چکیده بندر امام خمینی(ره) در انتهای شمال غربی خلیج فارس به وسیله آبراهه خور موسی به این خلیج متصل می شود. آلودگی ناشی از تردد نفتکش ها، حوادث و سوانح مربوط به رفت و آمد کشتیها، منابع و صنایع مستقر در خشکی از جمله عوامل آلودگی و تأثیرگذار بر روی اکولوژی این منطقه است. در این بین آلودگی فلزات سنگین از اهمیت ویژه ای برخوردار است. فلزات سنگین جزء آلاینده های پایدار می باشند و از جمله آلاینده هایی می باشند که قابلیت تجزیه بیولوژیکی ندارند و ممکن است ضمن ورود به بدن آبزیان در آنها تجمع نمایند. در بین نرم تنان، دوکفه ای ها مهم ترین گروهی هستند که به عنوان شاخص آلودگی و پایش محیط به کار می روند. به منظور بررسی وضعیت بندر امام خمینی از نظر غلظت فلزات جیوه، مس و سرب و برآورد انباشتگی این فلزات سنگین در صدف دوکفه ای crassostrea gigas و همچنین بررسی امکان استفاده از این گونه به عنوان پایشگر زیستی آلودگی فلزات سنگین، نمونه های رسوب و صدف از منطقه بین جزرومدی بندر امام خمینی در بهمن 1387 و تیر 1388 جمع آوری گردید. نمونه ها پس از انتقال به آزمایشگاه و آماده سازی، محتوی جیوه ی آن ها با دستگاه مرکوری آنالایز مدل zeeman mercury analyzer ra-915+ اندازه گیری شد. سنجش غلظت فلزات سنگین مس و سرب توسط دستگاه ica-pes سری icp6000 ساخت شرکت thermo کشور انگلستان صورت گرفت. نتایج نشان داد که میانگین غلظت جیوه، مس و سرب رسوبات بندر امام خمینی به ترتیب 77/0±39/1، 71/2 ±82 / 13 و 55/1±94/6میکروگرم بر گرم وزن خشک بود. میانگین غلظت فلزات سنگین جیوه، مس و سرب در بافت نرم صدف ترتیب 04/3±52/5، 51/143± 01/662 و 46/4 ± 90/11 میکروگرم بر گرم وزن خشک بود. حال آنکه میانگین غلظت این فلزات در پوسته صدف به ترتیب 04/0 ± 184/0، 49/0 ± 27/2 و 33/0 ± 84/1 میکروگرم بر گرم وزن خشک بود. نتایج نشان داد که غلظت فلزات جیوه در رسوب دو فصل تابستان و زمستان تفاوت معنی داری نداشت. بین غلظت فلزات مس و سرب در رسوب دو فصل تابستان و زمستان تفاوت معنی داری مشاهده شد. میزان جیوه در بافت نرم صدف در زمستان بیشتر از تابستان بود ولی میزان سرب و مس در تابستان بیشتر بود. در بین ایستگاه ها داک سرسره نسبت به سایر ایستگاه ها آلوده تر بود. نتایج بدست آمده در این تحقیق با مقادیر حاصل از مطالعات دیگران و استانداردهای موجود مقایسه شدند. این مقایسات نشان دادند که تنها غلظت جیوه اندازه گیری شده در رسوب بالاتر از حد مجاز بود. ولی میزان فلزات جیوه، مس و سرب در بافت نرم بالاتر ازحد مجاز بودند و می توانند خطر ساز باشد. همبستگی معنی داری بین غلظت فلز سرب و جیوه بافت نرم صدف c. gigas و رسوب ، مشاهده شد. درنیجه این بافت برای پایش زیستی فلز سرب در این سواحل مناسب می باشد. همبستگی مثبت معنی دار در بین غلظت فلزات مس، سرب بافت سخت و رسوب منطقه مشاهده شد که نشان می دهد که پوسته صدف c. gigas برای پایش زیستی این فلزات مناسب می باشد.