ذرات سولفید کادمیم به عنوان یک ترکیب کم محلول قابلیت تشکیل به فرم نانو ذرات را در شرایط مساعد دارا می باشد.این نانو ذرات به صورت خودبخودی فلورسانس قابل توجهی ندارند, لیکن هنگامیکه توسط یک ترکیب مناسب پوشیده شوند میزان فلورسانس آنها به مقدار قابل توجهی افزایش پیدا می کنند. بررسی عوامل تاثیر گذار بر کاهش فلورسانس این ترکیب می تواند راهگشا در انتخاب یک روش مناسب برای اندازگیری تعدادی از یون ها ی فلزی در محیط های پیچیده باشد.

در این پژوهش ساختار ملکولی و پیوند هیدروژنی درون ملکولی ترکیب 3 -آمینو 2-ایمینو متیل آکریل آلدهید (aia) و 33 صورت بندی مختلف این ترکیب در سطح محاسباتی hf، b3lyp و mp2 با تابع پایه 6-311++g** بررسی شده است. به علاوه محاسبات برای تمامی صورت بندی های aia در محلول آب نیز در سطح محاسباتی b3lyp با تابع پایه 6-311++g** انجام شده و انرژی پیوند هیدروژنی در صورت بندی هایی که این پیوند را دارند به روش اسپینوزا محاسبه شده است. همچنین اثرات استخلاف های -f، -cl، -ch3، -c2h5، -cf3، -cho، -coch3، -cn، -nh2، -no2، oh، sch3- و –sh در موقعیت هایr1 و r2 در ترکیب aia بررسی شده و سپس اثر هر کدام از این استخلاف ها بر روی قدرت پیوند هیدروژنی مطالعه شده است. طبیعت پیوند هیدروژنی درون مولکولی در صورت بندی های مختلف ترکیب 3 -آمینو 2-ایمینو متیل آکریل آلدهید و ترکیبات استخلاف دار شده آن به کمک محاسبات توپولوژیکی (aim) و نظریه اربیتال های طبیعی (nbo) تجزیه و تحلیل شد. همچنین برای واکنش های انتقال پروتون، محاسباتی پیرامون حالت گذار انجام و ساختار حالت گذار بهینه گردید، سپس انرژی فعال سازی، فاکتور فرکانس، ثابت سرعت و پارامتر های ترمودینامیکی حالت گذار محاسبه گردید. با به دست آوردن یک سری نقاط نظری، تابع پتانسیل حاکم بر مسیر انتقال پروتون حدس زده شد و سپس برازش گردیده و پارامترهای وابسته به آن استخراج می گردد.

در این پژوهش ساختار مولکولی و پیوند هیدروژنی درون مولکولی ترکیب 2-تیوفرمیل-3-آمینو آکریل آلدهید (tfa) و 42 صورت بندی مختلف این ترکیب در سطوح محاسباتی hf، b3lyp و mp2 با تابع پایه 6-311++g** به منظور تعیین ترتیب پایداری صورت بندی ها و امکان تشکیل پیوند هیدروژنی درون مولکولی مختلف بهینه شده است. انرژی پیوند هیدروژنی برای سیستم های دارای این پیوند با استفاده از روش اسپینوزا بدست آمده است. طبیعت پیوند هیدروژنی درون مولکولی در صورت بندی های مختلف 2-تیوفرمیل-3-آمینو آکریل آلدهید به وسیله نظریه اتم ها در مولکول (aim) و نظریه اوربیتال طبیعی (nbo) تجزیه و تحلیل شد. برای تکمیل محاسبات در این قسمت محاسبات ساختاری برای ترکیب مورد مطالعه و صورت بندی های آن در فاز محلول انجام و تاثیر حلال بر روی پایداری صورت بندی های مختلف مشخص شد. همچنین اثرات استخلاف در موقعیت r1 و r2 ترکیب tfa بررسی و اثر این استخلاف ها بر روی ساختار و قدرت پیوند هیدروژنی درون مولکولی مطالعه شده است. در ادامه برای واکنش های انتقال پروتون، محاسباتی پیرامون حالت گذار انجام و ساختار حالت های گذار بهینه گردید. سپس انرژی فعالسازی، فاکتور فرکانس، ثابت سرعت و پارامتر های ترمودینامیکی حالت های گذار محاسبه شد و در انتها بهترین تابع پتانسیل حاکم بر فرایندهای انتقال پروتون پیشنهاد شد، و سپس برازش گردیده و پارامترهای وابسته به آن استخراج گردید.

ثابت پایداری کمپلکس های هیستیدین با فلزات آهن(iii)، کبالت(ii)، نیکل (ii)، روی(ii)، مس(ii) و سرب(ii) با روش پتانسیومتری در دماهای 25، 30، 37و 45 درجه ی سانتیگراد تعیین شد. محاسبات توسط نرم افزار grcbeta که بر اساس روش تغییر یافته ژروم طراحی شده، صورت گرفته است. تیتراسیون پتانسیومتری در حلال آب ومخلوط آب-دی اکسان (70-30)% و (50-50)% انجام شد و نتایج با هم مقایسه گردید. قدرت یونی محلول توسط سدیم نیتراتm 10/0 ثابت نگه داشته شد. با رسم منحنی ph در مقابل غلظت سدیم هیدروکسید اضافه شده به محلول مورد بررسی، ثابت پایداری مرحله اول و دوم کمپلکس بدست آمد. روند افزایشی ثابت تشکیل کمپلکس ها با فلزات مربوطه در حلال آب و مخلوط آب-دی اکسان در زیر خلاصه شده است: kf pb+2-his < kf co+2-his < kf zn +2-his < kf ni+2-his < kf cu+2-his < kf fe+3-his اثرات افزایش دما و درصد دی اکسان روی ثابت پایداری همه ی کمپلکس های هیستیدین بررسی شد. به طوریکه ثابت های تشکیل کمپلکس با ازدیاد درجه ی حرارت و درصد دی اکسان افزایش یافت. در ادامه پارامترهای ترمودینامیکی ?g?، ?h? و ?s?برای هر یک از کمپلکس ها محاسبه گردید و روند افزایش انرژی آزاد گیبس به اینصورت است: his- ?g? fe3+> his -?g? cu2+ > his -ni2+ ?g? > his -zn2+ ?g? > his -? co2+ ?g> his – ?g? pb2+ نتایج نشان می دهد که با افزایش درصد دی اکسان ?g? بیشتر می شود و واکنش خود به خودیتر می گردد. مقادیر ?h?برای بیشتر کمپلکس ها مثبت بوده و در نتیجه واکنش ها گرماگیر هستند و افزایش دما بر این واکنش ها موثر می باشد. در نهایت با کمک محاسبات مکانیک کوانتومی پایدارترین صورت بندی هیستیدین را تعیین نمودیم. پارامترهای ساختاری 18 صورت بندی پایدار هیستیدین در سطوح محاسباتی b3lyp و mp2با تابع پایه ی6-31g** محاسبه گردید. سرانجام اثرات حلال پوشی، روی پارامتر های ساختاری صورت بندی ها با تئوری scrf برسی شد.

در بخش اول، سنتز و فعالیت کاتالیزوری کمپلکس های جدیدی از سیس-دی اکسو مولیبدن شامل لیگاندهای شیف باز سه دندانه ono در اکسایش اولفین ها و سولفیدها با استفاده از ترشیو-بوتیل هیدروپراکسید و هیدرژن پراکسید در مدت زمان های مطلوب با شیمی گزینی و فضاگزینی بالا توصیف شده است. نتایج کریستالوگرافی آرایش هندسی هشت وجهی واپیچیده با گرو های فضایی مونوکلینیک (p21/c) و اورتورومبیک(pbca) را برای دو نمونه از این کمپلکس ها نشان می دهد. در بخش دوم، چهار کمپلکس دو هسته ای اکسو وانادیوم شامل یک پل µ-اکسو با استفاده از مشتقات لیگاند شیف باز سه دندانه ono 2-[(2-هیدروکسی پروپیل ایمینو)متیل] فنول سنتز شد. یک آرایش هرم مربعی اطراف هر مرکز وانادیوم با گروه فضایی p-1، تعیین شده است. اپوکسایش آلکن-ها با ترشیو-بوتیل هیدروپراکسید و اکسایش سولفیدها به سولفوکسید با هیدروژن پراکسید با انتخابگری بالا با استفاده از این کمپلکس ها به عنوان کاتالیزور انجام شد. با این وجود در این سیستم کاتالیزوری، استایرن ها با استفاده از هیدروژن پراکسید به عنوان اکسنده به ترکیبات کربونیل مربوطه اکسایش یافتند. مطالعه ton و طیف uv-vis کمپلکس های مولیبدن و وانادیوم، فعالیت و پایداری بالای این کاتالیزورها را به خوبی در واکنش ها نشان داد. وجود گروه های الکترون کشنده و حجیم بر روی حلقه سالیسیلیدن لیگاند کارایی کاتالیزورهای مولیبدن را بالا می برد. این نتایج در تطابق با مطالعات تئوری هستند. با این وجود اختلاف قابل توجهی بین فعالیت کمپلکس های وانادیوم مشاهده نشد.

در این پژوهش، از دو روش مستقیم و غیرمستقیم که از سادگی و حساسیت مناسبی برخوردار هستند، برای اندازه گیری مقادیر ناچیز نیتریت در نمونه های آبی با استفاده از ترکیبات آمینوآنتراکینون مورد بررسی قرار گرفته است. اندازه گیری در روش مستقیم، بر پایه دی آزوئه شدن ترکیب 1- آمینوآمتراکینون با نیتریت موجود در آب اسیدی و واکنش محصول دی آزوئه با 1- نفتیل آمین می باشد. از دوی شدت جذب مشتق دوم محصول (در طول موج ماکسیمم 530 نانومتر) غلظت نیتریت موجود در نمونه تعیین گردید. اساس کار در تکنیک غیرمستقیم بر پایه دی آزوئه شدن ترکیب 1و 4-دی آمینوآنتراکینون حل شده در فاز آلی توسط نیتریت موجود در آب و در محیط اسیدی می باشد. به این ترتیب که با اندازه گیری کاهش در مقدار جذب و نشر فلورسانس ترکیب آمینوآنتراکینون، با استفاده از روش اسپکتروفوتومتری (در طول موج ماکسیمم 581 نانومتر) و اسپکتروفلوریمتری (در طول موج تهییجی 581 نانومتر و طول موج نشری 609 نانومتر) غلظت نیتریت موجود در نمونه تعیین می گردد. پارامتر های موثر در این روش ها جهت دستیابی به پاسخ مناسب سیستم بهینه سازی شدند. از بررسی آنیون ها و کاتیون هایی که به طور عمده در نمونه های آبی موجود می باشند، مشخص شد که این یون ها مزاحمتی در پاسخ سیستم ایجاد نمی کنند. محدوده دینامیکی برای اندازه گیری نیتریت در ،3× 10-6- 2× 10- اسپکتروفتومتری مشتقی، اسپکترو فتومتری و اسپکتروفلوریمتری به ترتیب 5 5 می باشد. حد تشخیص و تکرار پدیری در اسپکتروفتومتری مشتقی × 10-8- 1× 10-5 ، 3× 10-7- 7× 10-6 5 و ×10 - 1 و در روش اسپکتروفلوریمتری 8 / 1/4 و % 5 ×10 - 1 ،در اسپکتروفتومتری 7 / 2/7 و % 2 ×10 -7 3/1% است. از این روش برای تعییین مقدار نیتریت در نمونه های آب چاه استفاده گردید.

چکیده ساختار مولکولی هشت صورت بندی مولکول ایمینو- دی تیو استیک اسید (s1) در سطوح محاسباتی b3lyp و mp2 با تابع پایه 6-311++g** و سطح g2mp2 به طور کامل بهینه گردیده است. به علاوه محاسبات برای تمامی صورت بندیها ی مولکول ایمینو- دی تیو استیک اسید (s1) در حلال آب و در سطح محاسباتی b3lyp با تابع پایه 6-311++g** نیز انجام شده است. در نهایت آنالیز پیوند هیدروژنی در این مولکولها با نظریه aim و nbo به خوبی نتایج قبلی را تایید می کند. در کاری دیگر، پیوند هیدروژنی درون مولکولی و ساختارایمینو- دی تیو استیک اسید (s1) و مشتقات استخلافی آن در سطح b3lyp با تابع پایه 6-311++g** مورد بررسی قرار گرفته است. در این کار انرژی سد چرخشی و شاخص های homa نیز برای مولکول مادر و مشتقات آنها نیز انجام شده است. تمامی محاسبات در فاز گازی و در سطح محاسباتی b3lyp با تابع پایه 6-311++g** انجام شده. در این کار مقادیر فرکانس ارتعاشی و خمشی نیز بدست آمده است که با استفاده از این پارامترها می توان مقدار انرژی پیوند هیدروژنی را بدست آورد. به علاوه این محاسبات در حلال های آب و ccl4و در سطح محاسباتی b3lyp با تابع پایه 6-311++g** نیز انجام شده است .از طرف دیگر محاسبات انتقال پروتون برای بدست آوردن حالت گذار نیز برای ترکیبات آمینو- اکسو دی تیو استیک اسید و ایمینو- هیدروکسی دی تیو استیک اسید انجام شده است. مقادیر انرژی فعال سازی، فاکتور فرکانس، ثابت آرنیوس، ثابت سرعت و سایر پارامترهای ترمودینامیکی در این کار برای همه استخلافهای مورد بررسی و در سه موقعیت مختلف ارزیابی شده است. در نهایت با چرخاندن صورت بندی های بررسی شده حول پیوندهای مختلف و تبدیل آنها به یکدیگر مسیر واکنش برای ترکیبات آمینو- اکسو دی تیو استیک اسید و ایمینو- هیدروکسی دی تیو استیک اسید بدست آمده است.

چکیده ساختار مولکولی بیست صورت بندی مولکول (z) 2-هیدروکسی سایلیلین استالدئید (hsa) در سطوح محاسباتی b3lypو mp2 با تابع پایه 6-311++g** و سطح g2mp2 به طور کامل بهینه گردیده است در حالت کلی ساختارهای انولی حلقوی نظیر صورت بندی های (e-k1) و (k-e1).نسبت به سایرصورت بندیهای مورد بررسی پایدار تر می باشند. به علاوه محاسبات برای تمامی صورت بندیها ی مولکول (z) 2-هیدروکسی سایلیلین استالدئید در حلال آب و در سطح محاسباتی b3lyp با تابع پایه 6-311++g** نیز انجام شده است. در نهایت آنالیز پیوند هیدروژنی در این مولکولها با نظریه aim و nbo به خوبی نتایج قبلی را تایید می کند. در کاری دیگر، پیوند هیدروژنی درون مولکولی و ساختار (z) 2-هیدروکسی سایلیلین استالدئید و مشتقات استخلافی آن در سطح b3lyp با تابع پایه 6-311++g** مورد بررسی قرار گرفته است. در این کار انرژی سد چرخشی و انواع شاخص های آروماتیسیتی نیز برای مولکول مادر و مشتقات آنها نیز انجام شده است. تمامی محاسبات در فاز گازی و در سطح محاسباتی b3lyp با تابع پایه 6-311++g** انجام شده است و اثر سیزده استخلاف در سه موقعیت r_3,r_2 r_(1 ) مولکول مادر نیز مورد بررسی قرار گرفته است. در این کار مقادیر فرکانس ارتعاشی و خمشی نیز بدست آمده است که با استفاده از این پارامترها می توان مقدار انرژی پیوند هیدروژنی را بدست آورد. به علاوه این محاسبات در حلال های آب و ccl4و در سطح محاسباتی b3lyp با تابع پایه 6-311++g** نیز انجام شده است. مقادیر شاخص های مختلف آروماتیسیتی نظیر flu ، ati ، pdi ،homa و nics برای تمامی استخلافها در سه موقعیت r_3,r_2 r_(1 ) بدست آمده است .از طرف دیگر محاسبات انتقال پروتون برای بدست آوردن حالت گذار نیز انجام شده است.. مقادیر انرژی فعال سازی، فاکتور فرکانس، ثابت آرنیوس، ثابت سرعت و سایر پارامترهای ترمودینامیکی در این کار برای همه استخلافهای مورد بررسی و در سه موقعیت مختلف ارزیابی شده است. در نهایت با چرخاندن صورت بندی های بررسی شده حول پیوندهای مختلف و تبدیل آنها به یکدیگر مسیر واکنش بدست آمده است.

چکیده تمام صورت بندی های ممکن برای ترکیب (z)(2-ایمینو اتیلیدین) سیلیل آمین در سطوح b3lyp و mp2 با تابع پایه 6-311++g** و g2mp2 جهت تعیین ترتیب پایداری صورت بندی ها و امکان تشکیل پیوند هیدروژنی درون مولکولی مختلف بهینه شده اند. نتایج محاسبات در دو فاز محلول و گاز نشان دادند که صورت بندی های (z)- 1- (2- ایمینو اتیلیدین) سیلان آمین (isa) نسبت به سایر صورت بندی ها پایدارتر است. نقاط بحرانی و طبیعت پیوند هیدروژنی توسط تئوری اتم در مولکول بادر مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. همچنین از نظریه اوربیتال های پیوندی طبیعی برای فهم بهتر برهم کنش های بین مولکولی استفاده شد. پیوند هیدروژنی درون مولکولی n-h…n در 1- (2-ایمینو اتیلیدین) سیلان آمین (isa-1) و استخلاف-هایش به کمک روش dft مورد مطالعه قرار گرفت. همچنین همه محاسبات، برای ترکیب isa-1 و استخلاف هایش در فاز آب و تتراکلرید کربن نیز انجام شد. پارامترهای توپولوژیکی مثل دانسیته الکترونی و چگالی دانسیته در نقاط بحرانی به کمک تئوری اتم ها در مولکول ها مورد بررسی قرار گرفت. از خصوصیات حاصله از پارامترهای توپولوژیکی در نقطه بحرانی حلقه جهت محاسبه شاخص های آروماتیسیتی استفاده شد. علاوه بر آن، طبیعت پیوند هیدروژنی در مولکول مادر و مشتقات آن به وسیله نظریه اوربیتال طبیعی مورد بررسی قرار گرفت. در ادامه برای واکنش های انتقال پروتون و بررسی سطوح انرژی پتانسیل، محاسباتی پیرامون حالت گذار انجام و ساختار حالت گذار بهینه گردید، سپس انرژی فعال سازی، فرکانس های ارتعاشی، ثابت سرعت و پارامترهای ترمودینامیکی حالت گذار محاسبه شد. در نهایت محاسبات سد چرخشی برای چرخش حول زاویه nhn در کنفورمر isa-1 و استخلاف هایش در سه فاز گاز، آب و تترا کلرید کربن به کمک نظریه dft ودر سطح پایه 6-311++g** مورد محاسبه قرار گرفت.

مولیبدن بواسطه ظرفیتهای متغییر دارای اکسیدهای فلزی متفاوتی می باشد و به همین دلیل می تواند کاندیدای مناسبی برای ساخت وسایل ذخیره سازی انرژی به شمار رود. در این پژوهش هدف ما ساخت اکسید مولیبدن نانوساختاری وبررسی خواص ظرفیتی و قابلیت کاربرد آن در وسایل ذخیره سازی انرژی است. بدین منظور ابتدا اکسید مولیبدن نانوساختاری به روش ترسیب الکتروشیمیایی با اعمال ولتامتری چرخه ای ساخته شد. مرفولوژی و ساختار آن با استفاده از میکروسکوپی روبشی پتانسیل و پراش اشعه ایکس ارزیابی شد. سپس ویژگیهای ظرفیتی آن با روشهای الکتروشیمیایی نظیر ولتامتری چرخه ای، منحنی شارژ و دشارژ در جریان ثابت و بیناب نگاری امپدانس الکتروشیمیایی در محلول 005/0 مولار اسید سولفوریک و 095/0 مولار سدیم سولفات مطالعه گردید. این بررسی ها نشان داد که در جریان ثابت 1/0 میلی آمپر بر سانتیمتر مربع ظرفیت ویژه ای معادل فاراد بر گرم حاصل می شود. در قسمت دوم این پژوهش آثار ph محلول بر روی خواص ظرفیتی اکسید مولیبدن نانوساختاری بررسی شد. برای این منظور مطالعات الکتروشیمیایی در الکترولیتهایی با غلظت 005/0، 011/0 و 02/0 مولار اسید سولفوریک انجام شد و مشخص گردید اگرچه افزایش غلظت اسید سولفوریک?باعث افزایش ظرفیت اکسید مولیبدن شده ولی باعث ناپایداری و انحلال آن نیز می شود. همچنین در قسمت سوم این پژوهش نقش الکترولیت حامل بر روی خواص ظرفیتی اکسید مولیبدن ارزیابی گردید. بدین منظور آزمایشات الکتروشیمیایی بر روی اکسید مولیبدن نانوساختاری در دو محلول با غلظت یکسان اسید سولفوریک ولی با غلظت متفاوت سدیم سولفات انجام شد. این بررسی ها نشان داد که اگر چه افزایش سدیم سولفات هدایت الکتریکی محلول را افزایش می دهد و باعث باردار شدن سریعتر لایه دوگانه الکتریکی می شود ولی بواسطه واکنش هیدرولیز یون سولفات از غلظت یون هیدروژن در محلول کاسته شده و در نتیجه شبه ظرفیت که ناشی از واکنش فارادیی جذب الکتروشیمیایی یون هیدروژن بر روی اکسید مولیبدن است، کاهش می یابد. سرانجام در قسمت چهارم این پژوهش واکنش داخل سازی یون لیتیم به داخل شبکه اکسید مولیبدن نانوساختاری جهت کاربرد در باتریهای لیتیمی مورد ارزیابی قرار گرفت. در این قسمت از روشهای ولتامتری چرخه ای و شارژ و دشارژ در جریان ثابت در الکترولیت یک مولار سدیم پرکلرات در پروپیلن کربنات استفاده شد. این بررسی ها نشان داد که اکسید مولیبدن تهیه شده به این روش دارای ظرفیت ویژه فاراد بر گرم می باشد.

در این پروژه یک روش سریع و حساس برای اندازه گیری مقادیر ناچیز آلومینیوم در نمونه های آب پیش بینی شده است. این فرایند تجزیه ای بر اساس تشکیل کمپلکس بین آلومینیوم(iii) و 3- هیدروکسی2- نفتالن کربوکسیلیک اسید(hna) است. شدت نشر فلوئورسانس سیستم در حضور آلومینیوم (iii)که منجر به تشکیل کمپلکس بین این یون و ترکیب مورد نظر می شود، بیشتر از سیستم فاقد آلومینیوم (iii) می باشد. شرایط بهینه در این پروژه مشخص شد که شامل غلظت 5-10×1 مولار hna، 5/4 =ph (بافر استیک اسید- سدیم استات) و متانول = 5?، می باشد. روش پیشنهادی به طور موفقیت آمیزی برای اندازه گیری مقادیر ناچیز al(iii) در محدوده 8-10×5 تا 6-10×5 مولار در نمونه های آب بکار رفته است. گزینش پذیری روش پیشنهادی با بررسی اثر مزاحمت ها در پاسخ تجزیه ای مورد بررسی قرار گرفت و مشخص شد که بیشتر یون های موجود در نمونه آب شامل یون های ,mg (ii) ,fe (ii) ,na (i) ,ca (ii) mn (ii) ,co (ii) ,cd (ii) ni (ii) ,zn (ii) ,pb (ii) ,cu (ii) در اندازه گیری مزاحمتی ایجاد نکرده-اند. با توجه به نتایج بدست آمده این روش به عنوان یکی از حساس ترین و گزینش پذیرترین روش ها برای اندازه گیری مقادیر ناچیز آلومینیوم می تواند در نظر گرفته شود.

یک روش آسان، انتخاب پذیر و حساس برای جداسازی و تشخیص مقادیر کم یون آرسنیک(v) به عنوان یک گونه ی سمی در محیط زیست، در نمونه های آبی مورد بررسی قرار گرفته است. این روش بر اساس واکنش اکسیداسیون- احیا بین یون آرسنیک(v) و نانوذرات cds پوشیده شده با l- سیستئین بنا نهاده شده است؛ که نتایج نشان داد، در 3= ph این واکنش انجام پذیر است. در این تحقیق غلظت یون آرسنیک(v) در نمونه ها به طور مستقیم با اندازه گیری کاهش شدت فلورسانس به علت اثر خاموشی نانوذرات کوانتومی cds پوشیده شده با l- سیستئین توسط دستگاه اسپکتروفلوریمتر (در طول موج تهییجی 356 نانومتر و طول موج نشری 480 نانومتر) تعیین می شود. کاتیون ها و آنیون هایی که به طور عمده در نمونه های آبی وجود دارند مزاحمتی در اندازه گیری یون آرسنیک(v) ایجاد نکردند. شدت فلورسانس به طور خطی با غلظت یون آرسنیک در محدوده دینامیکی ×10-69/1 تا ×10-58/2 مولار کاهش می یابد. حد تشخیص و انحراف استاندارد نسبی این روش به ترتیب×10-7 04/5 مولار و 2/1% می باشد. درمرحله دوم پیش تغلیظ یون آرسنیک(v) با استفاده از رزین تعویض گرآنیونی amberlit ira-410 انجام گرفت. حجم نمونه، سرعت عبور نمونه، سرعت شویش، مزاحمت یون های pb2+, fe2+, hg2+، بازده تغلیظ آنالیت و ظرفیت رزین بررسی شد، و نتایج نشان داد که با استفاده از این روش اندازه گیری 72×10- مولار از آرسنیک(v) به راحتی انجام می گیرد. در مقایسه با دیگر روش های اندازه-گیری آرسنیک، این روش از مزایایی همچون سادگی، سرعت عمل، عدم نیاز به دستگاهوری پیچیده و حجم بالای نمونه، انتخاب پذیری و حساسیت بالا برخوردار است.

abstract amino acids are building blocks of proteins, and play a vital role in living beings existence and their functionality. the interaction of these compounds with metal ions is of great importance to biochemists, and chemists, because their functions can be utilized as a model in understanding enzymes mechanism for transport of metal ions to tissues. among twenty essential amino acids we chose the reactions of cyclic amino acids in non-aqueous solutions which have high similarity to metal ion transport systems in our body. in this research stability constants of complexes of the amino acid of tryptophan with metal ions of co(ii), ni(ii), cu(ii), zn(ii), pb(ii), and fe(iii) have been determined in mixture of 50-50% water-dioxane (µ= 0.1 nano3) in four different temperatures of 20, 30, 35, 40 °c by potentiometry using modified bjerrum,s method and grc-beta software. the results show that the order of stability of these complexes is as follows: kf zn+2 –trp < kf co+2 –trp < kf pb+2 –trp < kf ni+2 –trp kf cu+2 –trp < kf fe+3–trp also it is found out that the values of complexes formation constants have been increased with elevating temperature and in going from aqueous solvent to non-aqueous solvent. in continuation of our work, using thermodynamic relations gibbs free energy (?g), standard enthalpy of formation (?h), and entropy (?s) for each of these complexes in four different temperatures were calculated and in general the following data were obtained. ?g zn+2 –trp ? ?g co+2 –trp < ?g pb+2 –trp < ?g ni+2 –trp < ?g cu+2 –trp < ?g fe+3–trp moreover, the activation energy (ea) and the rate of reaction for each of these complexes were estimated. k zn+2 –trp < k co+2 –trp < k pb+2 –trp < k ni+2 –trp < k cu+2 –trp < k fe+3–trp finally, quantum mechanical calculations were performed in order to determine the most stable configuration of tryptophan in gaseous and liquid state. all calculations were conducted by using gaussian 98 software and structural parameters in level of hf utilizing base function of 6-31g??. the results indicate that among 22 tryptophan configurations, the most stable configuration in gas phase and aqueous phase is t4.

با اندازه گیری کاهش در مقدار جذب و شدت فلورسانس عامل رنگی، با استفاده از روش های اسپکتروفتومتری (در طول موج ماکسیمم 450 نانومتر) و اسپکتروفلورومتری (در طول موج تهییجی 450 نانومتر و طول موج نشری 522 نانومتر) غلظت نیتریت موجود در نمونه تعیین گردید. مقادیر نیترات نیز پس از تبدیل نیترات به نیتریت از طریق کاهش در یک محیط اسیدی و با استفاده از پودر روی به همین طریق تعیین شد. پارامترهای موثر روش، از قبیل غلظت اسید، زمان تکان خوردن واکنشگرها و حجم فاز آبی جهت دستیابی به پاسخ مناسب سیستم بهینه سازی شدند. از بررسی مزاحمت آنیون ها و کاتیون هایی که به طور عمده در نمونه های آب موجود می باشند، مشخص شد که این یون ها مزاحمتی در پاسخ سیستم ایجاد نمی-نمایند. محدوده های دینامیکی برای اندازه گیری نیتریت به روش های اسپکتروفتومتری و اسپکتروفلورومتری به ترتیب 7-10×0/5 تا 5-10×5/1 و 7-10×1 تا 5-10×5/2 مولار می باشند. حد تشخیص و تکرارپذیری اندازه گیری ها در روش اسپکتروفتومتری به ترتیب 8-10×0/5 مولار و %04/2 و در روش اسپکتروفلورومتری به ترتیب 8-10×9/2 مولار و %07/2 بدست آمد. صحت روش با استفاده از تکنیک افزایش استاندارد بر روی نمونه حقیقی مورد بررسی قرار گرفت و راندمان %96 در تعیین مقدار گونه های نیتریت افزوده شده به نمونه-های آب بدست آمد. میزان راندمان تبدیل نیترات به نیتریت، %2/99 حاصل شد.

در این تحقیق، از طریق واکنش نوکلئوفیلی مشتق 2،2-((5-برمو-6-متیل پیریمیدین-4،2 دی ایل ) بیس(آزانیدیل))دی پروپانوییک اسید سنتز شده است. تشکیل کمپلکس 2،2-((5-برمو-6-متیل پیریمیدین-4،2 دی ایل ) بیس(آزانیدیل))دی پروپانوییک اسید با یون های فلزی ni+2, zn+2 ,cu+2 ,co+2 ,mn+2 و pb+2 بوسیله روش ph متری در محلول آبی مورد بررسی قرار گرفت و مشخص شده که 2،2-((5-برمو-6-متیل پیریمیدین-4،2 دی ایل ) بیس(آزانیدیل))دی پروپانوییک اسید به عنوان لیگاند چند دندانه کمپلکس های قوی با این یون فلزات از انتهای nh2 و coo- تشکیل می دهد. روش ژروم برای تعیین در گستره 1/0 تا 2/0 که شاهد خوبی برای تشکیل کمپلکس در اولین مرحله می باشد به کار برده می شود

دراین تحقیق ما واکنش میان لیگاند سنتز شده و برخی فلزات که منجر به تشکیل کمپلکس می شود را بررسی کردیم، برای این لیگاند ما بررسی کردیم که این واکنش ها چگونه انجام می شود، وهمچنین ثابت پایداری کمپلکس های حاصل را اندازه گرفتیم. در این تحقیق لیگاند2-(4-متیل-6-مورفولینو-5-نیتروپیریمیدین-2-یل آمینو)پروپانوییک اسید از ماده اولیه 6-متیل-2-تیو اکسو-2،3-دی هیدروپیریمیدین- 4-(1-h ) اون طی چند مرحله سنتز شد، و ما ثابت پایداری این لیگاند را با یون های 2 بار مثبت فلزات سرب ، روی ، مس ، کادمیم ، وکبالت اندازه گرفتیم.

ما یافته های خود را در ارتباط با انرژی های نسبی، خواص هندسی و قدرت پیوند هیدروژنی درون-مولکولی بیست صورت بندی مولکول 3-هیدروکسی پروپ-2- اِن سلنال (hps) را توسط روش های شیمی کوانتومی (dft, iefpcm, scipcm) گزارش کردیم. اثرات حلال توسط مدل های پیوستار قطبش پذیر (pcm, iefpcm, scipcm) در سطح b3lyp تخمین زده شده است. پارامترهای هندسی محاسبه شده و تجزیه و تحلیل صورت بندی در فاز گاز بیان کننده ی این است که ساختارهایی که پیوند هیدروژنی دارند پایدارتر از گونه های دیگر هستند. علاوه بر این، انرژی های نسبی، پارامترهای ساختاری، پیوند هیدروژنی و سد چرخشی اِن- هیدروسلنو-اِن-اکسوایمیدو فرمامید (nsa) و استخلاف هایش در فاز گاز و محلول آبی در سطح b3lyp/6-311++g** محاسبه شده است. برای این ترکیب استخلاف های ch2cooh، ch3، ch2f، coch3، ch2cl، coh، c2h5، ch2och3، ch2oh، ch2cf3، cn، cf3، och3، scoch3، sch3 nhch3، oh، cl، nh2، sh، ochf2، no2، f، br، scf3، nhcoch3 در نظر گرفته شده است. داده های حاصل از تجزیه و تحلیل اوربیتال های طبیعی پیوند، خواص دانسیته ی الکترونی و لاپلاسین و ?(o…h) و?(o…h) برای ارزیابی بر هم کنش های پیوند هیدروژنی استفاده شده است. تجزیه و تحلیل آماری از مفاهیم کمی آروماتیسیتی، nics، homa و flu برای این استخلاف ها در نظر گرفته شده است. همبستگی بین شاخص های آروماتیسیتی و هشت خاصیت استخراج شده از rcp برای دوازده استخلاف(ch2cooh، ch3، ch2f، ch2cl، coh، c2h5، ch2och3، cl، ochf2، br، scf3، ch2ch2oh و scoch3) بررسی شده است. همچنین محاسبات انتقال پروتون برای بدست آوردن حالت گذار نیز انجام شده است. مقادیر انرژی فعال سازی، فاکتور فرکانس، ثابت آرنیوس، ثابت سرعت و سایر پارامترهای ترمودینامیکی در این کار برای دوازده استخلاف نامبرده شده، مورد بررسی شده است. در نهایت با چرخاندن صورت بندی های بررسی شده حول پیوندهای مختلف و تبدیل آن ها به یکدیگر مسیر واکنش بدست آمده است.

در این پژوهش ساختار مولکولی و انرژی پیوند هیدروژنی درون مولکولی 26 صورت بندی 3-آمینو-پروپن سلنال(aps) در سطوح محاسباتی b3lyp و mp2 با تابع پایه 6-311++g** و سطح g2mp2 به منظور تعیین مرتبه ی پایداری صورت بندی ها و امکان تشکیل پیوند هیدروژنی درون-مولکولی مختلف بهینه شده است. نتایج محاسبات در فاز گاز و آب نشان می دهد که صورت بندی های 3-آمینو-پروپن سلنال(aps) این ترکیب پایدارتر از بقیه هستند. این پایداری عمدتاً ناشی از تشکیل پیوند هیدروژنی درون مولکولی n-h…se است،که به وسیله رزونانس الکترون های ? کمک می شود. انرژی پیوند هیدروژنی برای صورت بندی های دارای پیوند هیدروژنی از روش های rrm، شوستر و اسپینوزا به دست آمده است. هم چنین اثر استخلاف های f، cl، br، cn، sh، sch3، oh، ch3، c2h5، ph، phoch3، cf3، ch2ch2oh،ch2cl ، ch2cooh، scf3، ochf2، ch2cf3 و ch2och3 در موقعیت r2 در ترکیب aps بررسی شده و سپس اثر هر کدام از این استخلاف ها بر روی قدرت پیوند هیدروژنی مطالعه شده است. مقادیر شاخص های مختلف آروماتیسیتی نظیر flu، flu?، ati، pdi، homa و nics برای تمامی استخلاف ها در موقعیت r2 به دست آمده است .طبیعت پیوند هیدروژنی درون مولکولی در صورت بندی های مختلف 3-آمینو-پروپن-سلنال و ترکیبات استخلاف دار شده آن به کمک محاسبات توپولوژیکی(aim) و نظریه اوربیتال های ظبیعی(nbo) تجزیه و تحلیل شد. در بخش دیگری از این پژوهش سدهای فعال سازی برای چرخش داخلی حول زاویه h-n-hدر صورت بندی aps و استخلاف های آن در فاز گاز و آب با استفاده از تئوری تابعی چگال(dft) با مجموعه پایه 6-311++g** محاسبه شد. در نهایت، برای واکنش های انتقال پروتون، محاسباتی پیرامون حالت گذار انجام و ساختارهای حالت گذار بهینه گردید. سپس انرژی فعال سازی، فاکتور فرکانس، ثابت سرعت و پارامترهای ترمودینامیکی حالت گذار محاسبه شد.

محاسبات نظری ( dftو ab initio) برای 20 صورت بندی ممکن (z)-2-(تیوکسو سیلیل) اتیلن سلنول گزارش شده اند. این محاسبات برای تمامی صورت بندی ها در سطوح b3lyp/6-311++g**، mp2/6-311++g**و g2mp2 انجام شده اند. فرکانس های ارتعاشی نوسانگر هماهنگ در همان سطح به منظور تأیید ماهیت نقاط ایستا و همچنین برای تصحیح انرژی نقطه (zpve) تخمین زده شده بودند. انرژی پیوند هیدروژنی برای صورت بندی های tes-1وmes-1 از طریق روش های شوستر و اسپینوزا بدست آمده بودند. نتایج حاصل نشان می دهد که قدرت پیوند هیدروژنی توسط عدم استقرار الکترون های ?درون حلقه کیلیت تحت تأثیر قرار می گیرد. اثر حلال بر ترتیب پایداری صورت بندی ها و قدرت پیوند هیدروژنی با استفاده از روش های pcm، sci-pcm و ief-pcmدر نظر گرفته شده است. نظریه اتم ها در مولکول های بادر برای بررسی نقاط بحرانی و مطالعه ماهیت پیوند هیدروژنی استفاده شده است. بررسی های اوربیتال پیوندی طبیعی (nbo)برای فهم بهتر ماهیت پیوند هیدروژنی درون مولکولی انجام شده بود. محاسبات بالاترین اوربیتال مولکولی اشغال شده (homo) و پایین ترین اوربیتال مولکولی اشغال نشده(lumo) با فاصله اوربیتال های جبهه ای موجود اند. همچنین محاسبات 1hnmr در همان سطح انجام گردید. در کاری دیگر، ساختار مولکولی، پیوند هیدروژنی درون مولکولی و انرژی سد چرخشی حول پیوند n-se در ترکیب n?-هیدروسلنو-n-تیوکسوایمیدوفرمامید (htif) و مشتقاتش با استفاده از نظریه تابعی چگال (dft) با تابع پایه 6-311++g** در فاز گاز و آب مطالعه گردید. مدل pcm در سطح dft/b3lyp برای تعیین اثر حلال و استخلاف ها بر ساختار و پیوند هیدروژنی استفاده شد. ماهیت این برهمکنش ها که تحت عنوان پیوند هیدروژنی کمک رزونانس شناخته شده اند، بحث شده است. خواص توپولوژیکی توزیع دانسیته الکترونی بر پل هیدروژنی s…h-se با استفاده از نظریه اتم ها در مولکول ها بررسی شد. روش اوربیتال پیوندی طبیعی، اسپکتروسکپی 1hnmr، همچنین فرکانس های ?se-h و ?se-h در سطح b3lyp/6-311++g** به منظور استخراج برهمکنش های پیوند هیدروژنی، محاسبه شدند. از سوی دیگر، آروماتیسیته حلقه توسط چندین شاخص آروماتیسیته نظیر nics، homa، pdi، flu و flu? تعیین شده است. انرژی های homo و lumo نشان می دهد که انتقال بار درون htif و مشتقاتش رخ می دهد. همچنین اثر حلال بر خواص فیزیکی نظیر پتانسیل و سختی شیمیایی با استفاده از مدل pcm و با تابع پایه b3lyp/6-311++g** بررسی شده است. در ادامه برای واکنش-های انتقال پروتون محاسباتی پیرامون حالت گذار انجامو ساختار حالت گذار بهینه گردید، سپس انرژی فعال سازی، فرکانس های ارتعاشی، ثابت سرعت و پارامتر های ترمودینامیکی حالت گذار محاسبه شد.

تمام صورت بندی های ممکن برای ترکیب 3- مرکاپتو- پروپن سلنال ( mcps ) در سطوح با b3lyp و mp2 با تابع پایه 6-311++g** و g2mp جهت تعیین ترتیب پایداری صورت بندی ها و امکان تشکیل پیوند هیدروژنی درون مولکولی مختلف در فاز گازی بهینه شده اند. همچنین، محاسبات برای تمام صورت بندی های mcps در سطح b3lyp و همان تابع پایه انجام شده است. افزایش نسبی مرتبه قدرت پیوند هیدروژنی برای سیستم های پیوند هیدروژنی نشان می دهد s-h…se > se-h…s می-باشد و انرژی پیوند هیدروژنی برای این سیستم ها (mps1 و spt1) از روش شوستر و اسپینوزا به دست می آید. وجود پیوند هیدروژنی سبب افزایش عدم استقرار الکترون می گردد که پایداری ساختار mps1 را افزایش می دهد. به منظور مقایسه قدرت پیوند هیدروژنی، فرکانس های ارتعاشی پیوند s-h و se-h، طیف بینی nmr، انرژی سطوح homo-lumo و سد چرخشی برایmps1 و spt1 محاسبه شده اند. نقاط بحرانی و طبیعت پیوند هیدروژنی توسط تئوری اتم در مولکول بادر مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. همچنین، از نظریه اوربیتال های پیوندی طبیعی برای فهم بهتر بر هم کنش های بین مولکولی استفاده شد. در بخش دیگر، گروهی از سیستم هایی که ساختاری کیلیت با پیوند هیدروژنیc-h … y (se =y ، o و s ) تشکیل می دهند، بررسی می شوند. پیوند هیدروژنی درون مولکولی برای مشتقات 4- سلنوکسو- بوت- 2- انال (sbe) در سطح b3lyp/6-311++g** مطالعه شده اند تا اثر استخلاف r بر روی ترکیب sbe مشخص گردد. مدل pcm برای تعیین اثر حلال استفاده شده است و خواص توپولوژیکی توزیع دانسیته الکترونی برای پل c-h…se در روش اتم در مولکول بادر تجزیه و تحلیل می شوند. روش nbo، طیف بینی nmr و جا به جایی شیمیایی، به خوبی فرکانس های کششی، به منظور ارزیابی بر هم کنش های پیوند هیدروژنی برای تمام مشتقات در همان سطح محاسبه شده اند. آروماتیسیته حلقه با چندین روش از قبیل شاخص homa، nics و پارامتری که اخیرا برای توصیف آروماتیسیتی به کار می رود (flu?) محاسبه می شود. نتایج نشان می دهد، برای سیستم های دارای پیوند هیدروژنی ضعیف، با وجود پیوندهای مزدوج پیوند هیدروژنی کمک رزونانس نمی باشد. وجود چندین کانفورمر، امکان معرفی مولکول مرجع بدون پیوند هیدروژنی c-h … y را می دهد. تمام پیوند های هیدروژنی موجود در ساختارهای مورد بررسی پیوند جا به جایی آبی نامعمول می باشند. در قسمت دیگر این رساله، مدل pcm برای بررسی اثر حلال بر روی استخلافات ترکیب sbe مورد استفاده قرار گرفته است. همچنین، محاسبات سدچرخشی برای چرخش حول زاویه h-c=o در ساختار و استخلاف هایش در دو فاز گاز و آب به کمک نظریه dft ودر تابع پایه 6-311++g** مورد محاسبه قرار گرفت.?

در این تحقیق یک روش ساده و کاربردی برای حذف اسیدهای آروماتیک رایج در آب با استفاده از جاذب کائولن در یک روش یک مرحله ای پیشنهاد شده است. این روش براساس جذب اسیدهای آروماتیک (سالیسیلیک اسید، آمینوبنزوئیک اسید، نفتوئیک اسید، 2و5 دی هیدروکسی بنزوئیک اسید) بر روی جاذب کائولن است.ابتدا مقدار اسید آروماتیک جذب شده بر روی کائولن تعیین شد سپس مقدار اسید آروماتیک باقیمانده با استفاده از روش اسپکتروفلورومتری اندازه گیری شد.(هر اسید آروماتیک طول موج تهییجی و نشری مخصوص به خودشان را دارند.)در نهایت مقدار اسید آروماتیک جذب شده بر روی کائولن با مقایسه مقدار اسید آروماتیک اولیه و باقیمانده در محلول اندازه گیری شد. به منظور بررسی شرایط بهینه چندین پارامتر از قبیل ph ،مدت زمان هم زدن محلول و جرم کائولن بهینه شد.ph بهینه برای این ازمایش 6 انتخاب شد زیرا همان طور که می دانیم ترکیبات در ph های بالاتر از pka به صورت انیون می باشند و از انجایی که سطح خارجی کائولن پروتونه شده است طبیعی است که در این ph نسبت به ph های بالاتر مقدار انیون بیشتر و در نتیجه جذب بیشتری صورت می گیرد. نتایج نشان داد که جذب اسیدهای آروماتیک بر روی کائولن از مدل جذبی لانگمویر نسبت به سایر روش ها تبعیت می کند که این نشان میدهدکه اسیدهای اروماتیک به صورت یک لایه بر روی کائولن جذب می شوند. نتایج حاصل از سینیتیک نشان داد که این سیستم از معادله ی مرتبه دوم مجازی تبعیت می کند. این بدین معنی است که راندمان جذب هم به کائولن و هم به اسید آروماتیک وابسته است. در نهایت سرعت جذب هر کدام از اسیدهای آروماتیک بر روی جاذب کائولن بررسی شد که سرعت جذب و مقدار جذب با توجه به ساختار ترکیبات و بر هم کنش انها با کائولن قابل انتظار است.

تحقیق اول اختصاص به بررسی ساختارهندسی مولکولی، ترتیب پایداری و مقایسه ی قدرت پیوندهیدروژنی درون مولکولی بین تعداد بیست صورتبندی مختلف ترکیب 3-مرکاپتو-بوت-2-ان تیال دارد. ساختارمولکولی و انرژی پیوندهیدروژنی درون مولکولی صورتبندیهای ترکیب مذکور در سه سطح محاسباتی b3lyp، mp2 و g2mp2 و با استفاده از مجموعه پایه6-311++g** بررسی گردیده است. پایداری نسبی بیشتر برخی صورتبندیهای این ترکیب می تواند به دلیل تشکیل پیوندهیدروژنی درون مولکولی s–h…s باشد، که به کمک عدم استقرار الکترونهای غیرمستقر? یاری شده اند. انرژی پیوندهیدروژنی درون مولکولی تمامی صورتبندیهای این ترکیب به وسیله ی روش روتومرهای نسبی محاسبه گردید. همچنین برای درک بهتر طبیعت پیوندهیدروژنی درون مولکولی ترکیب مورد نظر محاسبات اربیتال های پیوندی طبیعی نیز انجام گردید. نتایج محاسبات حاصل از روشهای مذکور در توافق با محاسبات انجام شده به روش روتومرهای نسبی می باشد. در ادامه، در تحقیق دوم به مطالعه ی اثراستخلاف بر قدرت پیوندهیدروژنی درون مولکولی ترکیب 3-مرکاپتو-پروپن تیال پرداخته شده است. محاسبات ساختارمولکولی، انرژی پیوندهیدروژنی درون مولکولی و عدم استقرار الکترونهای? تمامی استخلاف های این ترکیب در مواضع استخلافیr1، r2 و r3 و در سه سطح محاسباتی b3lyp، mp2 وg2mp2 با استفاده از مجموعه پایه 6-311++g** انجام گردید. گروههای استخلافی h، cl،nh2 ، oh، ch3و fدر مواضع استخلافی مذکور جایگزین شده اند. بعلاوه محاسبات فرکانسهای ارتعاشی برای تمامی استخلافهای ترکیب مذکور در همان سطح محاسباتی انجام شده است. از طرفی شاخص های آروماتسیته q وhoma که به عنوان مشخصه ای برای ارزیابی عدم استقرارالکترونهای محلی غیرمستقر? می باشند، با استفاده از ساختار هندسی مولکول بهینه شده، محاسبه گردید. ضمن آنکه ماهیت پیوندهیدروژنی درون مولکولی s–h…sبرای تمامی استخلافهای ترکیب مذکور به کمک نظریه ی اتم در مولکول بادر مورد بررسی قرارگرفت. نتایج حاصل نشان داد که قدرت پیوندهیدروژنی درون مولکولی، وابسته به شدت تغییرات چگالی الکترونهای غیرمستقر در نیم حلقه ی ترکیبات مذکور می باشد، که در اثر حضور گروههای استخلافی ایجاد می شود. درادامه ی بحث، در تحقیق دیگری، پدیده ی انتقال پروتون در تعدادی ازاستخلافهای ترکیب 3-مرکاپتو-پروپن تیال و اثرات استخلاف بر این پدیده، در حالاتی که استخلاف در مواضع r1(3) یاr2 باشد، مورد بررسی قرارگرفته است. تمامی محاسبات به کمک محاسبات در سطحb3lyp و با استفاده از مجموعه پایه6-311++g** انجام گردیده است. در این مطالعه ازاستخلافهایf ،cl ، oh، sh، och3، sch3،cho،cch ، no2و ocf3استفاده شد. همچنین شاخص های آروماتیسیته q و homa جهت بررسی خصلت آروماتیسیته ی ترکیبات محاسبه گردید. بعلاوه، محاسبات به روش اربیتالهای پیوندی طبیعی نیز، برای تمامی ساختارها ی بهینه شده، انجام گردید. از طرفی دیگر وجود ضرایب همبستگی خطی بین مقادیر سد انرژی واکنش انتقال پروتون و نتایج حاصل از محاسبات روشهای کوانتومی اتم در مولکول بادر و اربیتالهای پیوندی طبیعی، نشان می دهد که این نتایج با داده های روشهای آغازین در توافق می باشند. همچنین همبستگی بین سد انرژی واکنش انتقال پروتون ترکیبات مذکور و فرکانسهای کششی وخمشی پیوندکووالانسی s–h بررسی گردید. نتایج به دست آمده نشان داد که نوع استخلاف و مواضع آنها بر تغییرات سد انرژی واکنش انتقال پروتون ترکیبات مذکور بسیار موثر می باشد. در ادامه ی بحث، همبستگی بین مشخصه های مختلف مکان شناسی چگالی الکترون، ساختارهندسی و مشخصه های ترمودینامیکی مورد مطالعه قرارمی گیرد. در تحقیق آخر به بحث و بررسی در خصوص اثرات استخلاف بر واکنش انتقال پروتون ما بین ترکیب 1،6-دی هیدرو-]1،3،5[تری آزین-2،4-دی آمین و تعدادی از کربوکسیلیک اسیدهای (rcooh) استخلافی در موقعیت rپرداخته می شود. تمامی محاسبات در سطح محاسباتیb3lyp و با استفاده از مجموعه پایه6-311++g** انجام گردیده است. استخلافهای h، cch،nh2 ، oh، sh، nhch3 و sch3در موقعیتr جایگزین شده اند. همچنین شاخص homa جهت مقایسه ی آروماتیسیته حالات گذار محاسبه شده است. ضریب همبستگی خطی بین مقادیر ?e واکنش انتقال پروتون ترکیبات مذکور و فرکانسهای کششی ?(n-h)، ?(o-h)، خمشی ?(o-h) و ?(n-h)بررسی شد. نتایج به دست آمده نشان می دهد که نوع استخلاف بر تغییر ?eواکنش انتقال پروتون ترکیبات مذکور موثر می باشد.

در این پژوهش روشی ساده و حساس برای گونه شناسی و اندازه گیری مقادیر اندک سریم(iv) در نمونه های شیشه با استفاده از ترکیب 1و4-دی آمینوآنتراکینون مورد بررسی قرار گرفته است. اساس این روش بر پایه اکسایش ترکیب رنگی 1و4-دی آمینوآنتراکینون حل شده در فاز آلی، توسط سریم(iv) موجود در شیشه در محیط اسیدی می باشد. به این ترتیب با اندازه گیری کاهش در مقدار شدت فلورسانس عامل رنگی با استفاده از روش اسپکتروفلورومتری (در طول موج تهییجی 590 نانومتر و طول موج نشری 614 نانومتر) به طور مستقیم غلظت سریم(iv) موجود در نمونه تعیین گردید. پارامترهای موثر بر روش از قبیل غلظت اسید، غلظت ترکیب 1و4-دی آمینوآنتراکینون، زمان تکان دادن و حجم فاز آبی جهت دستیابی به پاسخ مناسب بهینه سازی شدند. از بررسی مزاحمت آنیون ها و کاتیون هایی که به-طور عمده در نمونه های شیشه موجود می باشند مشخص شد که، این یون ها بجز آنیون کروم(vi) مزاحمتی در پاسخ سیستم ایجاد نمی نمایند. مزاحمت کروم(vi) با تبدیل آن به کروم(iii) توسط آهن(ii) مرتفع گردید. محدوده های دینامیکی برای اندازه گیری سریم(iv) به روش اسپکتروفلورومتری 7-10×0/5 تا 6-10 ×0/7 مولار می باشد. حد تشخیص و تکرارپذیری اندازه گیری ها در این روش به-ترتیب7-10 ×0/2 مولار و 1% به دست آمد. با استفاده از روش افزایش استاندارد راندمان بیش از 90% در تعیین مقدار گونه های سریم افزوده شده به نمونه های شیشه به دست آمد.

در این پایان نامه، سنتز نانوذرات کوانتومی cdseپوشیده شده با لیگاند2- مرکاپتونیکوتینیک اسید مورد بررسی قرار گرفته است. عامل پوشاننده، محیط آبی و شرایط کاملا کنترل شده اجازه سنتز نانوذرات کوانتومی را با در نظرگرفتن بهترین اندازه و شکل می دهد. رشد این ذرات در دمای اتاق منجر به سنتز نقاط کوانتومی با پایداری بالا می شود. در مرحله اول، سنتز نانوذرات cdse پوشیده شده با 2-مرکاپتونیکوتینیک اسید در دمای اتاق و محیطی عاری از اکسیژن انجام گرفت. تغییر نسبت مولی cd/se به همراه لیگاند، تغییر درجه حرارت و تنظیم ph موجب گردید تا بهینه بودن واکنش را جهت تهیه نانوذراتی با توزیع اندازه ای کوچک و فلوئورسانس مناسب کنترل گردد. استفاده از طیفهای پراش اشعه ایکس ( xrd)، میکروسکوپ الکترونی عبوری (tem) امکان مطالعه دقیق این نانوذرات را فراهم می کند. با پوشاندن این نانوذرات کوانتومی با لیگاند ذکر شده تغییراتی در ساختار، سطوح انرژی و خصوصیات دیگری از نانوذره مورد نظر به وجود آمد، و از این تغییرات توانستیم برای تشخیص و شناسایی میزان کروم (vi) موجود در آب آشامیدنی استفاده کنیم. طول موج نشری بدست آمده برای نانوذرات cdse پوشیده شده با لیگاند 2- مرکاپتونیکوتینیک اسید 385 نانومتر و طول موج تهییج آن 317 نانومتر است. سپس، در مرحله دوم از این نانوذرات پوشیده شده با لیگاند 2- مرکاپتونیکوتینیک اسید، برای شناسایی و تعیین کروم (vi) موجود در آب شهر بیرجند، استفاده شد. در طی واکنش، تمامی شرایط از قبیل ph، زمان و غلظت بهینه شدند. میزان فلورسانس نانوذرات پوشیده شده با لیگاند، در واکنش با کروم افزایش چشم گیری یافته است. بر این اساس، غلظت یون کروم (vi) در نمونه ها به طور مستقیم با اندازه گیری افزایش شدت فلورسانس به علت برهمکنش cdse نانوذرات پوشیده با 2- مرکاپتونیکوتینیک اسید، توسط دستگاه اسپکتروفلوریمتر تعیین شد. این افزایش فلورسانس به دلیل واکنش اکسایش – کاهش 2- مرکاپتونیکوتینیک اسید با cr(vi) است. در این واکنش لیگاند نقش کاهنده را دارد و cr(vi) نقش اکسنده لیگاند را برعهده دارد. گستره غلظتی بدست آمده از 6-10 ?9 تا 7- 10 ?3 است. این گستره غلظتی بعد از بهینه کردن اسیدیته hcl در غلظت اسید 50/0 مولار و زمان 30 دقیقه سونی کیت بدست آمد. حد تشخیص این آزمایش 7- 10 ?5/ 5 و درصد انحراف استاندارد نسبی % 6/0 است. در این آزمایش برای رفع مزاحمت یون های موجود در آب، یون های + mg +2, na+, k و ca +2 تست شدند که از میان این یون ها ، تنها یون کلسیم مزاحم شناخته شد. که برای حذف آن از کربنات سدیم استفاده کردیم. در این پایان نامه، سعی بر آن شده است که، یک روش آسان، انتخاب پذیر و حساس برای جداسازی و تشخیص مقادیر کم یون کروم (vi)، به عنوان یک گونه سمی در آب های زیست محیطی، استفاده شود. این روش براساس انتخاب گزینی نانوذرات cdse پوشیده شده با لیگاند 2- مرکاپتونیکوتینیک اسید نهادینه شده است.

عنوان: بررسی واکنش اورانیوم (vi) با پیریدین-2،6-دی کربوکسیلیک اسید به روش اسپکتروفلوریمتری و کاربرد آن در اندازه گیری اورانیوم موجود در نمونه های آب به وسیله ی: زینب خلیلی چکیده در این پروژه یک روش سریع و حساس برای اندازه گیری مقادیر ناچیز اورانیوم در نمونه های آب پیش بینی شده است. این فرایند تجزیه ای بر اساس تشکیل کمپلکس بین اورانیوم(vi) و پیریدین-2،6-دی کربوکسیلیک اسید (pda) است. شدت نشر فلوئورسانس سیستم در حضور اورانیوم (vi)که منجر به تشکیل کمپلکس بین این یون و ترکیب مورد نظر می شود، بیشتر از سیستم فاقد اورانیوم (vi)می باشد. شرایط بهینه در این پروژه مشخص شد که شامل غلظت 5-10×5 مولار pda، 5=ph (بافر استیک اسید- سدیم استات)، می باشد. روش پیشنهادی به طور موفقیت آمیزی برای اندازه گیری مقادیر ناچیز u(vi) (در محدوده 7-10×5 تا 5-10×1 مولار در نمونه های آب بکار رفته است. گزینش پذیری روش پیشنهادی با بررسی اثر مزاحمت ها در پاسخ تجزیه ای مورد بررسی قرار گرفت و مشخص شد که بیشتر یون های موجود در نمونه آب شامل یون های mg(ii) ,na(i) ,k(i) ,so4(ii) ,no3(ii) ,nh4(i) در اندازه گیری مزاحمتی ایجاد نکرده اند. با توجه به نتایج بدست آمده این روش به عنوان یکی از حساس ترین و گزینش پذیرترین روش ها برای اندازه گیری مقادیر ناچیز اورانیوم می تواند در نظر گرفته شود. واژگان کلیدی: اسپکتروفلورومتری، اندازه گیری، اورانیوم، پیریدین-2و6-دی کربوکسیلیک اسید

در این پژوهش، سه نانو ذره کوانتومی cds پوشیده شده با آسپارتیک اسید، zns پوشیده شده با آسپارتیک اسید و نقاط کوانتومی هسته –پوسته ی zns/cds پوشیده شده با آسپارتیک اسید با روش مایسل معکوس تهیه شدند. شکل، اندازه، ترکیب و اطلاعات طیفی این سه ترکیب توسط میکروسکوپ الکترونی روبشی ) (tem، طیف سنجی ir ، پراش اشعه x (xrd) و فوتولومینسانس بررسی شدند. نتایج نشان داد که نقاط کوانتومی cds، znsو هسته –پوسته ی zns/cds پوشیده شده با آسپارتیک اسید به ترتیب دارای اندازه تقریبی10-7 نانومتر، 15-10 نانومتر و 9-6 نانومتر هستند. همچنین مشاهده گردید که شدت فلورسانس نقاط کوانتومی هسته –پوسته ی zns/cds پوشیده شده با آسپارتیک اسید در مقایسه با شدت فلورسانس نقاط کوانتومی cdsو znsپوشیده شده با آسپارتیک اسید بسیار بهتر است. سپس اندر کنش این نقاط کوانتومی پوشیده شده با آسپارتیک اسید با تعدادی از یون های فلزی سنگین از جمله روی (??)، کبالت (??)، آهن (??) نیکل (??)، کادمیوم (??)و جیوه (??) با توجه به معادله اشترن- والمر مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که برهم کنش جیوه (??) با نقاط کوانتومی zns/cds پوشیده شده با آسپارتیک اسید برای تعیین جیوه (??) در بازه غلظتی 6- 10×1 تا 5- 10× 5 بسیار بهتر است چرا که با تشکیل کمپلکس، پایداری بیشتر ایجاد می شود. در مرحله بعد کمپلکس جیوه- نقاط کوانتومی zns/cds پوشیده شده با آسپارتیک اسید برای اندازه گیری ترکیبات تیولی از طریق جایگزین شدن هر یک از تیول های استفاده شده به جای نقاط کوانتومی مورد استفاده قرار گرفت. نتایج نشان داد که یک سری از ترکیبات تیولی رایج از جمله سیستئین، مرکاپتوسوکسینیک اسید، تیوگلایکولیک اسید و 2-مرکاپتو اتانول می توانند در بازه غلظتی 7-10×7 تا 6- 10×7 بخوبی توسط این روش اندازه گیری شوند

ترکیب 2-بورانیل اتن تیول و 25 استخلاف اش به عنوان مدل دربردارنده ی پیوند هیدروژنی دوتایی در سطح b3lyp با تابع پایه ++g**311-6 جهت تعیین ترتیب پایداری و امکان تشکیل پیوند هیدروژنی درون مولکولی بهینه شده اند.برای این ترکیب استخلاف هایbr ،cl ،f ،no2 ،nh2 ،nhch3 ،nhcoch3 ،ch2f ،ch2cl ،ch2oh ،ch3 ،cf3 ،oh ،ochf2 ،sh ،sch3 ،scf3 ،och3 ، ocf3،cn ،ch2cooh ،c2h5 ،ch2cf3 ،ch2och3 وcoh در نظر گرفته شده اند. مدل pcm در سطح dft/b3lyp برای تعیین اثر حلال و استخلاف ها بر ساختار و پیوند هیدروژنی استفاده شد. انرژی پیوند هیدروژنی برای این سیستم ها از روش اسپینوزا به دست می آید. نتایج محاسبات در دو فاز نشان می-دهند که استخلاف coch3 نسبت به سایر استخلاف ها پایدارتر است. به منظور مقایسه قدرت پیوند هیدروژنی، فرکانس های ارتعاشی و خمشی پیوندهای s-h و b-h محاسبه شده اند. نقاط بحرانی و طبیعت پیوند هیدروژنی توسط تئوری اتم در مولکول بادر مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. نتایج حاصل نشان می دهد که ? کوچک و?2? کوچک و مثبت است که نشان دهنده ی ویژگی الکترواستاتیک پیوند h…h است. در نهایت آنالیز پیوند هیدروژنی در این مولکول ها با نظریه aim به خوبی نتایج قبلی را تایید می کند. بررسی های اوربیتال پیوندی طبیعی (nbo)برای فهم بهتر ماهیت پیوند هیدروژنی درون مولکولی انجام شده است. روش nbo، طیف بینی nmr و جابه جایی شیمیایی، به خوبی فرکانس های کششی، به منظور ارزیابی برهم کنش های پیوند هیدروژنی برای تمام مشتقات در همان سطح محاسبه شده اند. محاسبات بالاترین اوربیتال مولکولی اشغال شده (homo) و پایین ترین اوربیتال مولکولی اشغال نشده(lumo) با فاصله اوربیتال های جبهه ای موجود اند.

محاسبات نظری تابعی چگالی(dft)مربوط به 4-نیتروپیریدین-3-تیول (npt) و استخلاف هایش گزارش شده اند. برای این ترکیب، استخلاف های f، cl،br،sh،oh، ch3، cf3، ch2f، ch2cl،ch2br،coch3،c2h5، ch2och3، ch2oh، ch2cf3، cn، och3، scoch3، sch3،cho،nhch3، ch2ch2oh، ch2cooh، ochf2، no2، scf3، nhcoch3و ph در نظر گرفته شده است.این محاسبات برای تمامی استخلاف های مذکور در سطح b3lyp/6-311++g**انجام گردیده و فرکانس های ارتعاشی نوسانگر هماهنگ نیز در همین سطح به منظور تأییدماهیّت نقاط ایستا و همچنین برای تصحیح انرژی نقطه صفر (zpve) تخمین زده شده اند. انرژی پیوند هیدروژنی برای تمامی استخلاف های مورد بررسی از طریق روش اسپینوزا به دست آمده است.نتایج حاصل نشان می دهد که قدرت پیوند هیدروژنی درون مولکولی به وسیله عدم استقرار الکترون های?درون حلقه کیلیت تحت تأثیر قرار می گیرد. نظریّه اتم ها در مولکول های بادر (aim) برای بررسی نقاط بحرانی و مطالعه ماهیّت پیوند هیدروژنی استفاده شده است.همچنین،برای فهم بهتر ماهیّت پیوند هیدروژنی درون مولکولی، بررسی های اوربیتال پیوندی طبیعی (nbo) صورت گرفت. محاسبات بالاترین اوربیتال مولکولی اشغال شده (homo) و پایین ترین اوربیتال مولکولی اشغال نشده(lumo) با فاصله اوربیتال های جبهه ای موجود اند. بعلاوه، محاسبات 1hnmrدر همان سطح انجام گردید. برای مطالعه بیشتر، ساختار مولکولی، پیوند هیدروژنی درون مولکولی و پایداری ترکیب 4-نیتروپیریدین-3-تیول (npt)و مشتقاتش با استفاده از نظریه تابعی چگالی(dft)با تابع پایه 6-311++g**در آب بررسی گردید. مدل pcmدر سطح dft/b3lypبرای تعیین اثر حلال و استخلاف ها بر ساختار و پیوند هیدروژنی استفاده شد. ماهیّت این برهمکنش ها که تحت عنوان پیوند هیدروژنی کمک رزونانس شناخته شده اند، بحث شده است. خواص تپولوژیکی توزیع دانسیته الکترونی بر پل هیدروژنی s–h•••oبا استفاده از نظریّه اتم ها در مولکول ها بررسی شد. در هر یک از فازهای گاز و محلول،روش اوربیتال پیوندی طبیعی، اسپکتروسکپی 1hnmr، همچنین فرکانس های ?s-hو?s-h در سطح b3lyp/6-311++g**به منظور استخراج برهمکنش های پیوندهیدروژنی، محاسبه شدند. از سوی دیگر، آروماتیسیته حلقه به وسیله چندین شاخص آروماتیسیته نظیر nics، homa، pdi، ati،fluوflu?در هر کدام از فازهای مورد مطالعه، تعیین شده است. انرژی های homoوlumoنشان می دهد که انتقال بار درون nptو مشتقات بررسیشده رخ می دهد. همچنین، اثر حلال بر خواص فیزیکی نظیر پتانسیل و سختی شیمیایی با استفاده از مدل pcmو با تابع پایه b3lyp/6-311++g**بررسی شدهاست. در ادامه برای واکنش های انتقال پروتون محاسباتی پیرامون حالت گذار نیز انجام شده و ساختار حالت گذار بهینه گردید، سپس انرژی فعّال سازی، ثابت آرنیوس، ثابت سرعت و پارامتر های ترمودینامیکی حالت گذار محاسبه شد.

محاسبات شیمی کوانتومی جهت تعیین ساختار هندسی، پیوند هیدروژنی درون مولکولی، فرکانس های ارتعاشی، ثابت های جفت شدن اسپین-اسپین،nmr و خصوصیات فیزیکی از قبیل پتانسیل شیمیایی و سختی شیمیایی 2-آمینو متیل بنزن تیول و 28 مشتق آن با استفاده از روش تابع چگال(dft/b3lyp/6-311++g**)در فاز گاز و محلول آبی انجام پذیرفت. به علاوه خصوصیات توپولوژیکی توزیع دانسیته الکترونی در پیوند هیدروژنی درون مولکولی s-h…n با استفاده از نظریه اتم ها در مولکول های بادر مورد بررسی قرار گرفت.همچنین تجزیه و تحلیلاوربیتال پیوندی طبیعی(nbo) برای فهم بهتر طبیعت بر همکنش های درون مولکولی انجام گرفت، نتایج تجزیه و تحلیل aim و nbo به خوبی نتایج محاسبات dft را تایید نمودند.از طرف دیگرآروماتیسیته حلقه ایجاد شده با استفاده از چندین شاخص آروماتیسیته از قبیل مدل نوسانگر هماهنگ آروماتیسیته(homa)، جابجایی شیمیایی مستقلاز هسته(nics)، شاخص عدم استقرار پارا (pdi) و شاخص نوسانی آروماتیسیتی(flu)ارزیابی شد. نتایج بدست آمده نشان داد که استخلاف r تاثیر بسزایی بر روی تغییرات انرژی فعال سازی دارد، همچنین روابط متعددی بین خصوصیات ترمودینامیکی، ساختاری، توپولوژیکی و پارامترهای انرژیتیکی به دست آمد .در این تحقیق، در سطح نظری b3lyp و تابع پایه 6-311++g** تاثیر استخلافات متفاوت(که در موقعیتr قرار گرفته اند) بر روی واکنش انتقال پروتون در ترکیب 2-آمینو متیل بنزن تیول و28 مشتق آن، در حضور کاتالیزگر هیدروژن فلوراید بررسی گردید. ضرایب همبستگی خوب بین انرژی فعال سازی در مقابل فرکانس های ارتعاشی به دست آمده است و نشان دهنده این واقعیت است که سد چرخشی واکنش انتقال پروتون به نوع استخلاف واقع در موقعیت r وابسته است.

خصوصیات ساختاری و الکترونی نانو¬لوله بریلیوم اکساید صندلی (5،5) با استفاده از روش تابعی چگال (dft) با سطح پایه g*31-6 مطالعه شده است. نظریه aim به منظور آنالیز خصوصیات نقطه بحرانی: دانسیته الکترون و لاپلاسین آن به کار¬برده شده است. همچنین محاسبات اوربیتال پیوندی طبیعی به منظور استخراج عدد اشغال اوربیتال اتمی طبیعی و بار تعادلی اتم برهمکنش¬کننده در فاصله تعادلی مولکول- نانو¬لوله انجام شدند. انرژی¬های اتصال بر اساس تنظیم خطای انطباق (bsse¬) با روش نیروی متقابل بویز-برناردی تصحیح شدند. محاسبات بالاترین اوربیتال مولکولی اشغال شده (homo) و پایین¬ترین اوربیتال مولکولی اشغال نشده(lumo) با فاصله اوربیتال¬های جبهه¬ای، پتانسیل شیمیایی، سختی شیمیایی و پارامترهای ترمودینامیکی مورد ارزیابی قرار گرفته¬اند. محاسبات جابه¬جایی شیمیایی برای آرایش¬های h با استفاده از روش (giao) محاسبه گردید. تأثیر جذب گاز hcn روی خصوصیات الکترونی نانو¬لوله بریلیوم اکساید بررسی شده است. جذب گاز hcn در نانو¬لوله بریلیوم اکساید شکاف انرژی را کاهش می¬دهد. نتایج ما نشان می¬دهد که نانو¬لوله بریلیوم اکساید صندلی (5،5)، کاندید مناسبی برای حسگر گاز می¬باشد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

چکیده ندارد.

تمام صورت بندی های ممکن برای ترکیب 3- آمینو- 5-تیوکسو – پنت- 2- انال در سطوح b3lyp و mp2 با تابع پایه g**++311-6 به منظور تعیین ترتیب پایداری صورت بندی ها و امکان تشکیل پیوندهای هیدروژنی درون مولکولی مختلف بهینه شده اند. نتایج محاسبات نشان می دهد که صورت بندی های کتو- آمین- تیو(kat) از صورت بندی های انول- ایمین- تیو(eit) و کتو- ایمین- تیو(kit) نظیر آن پایدارترند. انرژی پیوند هیدروژنی برای همه سیستم ها با استفاده از روش rrm بدست آمده است؛ ترتیب کاهش نسبی انرژی های پیوند به صورت زیر می باشد: o-h….nimine >namine–h….sthio > namine–h….oketo > nimine–h….sthio > nimine–h….oketo> > nimine–h….ohydroxyl طبیعت پیوند هیدروژنی درون مولکولی در صورت بندی های مختلف3- آمینو- 5-تیوکسو – پنت- 2- انال به وسیله تئوری اتم ها در مولکول ها (aim) و نظریه اربیتال های طبیعی (nbo) تجزیه و تحلیل شد. در نهایت ارتباط قابل قبولی میان قدرت پیوند هیدروژنی و نتایج حاصل از آنالیزaim و nbo بدست آمد. برای تکمیل محاسبات تمامی محاسبات ساختاری برای ترکیب مورد مطالعه و صورت بندی های آن در فاز محلول انجام و تأثیر حلال بر روی پایداری صورت بندی های مختلف مشخص شد. همچنین برای یک واکنش انتقال پروتون، محاسباتی پیرامون حالت گذار انجام و ساختار حالت گذار بهینه گردید، سپس انرژی فعال سازی، فاکتور فرکانس، ثابت سرعت و پارامتر های ترمودینامیکی حالت گذار محاسبه گردید.

پیوندهای هیدروژنی بین مولکولی در جفت بازهای اسید نوکلئیک یک نقش کلیدی در اختصاصی کردن ساختار آن ها بازی می کند. ساختار جفت باز a – t و ساختارهای مختلف پیش بینی شده مربوط به این جفت باز با استفاده از محاسبات ab- initio در سطح محاسباتی g** 31-6 hf/و در یک سری از سطوح نظریه تـابعی چگالی ، b3lyp/6-31g** و b3lyp/6-311++g**بهینه شد. پـارامترهای ساختـمانـی و انرژی های بهینه شده به دست آمد و بر روی پایداری ساختارهای مختلف جفت باز بحث گردید.پایدارترین ساختار، در میان ساختارهای مختلف، ساختار (i)at بود. علاوه بر این قدرت پیوند هیدروژنی n – h …n و o – h…n در ساختارهای مختلف جفت باز a – t با یکدیگر مقایسه شد. از طرف دیگر در مورد تأثیر مجموعه پایه بر روی انرژی بر هم کنش جفت باز a – t با استفاده از سطوح محاسباتی مختلف بحث گردید. نتایج محاسبات نشان داد که سطح محاسباتیb3lyp/6-31g** بیشترین برهم کنش با انرژی حدود 384/17- kcal/mol را دارا می باشد. توابع پتانسیل جفت باز a – t بر اثر انتقال یک پروتون و همچنین انتقال همزمان دو پروتون ، که شامل انتقال پروتون نیتروژن گروه آمین مولکول آدنین به نیتروژن گروه کربونیل مولکول تیمین و همچنین انتقال پروتون از نیتروژن تیمین به نیتروژن آدنین است، در سطح محاسباتی g** 31-6/b3lyp به دست آمد و نمودارهای surface و contoure مربوط به انتقالات پروتون ذکر شده رسم گردید