نام پژوهشگر: مجید محمد حسینی
سحر نادری بهزاد چهکندی
در این تحقیق، صورتبندی های مدل تری پپتید 2hco-gly-l-leu-gly-nh، که درساختار پلی پپتید پروتئین الاستین می باشد، در اثر چرخش زوایای دووجهی زنجیر جانبی و زوایای پیچشی اسکلت، در فاز گازی مورد مطالعه قرار گرفته است. همه محاسبات با استفاده از برنامه گوسین 2003 و با بهره گیری از سطوح تئوری hf و b3lyp با سری پایه (d) g31-6 انجام شده است. این تحقیق شامل 3 بخش می شود: بخش اول: ابتدا طی دو مرحله ساختارهای بهینه و انرژی برای صورتبندی های حاصل از چرخش زوایای دووجهی زنجیر جانبی ( 1?، 2? ) به فواصل °30 از صفر درجه تا 360 درجه محاسبه شدند که طی مرحله اول سه مینیمم در 60- = 1?، 60+ = 1? و 180= 1? بدست آمدند که به ترتیب ( g- )، ( + g) و (a) نامگذاری شدند که از میان این 3 مینیمم، صورتبندی (g- ) پایین ترین مقدار انرژی را دارا بود. در طی مرحله دوم، زاویه 1? در هر یک از سه حالت پایدار خود ثابت نگه داشته شد و برای هر کدام، زاویه دوم زنجیر جانبی (2? ) تغییر داده شد که از میان کل صورتبندی ها، صورتبندی با ( °= -602? ,°= -601? ) به عنوان پایدارترین حالت برای زنجیر جانبی بدست آمد. بخش دوم: سپس برای صورتبندی ها ی حاصل ازچرخش زوایای پیچشی اسکلت، ساختارهای بهینه، انرژی و مقادیر ترمودینامیکی من جمله انرژی آزاد گیبس، آنتالپی و آنتروپی در فواصل °30 از صفر تا °360 محاسبه شدند که این محاسبات بر روی صورتبندی پایدارتر ) -- g - (gحاصل از چرخش ( 1?، 2? ) انجام گرفت. هنگامی که 1?، 1?، 3? و 3? در °180 قرار داشتند، پایدارترین حالت آنها می باشد. اما در مورد زوایای پیچشی لوسین، ( 2?، 2? )، هنگامی که ( 120- = 2?، 180= 2? ) و ( 180 = 2?، 150 = 2? ) باشند پایدارترین حالت آنها می باشد، که با بزرگتر شدن زنجیر جانبی متصل به c? اسید آمینه، انحراف زوایای دو وجهی از °180 بیشتر می شود. بخش سوم: ساختارهای بهینه، انرژی و توابع ترمودینامیکی صورتبندی های حاصل از چرخش زوایای دو وجهی اسکلت تری پپتید مذکور طبق نقشه راماچاندران در سه حالت (?l -x-(?l، ( ?l-?l- x) و (x -?l-?l ) در حالیکه زنجیره جانبی در پایدارترین حالت خود )-- g - (gثابت شده بود، محاسبه شدند، نتایج حاصل از این محاسبات نشان داد که صورتبندی l?l?l? در هر سه حالت، پایدارترین صورتبندی می باشد. در نهایت با توجه به نتایج، می توان گفت جاذبه دو قطبی ـ دو قطبی و آنتروپی در پایداری صورتبندی های معین دی آمید های اسید آمینه نقش اساسی ایفا می کنند.
حسین خاکپور حبیب الله یونسی
در این پژوهش تلاش شد که شرایط مطلوب جذب به واسطه بهره گیری از مخمر ساکرومایسس سرویزیا (به عنوان پسماند فرآیندهای صنایع غذایی) با لحاظ کردن متغییر های غلظت یون فلز در محلول و ph محلول آبی به همراه جرم بیومس خشک ساکرومایسس جهت حصول شرایط بهینه تحقیق شود. خلاصه نتایج بخش آزمایشگاهی حاکی از آن است که :1. بیومس آماده سازی شده ساکرومایسس دارای عملکردی به مراتب مناسب تر از بیومس بدون آماده سازی است.2. جاذب در شرایط ph برابر 5.08 و مقدار ppm 100یون سلنیوم موجود در محلول و به ازای g/l 2 مخمر دارای بهترین میزان جذب از محیط بود، 1.37±76.6%= r% و mg/g 2.13±38.316q = به دست آمد. نتایج دادکه این مخمر در جذب زیستی یون سلنیوم از محلول آبی توان مناسبی دارد. در مدل سازی برای جذب روی (2+)، کادمیوم (2+) و کوبالت (2+) با استفاده از قارچ aspergillus niger معادلات جذب langmuir،frindlich،sips وtemkin با استفاده از شبکه عصبی و الگوریتم ژنتیک matlab جهت یافتن ضرایب ثابت معادله پیگیری شد.در مورد شبکه های عصبی جهت رسیدن به نتایج بهتر نیاز به آموزش بیشتر شبکه بود. در معادله لانگ مویر، هر سه مورد از فلزات در محدوده ابتدایی غلظت از 0 تا ppm 10 جواب های تخمین زده شده از صحت مناسبی برخوردار است. در معادله فرندلیچ نتایج میانی در محدوده 50 تا ppm 200و برای کوبالت هم در محدوده 100 تا ppm 200و برای روی از 150 تا ppm280 جواب های تخمین زده خطای نسبتاً قابل قبولی برخوردار است. در معادله سیپس هم از محدوده 20 تاppm 200 جواب ها برای روی، برای کادمیوم از 10 تا ppm 120 و برای کوبالت از 0 تا ppm 230 نتایج از همخوانی و مطابقت داده های آزمایشگاهی و تخمین های ناشی از الگوریتم حکایت کرد. در معادله تمکین نتایج ناشی از تخمین الگوریتم ژنتیک از 0 تا ppm 280 برای روی و از 0 تا ppm 230 برای کوبالت با داده های آزمایشگاهی همخوانی در خور توجه ای داشت و خطای کلی آن در مورد روی برابر 6.8% و برای کوبالت برابر 5.6% بود.
حمید کریمی فرد ابراهیم نجفی کانی
توزیع اندازهء ذرات یک ماده بیانگر درصدی از جرم کل ماده است که بر اساس آن متوسط اندازهء ذرات و محدودهء اندازهء آن ها تعیین می شود و یکی از اصلی ترین خصوصیات فیزیکی ماده را تعیین می سازد. توزیع اندازهء ذرات بر روی چگالی، تراکم، و فرآیند هیدراسیون پودرها اثر گذاشته و از این رو باعث تغییر در ویژگی هایی از قبیل آب دوستی، سیالیت، مقاومت، ساختارهای میکروسکوپی و دیگر خواص مهندسی می شود. از گذشته تا به امروز تلاش های فراوانی برای ارتباط بین توزیع اندازهء ذرات در موادی که دارای خاصیت سیمانی و سخت شدن هستند، صورت گرفته است. گچ از جمله موادی است که دارای خاصیت سخت شدن می باشد و توزیع اندازهء ذرات بر روی خواص مهندسی آن تاثیر بسزایی دارد. مسلما در پلاسترهای مختلف، توزیع اندازهء ذرات، متفاوت می باشد و این تفاوت، تغییر در خواص پلاسترها را منجر می شود. با توجه به این که بیش از 80 درصد از حجم گچ ساختمانی تولیدی در کشور در استان سمنان تولید می شود] 3 [. لذا در این تحقیق، اثر توزیع دانه بندی بر زمان گیرش، مقاومت فشاری و نیاز به آب محصولات 12 واحد تولیدی مورد ارزیابی قرار گرفته که اکثر آن ها از کارخانجات فرآوری گچ در استان تهیه شده اند و سعی شده است که ارتباط منطقی میان دانه بندی پلاسترها و تاثیر آن بر زمان گیرش، مقاومت فشاری و نیاز به آب برای رسیدن به خواص مهندسی مطلوب و مطابق با استاندارد ایجاد گردد. همچنین، ارتعاشات خمشی، کششی و انتقالات الکترونی یون سولفات موجود در گچ به وسیله آنالیز طیفی مادون قرمز مورد بررسی قرار گرفته است و درصد ترکیبات اکسیدی موجود در پلاسترها به وسیله روش فلورسانس اشعه ایکس تعیین شده است.
مهدی محسنی بهزاد چهکندی
در این تحقیق مقادیر انرژی، زوایای دای هدرال، نوع مهاجرت ها و تاخوردگی صورت بندی های انواع lو d دی پپتید محافظت شده سیستئین – آلانین در فاز گازی با استفاده از محاسبات مکانیک کوانتومی در سطح b3lyp و سری پایه 6-31g(d)تعیین گردید.ساختار های پایدار در حالت های متفاوت از مناطق 9 گانه ی نقشه راماچاندران بدست آمده اند. بدین ترتیب که یکی از آمینواسید ها در یک منطقه ثابت نگه داشته شده و آمینواسید دیگر در مناطق مختلف نقشه راماچاندران تغییر می-یافت. زنجیر جانبی آمینواسید در سه حالت آنتی، گوچ مثبت و گوچ منفی قرار داده شده که برای هر کدام از حالت های زنجیر جانبی، 81 حالت و در مجموع برای هر کدام از آمینواسید ها، 243 حالت محاسبه شده است. نتایج محاسبات نشان می دهد که در دی پپتید محافظت شده l و d سیستئین – آلانین، فرم های پایدار به عنوان یک تاخوردگی نوع بتا یا به اصطلاح بتا ترن، در نقشه ی راماچاندران وجود ندارند.
محمود بذرافشان مجید محمد حسینی
مطالعه ارتباط کمی ساختارـخاصیت (qspr) یکی از راهکارهای توانمندو مناسب جهت مدل سازی و پیش بینی بسیاری از پارامترهای کلیدی مرتبط با علوم پایه است.هدف از این تحقیق ارایه یک مدل مناسب جهت پیش بینی ضریب شکست و دانسیته برخی از ترکیبات الی و همچنین روند لگاریتمی حلالیت دو نوع فولرن نظیر c60و c70در ترگیبات الی می باشد که توسط این مدل ضریب شکست دانسیته و حلالیت ترکیبات مشابه را بدون انجام ازمایشات وقت گیر و پر هزینه پیش بینی کرد.ابتدا ساختار تمام مولکول ها مورد نظر توسط نرم افزارهایپر کم رسم و سپس بهینه شدند.جهت ارایه یک مدل مستحکم و توانمند توصیف کننده های مولکولی توسط نرم افزار دراگون محاسبه شدند.سپس با انجام عملیات مقدماتی شامل حذف موارد اضافی و توصیف کننده های غیر مرتبط به ترین انها توسط روش مرحلهای الگوریتم زنتیک یا هر دو انتخاب و سپس توسط روش رگرسیون خطی چندتایی مدل سازی انجام شد.سپس به وسیله ی روش های ارزیابی تقاطعی و ارزیابی بیرونی اعتبار مدل های ساخته شده تایید شد.همبستگی و ضریب تعیین بالا و توزیع منطقی مقادیر باقیماندهها و خطاهای کم مدل های ایجاد شده دلالت بر توانمندی مدل ها داشته و امکان پیش بینی مناسب خواص فوق الذکر ترکیبات مختلف را دارد.این پایان نامه شامل شش فصل است.فصل اول در مورد پیشینه تحقیق و مقدمه ای بر کمومتریکس می باشد . در این فصل ترجمه ای از کارهای صورت گرفته مرتبط با ضریب شکست دانسیته وحلالیت فولرن ها صورت گرفت.در فصل دومدر مورد مفاهیمی همچون مزایای qsprروش های مدل سازی مراحل انجام qspr انتخاب سری داده ها محاسبه تو صیف کننده ها و انواع توصیف کننده هاو...... بحث شدفصل سوم چهارم وپنجم کارهای تجربی می باشد وفصل ششم بحث و نتیجه گیری از این پایان نامه می باشد
سمیرا صادقی احسان زاهدی
در نانوتیوب زیگزاگ (10.0) هیبرید شده پنج اتم بور با موقعیتهای مختلف وجود داردکه از لحاظ انرژی امادگی بالا جهت برهمکنش با اتم تیتروژن گاز دی اکسید نیتروژن دارد طی برهمکنش این گاز بانانوتیوب هیبریدی، مشخصات ساختاری و الکترونی نانوتیوب، دچار تغییرات خواهد شد. در این تحقیق میزان این تغییرات و اتم بور مولکول نانوتیوب موضع جذب بر روی این تغییرات بررسی میشود . کلمات کلیدی : اتم ، نانوتیوب ، مولکول ، هیبرید
کبری احمدی بهزاد چهکندی
در این تحقیق،کنفورماسیون های مدل تری پپتید gly- ser - gly که درساختار پلی پپتید مادر پروتئین فیبروئین می باشد،در اثر چرخش زنجیر جانبی و زوایای پیچشی اسکلت،در فاز گازی مورد مطالعه قرار گرفته است.همه محاسبات با استفاده از برنامه گوسین 2003 و با بهره گیری از سطوح تئوری hf با سری پایه(d)g31-6 وg(d, f)++311- 6 و سطح b3lyp با سری پایه(d)g31-6 انجام شده است. ابتدا ساختارهای بهینه و انرژی برای کنفورماسیون های حاصل از چرخش زاویه(?)،به فواصل°30 از صفر درجه تا°360 محاسبه شدند که سه مینیمم در90- =? و180 =? و60 =? بدست آمد.سپس برای کنفورماسیون های حاصل ازچرخش زوایای پیچشی اسکلت ساختارهای بهینه،انرژی و مقادیر ترمودینامیکی انرژی آزاد گیبس،آنتالپی وآنتروپی درفواصل°30 ازصفر تا°360 محاسبه شدند که این محاسبات بر روی کنفورمر پایدارتر(90- =? )حاصل از چرخش(?)انجام گرفت.هنگامی که2?،2?،3?و3?در°180بودند پایدارترین حالت بدست آمد امّا در مورد زوایای پیچشی 30=1? و30=1?بودند پایدارترین حالت یافت شد که به علت وجود زنجیره جانبی سرین می باشد. همچنین ساختارهای بهینه، انرژی و توابع ترمودینامیکی کنفورمرهای حاصل از چرخش زوایای دو وجهی آمینواسید مرکزی(سرین)طبق نقشه راماچاندران در هرسه حالت (90- =?) ، (180 =?) و (60 =?) در سطح b3lyp و سری پایه (d)g31-6 محاسبه شدند که کنفورمر l?l?l? در هر سه حالت پایدارترین کنفورمر یافت شد. با توجه به نتایج، می توان چنین گفت که: جاذبه دو قطبی ـ دو قطبی و ایجاد پیوند هیدروژنی
سعیده لطفی علی اصغر روحانی
آلودگی خاک به ترکیبات نفتی یکی از شایع ترین معضلات زیست محیطی می باشد. گیاه پالایی با استفاده از مهندسی گیاهان سبز شامل گونه های علفی و چوبی برای برداشت مواد آلاینده از آب و خاک یا کاهش خطرات آلاینده های محیط زیست نظیر فلزات سنگین، عناصر کمیاب، ترکیبات آلی و مواد رادیواکتیو به کار برده می شود. هدف در این پژوهش تعیین گونه مناسب گیاهی (از لحاظ مصرف آب و مقاومت در برابر آلاینده ها) جهت ایجاد و توسعه فضای سبز در تاسیسات شرکت نفت با توجه به اقلیم منطقه می باشد. روش تجزیه و تحلیل اطلاعات، به روش تطبیقی– تحلیلی و با مقایسه نتایج حاصل از نمونه برداری ها و مقایسه آنها با جداول استاندارد داخلی و خارجی می باشد. به منظور انتخاب نهایی و اولیت بندی گزینه ها (گونه های گیاهی مناسب کاشت در سایت)، از روش فرآیند تحلیل سلسله مراتبی (ahp ) استفاده می گردد. به جهت بررسی و سنجش نمونه خاک از روش xrf و icp استفاده شده است. روغن اسانسی گیاه سرو خمره ای، از اندام های ساقه و برگ توسط روش تقطیر با آب و با استفاده از دستگاه اسانس گیری کلونجر استخراج گردید. نتایج حاصل از تکنیک ahp برای انتخاب نهایی و اولویت بندی گزینه ها نشانگر آن است که در مجموع و با بررسی تمامی فاکتورهای اصلی و فرعی، بیشترین امتیاز متعلق به گونه ارس ویرجینیایی (ژونی پرس) می باشد و سپس کاج ایرانی و بعد از آن سرو نقره ای (سیمین)، توت مجنون، درخت عرعر، پیراکانتا، درختچه توری، ماگنولیا و اقاقیا توپی در رتبه های بعدی قرار گرفتند. در بررسی و سنجش نمونه خاک در مورد فلزات سنگین حاکی از آن است که در نمونه کلی کادمیم، کبالت، سرب و استرانسیم و در نمونه بیمار نیکل، سرب، استرانسیم و زینک بالاتر از حد استاندارد گزارش شده است. با بررسی کروماتوگرام و طیف های جرمی حاصل از دستگاه gc-ms نشان داده شد که در روغن اسانسی حاصل از اندام هوایی این گیاه به روش hd در نمونه بیمار، 29 ترکیب و در نمونه سالم، 22 ترکیب که در مجموع 80/98% کل اسانس را تشکیل می دادند، شناسایی گردید.
ساجده قدمیان مقدم احمد حسینی
بنزین به عنوان یکی از مهمترین محصولات صنعت پالایش نفت خام، ترکیبی از پارافین ها ، الفین ها، نفتن ها و آروماتیکها می باشد. درطول ذخیره سازی بنزین، هیدروکربن های ناپایدار مانند الفین ها و دی الفین ها، با اکسیژن هوا واکنش داده و تغییراتی در خواص فیزیکی و شیمیایی آنها ایجاد می شود. در اثر واکنش اکسیداسیون، مولکول هایی غیر فرار با جرم مولی بالا که عمدتا صمغ نامیده می شوند، تشکیل می گردد. این رسوبات که در سیستم سوخت خودرو، کاربراتور و دریچه ورودی تشکیل می شوند، باعث ایجاد مشکل در عملیات و نقص در سوخت خودرو می گردد. پارامترهای تأثیرگذار بر تشکیل صمغ، میزان فلزات سنگین، درصد غلظت مواد الفینی، ماندگاری طولانی و شرایط نامساعد نگهداری می باشند،لذا در این تحقیق، افزاینده هایی که جزء ترکیبات اکسیژنه می باشند، برای بنزین در نظر گرفته شده اند که در ابتدا از نظر اقتصادی به صرفه بوده، با محیط زیست سازگار باشند، سنتزشان کار ساده ای باشد و موجب تغییرات گسترده ای در خواص بنزین نشوند.