرفولوژی براساس طرح مربع لاتیس نشان داد که مزیت نسبی این طرح نسبت به طرح بلوک های کامل تصادفی برای تعدادی از صفات خوب می باشد. بیشترین ضریب همبستگی بین عملکرد برگ سبز با عملکرد برگ خشک (845/0) بدست آمد. تجزیه خوشه ای به روش upgma، ارقام مورد مطالعه را در پنج گروه مجزا قرار داد که به ترتیب 6، 1، 25، 4 و 13 ژنوتیپ در گروه ها قرار گرفته شد. صحت گروه بندی حاصل از تجزیه خوشه ای با تابع تشخیص کانونی به روش خطی فیشر 8/87 درصد بود. نتایج حاصل از تجزیه به عامل ها جهت تعیین میزان اشتراک وگروه بندی ارقام و بررسی ضرایب همبستگی بین صفات، براساس مولفه های اصلی پس از چرخش وریماکس چهار عامل با نام های خصوصیات برگ، فنولوژی، قیمت، خصوصیات دوم برگ در مجموع 19/79 درصد از تغییرات بین صفات را توجیه نمود.

شناسایی برخی ژنهای مرتبط با بیماری زایی rhizoctonia solani (ag1-ia) با استفاده از سیستم مخمری yst
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم زیستی 1398
  سهیلا طالش ساسانی   بهرام محمد سلطانی

سوختگی غلاف برنج، ناشی از حمله پاتوژن ag1-ia rhizoctonia solani ، از بیماری های مخرب در نواحی برنج خیز جهان و ایران می باشد. آشنایی با مکانیسم های مولکولی بیماری می تواند گامی در جهت دستیابی به روشهای جدید مقابله با آن باشد. نقش موثر پروتئینهای ترشحی pita در بیماریزایی برخی از پاتوژنها مشخص شده است. در تحقیق حاضر بر آن شدیم تا وجود یک ژن کد کننده پروتئین ترشحی pita را برای اولین بار در بیمارگر ag1-ia rhizoctonia solani نشان دهیم. همچنین، امروزه نقش mirna ها در بیماریزایی و دفاع گیاهان مشخص شده است. بنابراین، تغییرات بیانی چندین mirna ی کاندیدا در برنج آلوده به این بیمارگر مورد بررسی قرار گرفت. یک توالی est گزارش شده از r. solani، با توالی پایین دست ژن pita ی magnaporthe oryzae شباهت زیادی نشان می داد. پس، با انجام روش rage تغییر یافته، توالی بالادست این ژن در r. solani بدست آمد. سپس یک signal peptide ترشحی در بالادست این توالی پیش بینی و با استفاده از سیستم مخمری pystکار آمدی آن در ترشح پروتئین مربوطه نشان داده شد. همچنین، وجود و تکامل سریع همین ژن در ایزوله های جغرافیایی ایران از طریق تکثیر و تعیین توالی نشان داده شد. الگوی بیانی این ژن در سنین مختلف قارچ نشان داد که از روز چهارم رشد، بیان این ژن در میسلیوم ها قابل تشخیص بوده و با افزایش سن تغییری نمی کند. در مجموع با توجه به تشابه توالی بسیار زیاد این ژن با mg. avr-pita و نیز خاصیت ترشحی بودن و تکامل سریع آن، این ژن rhiz-pita نامیده شد و در ebi ثبت گردید َ(acc# lk999997) در این تحقیق با هدف کسب اطلاعات بیشتر در مورد مکانیسم بیماری زایی این پاتوژن و میانکنش آن با میزبان، تغییرات بیان تعدادی mirna ی منتخب با استفاده از real-time pcr انجام شد. با توجه به نتایج حاصل، osa-mir156 در برنج بعنوان یک مارکر زود پاسخگو (early responsive) ، وosa- mir 171, osa-mir 167, osa- mir 159, osa- mir 408 وmir 444 osa- دربرنج بعنوان مارکرهای دیر پاسخگو (late responsive) به این بیمارگر پیشنهاد میشوند. روی هم رفته، تحقیق حاضر ضمن معرفی یک ژن pita ی جدید برای بیمارگر r. solani ، مجموعه ای از mirna های گیاه را بعنوان نشانگر مراحل پیشرفت بیماری پیشنهاد می نماید.

ارزیابی تنوع ژنتیکی در لاین های مختلف کلزا با استفاده از صفات مورفولوژیکی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان 1386
  مریم احمدزاده   حبیب اله سمیع زاده لاهیجی

چکیده ندارد.

مطالعه تنوع ژنتیکی جدایه های erwinia amylovora در استان گیلان با استفاده از نشانگر rapd
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه گیلان - دانشکده علوم کشاورزی 1386
  سمیه رضوانی خورشیدی   حبیب اله سمیع زاده

چکیده ندارد.