نام پژوهشگر: محمد رضا زالی

ارزیابی وقوع جهشهای ژنتیکی متنوع در کل ساختار ژنوم ویروس هپاتیت ب در بیماران مبتلا به عفونت هپاتیت با شرایط بالینی مختلف
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس 1388
  سید رضا محبی   محمد رضا زالی

عفونت ویروس هپاتیت ب یکی از شایعترین عفونتهای ویروسی و از عوامل مهم بروز مشکلات کبدی، سیروز و سرطان کبد در دنیا می باشد. بیش از 350 میلیون نفر در سراسر جهان به عفونت مزمن hbv دچار می باشند. حدودا 10% از افراد بالغ و 90% کودکان پس از عفونت با hbv، حاملین دائمی ویروس می گردند و یک تا دو میلیون نفر هر ساله بر اثر عوارض مرتبط با عفونت hbv جان خود را از دست می دهند. اینکه چه عواملی بر تفاوت وضعیت بالینی در عفونت hbv موثر است، چندان شناخته شده نمی باشد. hbv از آنزیم رونویسی کننده معکوس برای تکثیر ژنوم خود استفاده می کند و با توجه به اینکه این آنزیم قابلیت تصحیح خطا را ندارد، ژنوم ویروسی جهش یافته به میزان زیادی بروز پیدا می کند. ژنهای hbv با یکدیگر همپوشانی دارند. بنابراین تنوع ژنتیکی در ژنوم hbv بر ژنهای مختلف آن می تواند تاثیر گذارد. پاتوژنز عفونت hbv احتمالا با بروز و انتخاب این انواع جهش یافته ویروس ارتباط دارد. هدف از این پژوهش، تعیین ژنوتیپ، تحت ژنوتیپ و تحت تیپ ویروس و همچنین بررسی و مقایسه الگوی وقوع جهشهای ژنتیکی در کل ساختار ژنوم hbv با توجه به وضعیت بالینی بیمار می باشد. به این منظور در مرحله اول dna ویروس از نمونه سرم 260 بیمار دچار عفونت مزمن استخراج گردید و بخشی از ناحیهs و کل ناحیه core با روش nested pcr تکثیر گردید و توالی آنها تعیین گردیدند. پس از بررسی این توالیها و تحلیل آنها با روش های فیلوژنتیک، ژنوتیپ، تحت ژنوتیپ و تحت تیپ کلیه نمونه ها تعیین گردید. در مرحله بعد با توجه به شرایط بالینی بیماران سه گروه 20 تایی حاملین غیر فعال، بیماران دچار عفونت مزمن فعال و بیماران دچار سیروز کبدی تعیین گردیده و dna ویروس از نمونه سرم این بیماران استخراج شده و با استفاده از روش های مختلف و پرایمر های متنوع کل ژنوم آنها تکثیر گردیده و پس از استخراج تحت فرایند تعیین توالی قرار گرفتند. تحلیل فیلوژنتیک بر روی کل ژنوم بیماران هم صورت گرفت و سپس وقوع جهش در مناطق مختلف ژنوم این بیماران مورد بررسی قرار گرفته و با هم مقایسه شد. 100% نمونه ها متعلق به ژنوتیپ d بوده و اکثریت آنها که شامل 258 ایزوله بودند به تحت ژنوتیپ d1 (23/99%) تعلق داشتند. یک ایزوله با تحت ژنوتیپ d2 (38/0%) و یک ایزوله دیگر هم جزو تحت ژنوتیپ d3 (38/0%) شناسایی گردیدند. 86/96% ایزوله ها به تحت تیپ ayw2،69/2% تحت تیپ ayw1 ، 92/1% ayw3 و77/0% تحت تیپ ayw4 تعلق داشتند. تحت تیپ یک ایزوله (38/0%) قابل تشخیص نبود. در بررسی کل ژنوم 60 بیمار گروه های بالینی مختلف هم کلیه بیماران به ژنوتیپ d، تحت ژنوتیپ d1 تعلق داشتند. بررسی جهش در کل ژنوم بیماران با شرایط بالینی مختلف نشان دهنده بالاتر بودن میزان جهش های متنوع در گروه بیماران دچار سیروز کبدی بودند اما اختلاف آماری معنی دار تنها در جهش g1896a و g1899a میان این گروه و حاملین غیر فعال مشاهده گردید. به نظر می رسد تجمع جهش های ژنتیکی به خصوص در این دو جایگاه، با پیشرفت بیماری به سوی سیروز کبدی ارتباط داشته باشد.

بررسی تاثیر سرمایه فکری بر گرایش کارآفرینانه و عملکرد سازمانی در کسب و کارهای نانو در ایران
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران 1389
  میر محسن مهدی وند کلانسرا   محمد رضا زالی

در اقتصاد مبتنی بر دانش، محصولات و سازمانها براساس دانش زندگی می کنند و می میرند و موفق ترین سازمانها آنهایی خواهند بود که از سرمایه فکری خود به نحو موثری در جهت خلق و افزایش ارزش سازمانی استفاده می کنند. از طرفی دیگر، در چنین عصری که تغییرات در زمینه های گوناگون به سرعت اتفاق می افتد، کامیابی از آن سازمانهایی است که بتوانند بین منابع دانش محور و عملکرد سازمان خود ارتباط معنی داری برقرار سازند. در چنین فضایی، بازارهای آینده از آن شرکت هایی است که به ریسک پذیری کارآفرینانه بهاء می دهند و برای گسترش سرمایه فکری خود در حد کلان سرمایه گذاری می کنند. از این رو، گرایش به سمت کارآفرینی به یکی از مهم ترین فعالیت سازمانها تبدیل شده است. در اکثر پژوهش های انجام شده، تاثیر سرمایه فکری بر عملکرد سازمانی به طور مستقیم مورد بررسی قرار گرفته و نقش عواملی که می تواند این ارتباط را تحت تاثیر قرار دهند، نادیده گرفته شده است. لذا تحقیق حاضر درصدد است علاوه بر تاثیر مستقیم، تاثیر غیرمستقیم سرمایه فکری بر عملکرد سازمانی را از طریق گرایش کارآفرینانه مورد بررسی قرار دهد. برای انجام تحقیق، اطلاعات لازم به وسیله پرسشنامه(ضریب آلفای، 91.9%) از 91 کسب و کار تولید کننده محصولات نانویی در ایران جمع آوری گردید. روش تحقیق حاضر نیز، مبتنی بر متدولوژی مدل یابی معادلات ساختاری می باشد. در نهایت، نتایج تجزیه و تحلیل داده ها نشان داد که از بین ابعاد تشکیل دهنده سرمایه فکری، سرمایه های انسانی و رابطه ای هم به طور مستقیم و هم غیرمستقیم و سرمایه ساختاری تنها به طور غیرمستقیم و از طریق گرایش کارآفرینانه برعملکرد سازمانی تاثیر معناداری دارند. نتایج به دست آمده، بیانگر این است که گرایش کارآفرینانه بین سرمایه های فکری و عملکرد سازمانی، به عنوان متغیر میانجی عمل می کند.

بررسی رابطه علی عناصر سرمایه های فکری و عملکرد سازمان " شرکتهای تالار اصلی بورس اوراق بهادار تهران"
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران 1389
  یاسر عبدی   مهرداد مدهوشی

هدف پژوهش حاضر، بررسی رابطه علی عناصر سرمایه های فکری و عملکرد سازمان در شرکت های تالار اصلی بورس اوراق بهادار تهران می باشد. برای انجام این پژوهش توصیفی، مقطعی و کاربردی از داده های مربوط به شرکت های حاضر در تالار اصلی بورس اوراق بهادار تهران استفاده گردید. در ضمن جامعه ی آماری پژوهش حاضر کلیه 114 شرکت پذیرفته شده در تالار اصلی بورس اوراق بهادار تهران می باشد که شش مورد از شرکت های مدنظر به علت نداشتن اطلاعات مورد نظر برای محاسبه متغیرهای سرمایه فکری و عملکرد سازمانی از لیست تحلیل خارج و در نهایت 108 شرکت به عنوان نمونه آماری انتخاب گردید. در ضمن برای تجزیه و تحلیل داده ها از نرم افزارهای spss16 و lisrel8.5 استفاده گردید. در ضمن، الگوی تبیین کننده روابط سرمایه فکری با عملکرد سازمانی در صنایع مورد مطالعه، نشان داده است که متغیر سرمایه فرایندی با 0.24 بیشترین و سرمایه مشتری با 0.015 کمترین میزان تبیین-کنندگی را داشته اند و در کل مدل برازندگی خوبی از دنیای واقعی داشته است.

روش های جانهی در داده های چند شکلی تک نوکلئوتیدی(snp) گم شده به صورت غیرتصادفی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پزشکی 1390
  محمود علیپورحیدری   حمید علوی مجد

هنگامی که با داده های گم شده سر و کار داریم، توجه به مکانیزم گم شدن داده ها در استنباط آماری از اهمیت زیادی برخوردار است. کنار گذاشتن داده های گم شده به خصوص در شرایطی که مکانیزم گم شدن تصادفی نباشد، موجب مخدوش شدن نتایج تحلیل خواهد شد. در حال حاضر با استفاده از تحلیل های آماری، ارتباط بین چندریختی تک-نوکلئوتیدی (snp) با برخی از بیماری ها مورد توجه بسیاری از محققین می باشد. همچنین داده های snp گم شده، در مطالعات ارتباط سنجی ژنتیکی متداول است. لذا در این مطالعه، ارتباط بین snpهای موجود در ژن dnmt1 از کروموزوم 19 انسان را با بیماری سرطان روده بزرگ، مورد بررسی قرار دادیم. هدف از این مطالعه، ارایه روش جانهی در داده هایی با snpهای گم شده به صورت غیرتصادفی است. در این مطالعه مورد-شاهدی، از بین بیماران مراجعه کننده به مرکز تحقیقات بیماری های گوارش و کبد دانشگاه علوم پزشکی شهید بهشتی تعداد یکصد بیمار مبتلا به بیماری سرطان روده بزرگ، به عنوان گروه مورد و یکصد نفر از سایر بیماران را به عنوان گروه شاهد تحت مطالعه قرار داده و آزمایشات ژنتیکی، جهت تعیین ژنوتیپ 6 مورد snp از ژن dnmt1 از کروموزوم 19 انسان، برای این بیماران انجام گردید. داده های حاصل با استفاده از روش رگرسیون لجستیک مورد تجزیه و تحلیل آماری قرار گرفت. سپس با حذف بخشی از داده ها به دو روش تصادفی و غیرتصادفی و جانهی آن ها با استفاده از الگوریتم em، تغییرات ضرایب رگرسیون لجستیک را قبل و بعد از این کار مقایسه نمودیم. یافته ها نشان داد که در هر دو روش گم شدن تصادفی و غیر تصادفی داده های snp، برآورد ضرایب رگرسیون لجستیک پس از جانهی توسط الگوریتم em، در مقایسه با روش حذف داده های گم شده، انطباق بیشتری با نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل داده های کامل دارند.

بررسی تغییر الگوی بیان ژنها در پاسخ به دو واریانت غالب انکوپروتئین cagaهلیکوباکتر پیلوری در سل لاین ags
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پزشکی 1392
  فرزام وزیری   شهین نجار پیرایه

هلیکوباکتر پیلوری بعنوان شایع ترین عامل باکتریایی مسبب گاستریت مزمن محسوب می گردد که با بیماری های زخم معده و سرطان معده در ارتباط است. پروتئین caga هلیکوباکتر پیلوری اولین انکوپروتئین باکتریایی شناخته شده دخیل در ارتباط با سرطان در انسان می باشد. caga از طریق سیستم ترشحی تیپ iv وارد سلول های اپیتلیال معده شده، در نزدیکی غشای سلولی قرار گرفته و در آن جا توسط کینازهای سلولی تحت تیروزین فسفوریلاسیون قرار می گیرد. caga دارای تنوع ساختاری در ناحیه c - ترمینال خود می باشد که از طریق این ناحیه با پروتئین های میزبانی متعددی واکنش می دهد. این پلی مورفیسم به علت وجود ترکیب های متفاوت چهار موتیف epiya می باشد که در مجموع c – ترمینال این پروتئین را تشکیل می دهند. تنوع ساختاری پروتئین caga تاثیر قابل ملاحظه ای بر فعالیت پاتوفیزیولوژی این انکوپروتئین دارا می باشد. هدف از مطالعه حاضر، درک تاثیر تیپهای مختلف caga بر اساس موتیفهای epiya، بر مسیرهای سیگنالینگ شناخته شده در ایجاد سرطان معده می باشد. از میان 71 بیمار، 60 نفر دارای گاستریت مزمن، 7 نفر duodenitis، 2 نفر intestinal metaplasia، 1 نفر هایپرپلازیا و 1 نفر سرطان معده بودند. تمامی جدایه ها از نظر خصوصیات ژنی caga ، vaca ، icea و baba تحت ژنوتیپینگ قرار گرفتند که فراوانی ژنهای caga، vacas1، vacas2، vacam1، vacam2، icea1، icea2، icea1+icea2 و baba2 بترتیب 62%، 9/78%، 7/19%، 1/21%، 9/78%، 5/15%، 5/22%، 8/40% و 8/95% بود. در ژنوتیپ های ترکیبی تنها ترکیپ ژنوتیپی caga+/vacas1m1/icea2/baba ارتباط معناداری را با بیماری گاستریت مزمن شدید فعال نشان داد( p=0.025). در بین 44 ایزوله caga مثبت، با غربالگری سویه های تحت بررسی از نظر تنوع موتیف های epiya ، موتیفهای epiya abc (30 ایزوله)، abcc (4 ایزوله)، abccc (1 ایزوله)، تیپهای میکس (6 ایزوله) و تیپ جدید a-b/c (3 ایزوله) مشاهده شد. بررسی این ترادف ها همچنین حضور موتیف های اسید آمینه ای شبیه به epiya یعنی epiyt و qpiyp را نشان داد. به منظور بررسی اثرات تنوعات پروتئینی ناحیه کربوکسی caga در بیان ژن های دخیل در مسیرهای سرطانزایی بافت معده، دو واریانت ژنی ناحیه epiya abc) و (abccc در وکتور بیانی یوکاریوتی pegfp-n1 که حاوی فیوژن gfp می باشد کلون شد. در فاز دوم پس از کشت دادن سل لاین ags، ناقل بیانی یوکاریوتی حامل ژن caga به داخل کشت سلولی سرطان معده ترانسفکت شد. برای تایید بیان caga در کشت سلولی سرطان معده، از دو روش ایمونوبلاتینگ و میکروسکوپ فلورسنس استفاده شد. در فاز سوم rna سلولهای ترانسفکت شده به کمک کیت استخراج شده و سپس از روی rna به دست آمده cdna سنتز شد. سپس 44 ژن کلیدی شناخته شده در سرطان معده در سطح نسخه برداری به کمک روش real-time pcr بررسی شدند. در نهایت جابجایی کمپلکس های غشایی بتا کتنین مرتبط با سیگنالینگ بیان ژن های مرتبط با سرطانزایی بروش ایمونوسیتوشیمی بررسی شد. بر اساس بررسی نتایج real-time pcr نشان داد که در 12 گروه ژنی طبق بندی شده، در 11 گروه تیپ abccc به میزان بیشتری از تیپ abc سبب تغییر در میزان رونویسی از ژنهای تحت مطالعه شده است، که این تفاوت در مورد ژنهای مرتبط با سرطانزایی تفاوت معنا داری را نشان داد. نتیجه بررسی جابجایی کمپلکس های غشایی نشان داد که واریانت caga حاوی موتیف abccc این توانایی را به شکل واضحتری نسبت به موتیف abc از خود نشان داده بود، که این مطلب می تواند دلیل دیگری بر قدرت بیشتر سرطانزایی تپپ abccc در مقابل تیپ abc می باشد. نتایج تحقیق ما بدون شک موید این مطلب می باشد که تیپ caga می تواند تعیین کننده ریسک افزایش یافته سرطان معده باشد، بطوریکه شانس ابتلا به سرطان معده در فردی که آلوده به هلیکوباکتر پیلوری با caga از تیپ abccc باشد نسبت به فردی که توسط هلیکوباکتر پیلوری با caga از تیپ abc آلوده شده باشد ، بسیار بیشتر خواهد بود.

تعیین کلون غالب انتروکوکوس فسیوم چند مقاومتی در نمونه های بالینی با روشهای الکتروفورز میدان پالسی (pfge) و تایپینگ سکانس چند ناحیه ای (mlst)
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پزشکی 1392
  لیلی شکوهی زاده   محمد رضا زالی

در سال های اخیر، انتروکوکوس فسیوم چند مقاومتی(mdr) به عنوان یک پاتوژن مهم بیمارستانی در نظر گرفته شده است. انتروکوکوس فسیوم برای مدت طولانی در خارج از بدن انسان و در محیط بیمارستان می تواند زنده بماند و آلودگی متقابل بین بیماران و محیط بیمارستان رخ دهد. مجموعه کلونال 17(cc17 ) زیر مجموعه ژنتیکی بزرگ انتروکوکوس فسیوم در بیمارستان ها در سراسر دنیا می باشد. تا به حال گزارشی از کلون های غالب انتروکوکوس فسیوم در بیمارستان های ایران وجود ندارد. این مطالعه بر بررسی ارتباط ژنتیکی و تعیین کلون های رایج سویه های انتروکوکوس فسیوم ایزوله شده از بیماران بستری در چهار بیمارستان اصلی آموزشی درتهران متمرکز شده است. 520 نمونه بالینی ( ادرار، زخم ، خون ، مایع پلور، آبسه ، خلط ، صفرا ، تراشه) از بیماران بستری و 85 نمونه محیطی (ملحفه، تخت، نوک کاتتر، چارت بیمار، ونتیلاتور ، دست پرسنل و پمپ سرنگ در بخش icu) از چهار بیمارستان اصلی آموزشی تهران در خلال شهریور 1390 تا خرداد 1391جمع آوری گردید. الگوهای مقاومت آنتی بیوتیکی و حداقل غلظت مهاری (mic) ونکومایسین، آمپی سیلین و جنتامیسین به روش های دیسک دیفیوژن و آگار دایلوشن ، حضور ژن های مقاومت به ونکومایسین و ژن ویرولانس esp به روش pcr بررسی شد، ارتباط ژنتیکی در 45 سویه چند مقاومتی انتروکوکوس فسیوم به روش الکتروفورز میدان پالسی (pfge) مورد بررسی قرار گرفت. از میان این 45 سویه، 21 سویه بر اساس تفاوت در نتایج pfge، تاریخ جداسازی، نوع نمونه، بیمارستان و بخش به منظور تعیین کلون غالب انتروکوکوس فسیوم در بیمارستان های مورد مطالعه انتخاب و سرانجام با استفاده از تکنیک تایپینگ سکانس چند ناحیه ای (mlst ) شناسایی شدند. در مجموع 162 ایزوله انتروکوک از نمونه های بالینی و 28 نمونه محیطی جمع آوری گردید. در نمونه های بالینی و محیطی به ترتیب ( 44%)59 و ( 41%)12 سویه انتروکوکوس فسیوم شناسایی گردید. بیش از (57 )96% و ( 5)40% از این ایزوله ها الگوی چند مقاومتی را نشان دادند که (32)54% و (3)25% آنها به ونکومایسین مقاوم بودند. تمامی سویه های مقاوم به ونکومایسین دارای ژن vana بودند. مقاومت همزمان به ونکومایسین، تیکوپلانین، آمپی سیلین، جنتامیسین، سیپروفلوکساسین، اریترومایسین و نیتروفورانتوئین در بیش از 50% سویه های انتروکوکوس فسیوم مشاهده گردید. ژن esp به ترتیب در (43)74%و (2)16% سویه های بالینی و محیطی انتروکوکوس فسیوم شناسایی شد. آنالیز نتایج pfge وmlst به ترتیب 17 پالسو تایپ و 15 سکانس تایپ را مشخص کرد. (18)86% سویه ها متعلق به cc17 بودند. دوازده st جدید برای اولین بار در این مطالعه گزارش گردید. تقریبا 50% stها مرتبط با st203 بودند. پالسوتایپ های c , d و f و سکانس تایپ های 203 و 740 در سویه های بالینی و محیطی شناسایی شدند. نتایج این مطالعه انتشار پلی کلونال سویه های انتروکوکوس فسیوم با الگوهای مقاومتی پرخطر با غالبیت cc17 را در بیمارستان های تهران نشان می دهد. حضور سویه های متعلق به cc17انتروکوکوس فسیوم در محیط بیمارستان نشان دهنده احتمال انتشار آنها بین بیماران و محیط بیمارستان های مورد مطالعه می باشد.

بررسی تأثیر منابع اجتماعی اطلاعات بر یادگیری کارآفرینانه در صنعت قطعه سازی خودرو ایران
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران 1387
  مژده مخبر   محمد رضا زالی

چکیده: پژوهش حاضر به بررسی تاثیر منابع اجتماعی اطلاعات بر یادگیری کارآفرینانه در صنعت قطعه سازی خودرو اختصاص دارد. همچنین اثر تعدیل کنندگی هوشیاری کارآفرینانه و گرایش به کارآفرینی بر رابطه منابع اجتماعی اطلاعات و یادگیری کارآفرینانه مورد سنجش قرار گرفته است. در این تحقیق منابع اجتماعی اطلاعات بر اساس تحقیقات پیشین، شامل نشست های خانوادگی ، حضور مربی، شبکه های صنعتی غیررسمی ، و نشست های حرفه ای می باشد. برای انجام این تحقیق اطلاعات لازم به وسیله پرسشنامه از 160 نفر از مالکان کسب و کارهای کوچک و متوسط صنایع قطعه سازی خودرو ایران جمع آوری گردید و مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. برای بررسی اعتبار بیرونی پرسشنامه از روش آلفا کرونباخ استفاده گردید که ضریب آلفا معادل88% می باشد. نتایج نشان می دهد که دو منبع اجتماعی اطلاعات ــ حضور مربی (0.24) و نشست های حرفه ای(0.30) ــ تاثیر مثبت بر یادگیری کارآفرینانه دارند و نشست ها خانوادگی و شبکه های صنعتی غیر رسمی بر یادگیری کارآفرینانه بی تأثر اند . همچنین دو متغیر هوشیاری کارآفرینانه و گرایش به کارآفرینی بر رابطه بین منابع اجتماعی اطلاعات و یادگیری کارآفرینانه تاثیر دارند. تاثیر هوشیاری کارآفرینانه بر این رابطه (38% )و تاثیر گرایش به کارآفرینی بر این رابطه (33%) می باشد.