نام پژوهشگر: محمد شفیعی

جبروارهای کورانت و ارتباط آنها با خمینه های 2-همتافته
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ولی عصر (عج) - رفسنجان - دانشکده ریاضی و کامپیوتر 1389
  مجید محمدی انایی   محمد شفیعی

خمینه های چند همتافته وجبروارهای کورانت دو مفهوم هندسی هستند که برای توصیف نظریه میدان ها در فیزیک سودمند هستند این دو مفهوم در این پایان نامه معرفی شده وفضای مشاهده پذیرهای وابسته به ]نها که در هندسه به لی - بینهایت جبر موسوم هستند مقایسه خواهد شد.

m-چندگوناها و نظریه ی عمومی فردهولم
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ولی عصر (عج) - رفسنجان - دانشکده ریاضی و کامپیوتر 1389
  سجاد محمدی   محمد شفیعی

پلی فلدها, فضاهای توپولوژیک هاسدورف با پایه ی شمارش پذیری هستند که برخلاف خمینه های توپولوژیک دارای بعد متغیر میباشند. هدف اصلی ما در این پایان نامه, معرفی پلی فلدها و معرفی مفاهیمی مانند فضای مماس, کلاف تاری, قضیه ی تابع ضمنی و ... روی پلی فلدها است.همچنین درکنار آن نظریه ی عمومی فردهولم که با ساختمان ها مرتبط است, نیز مورد بررسی قرار خواهد گرفت. پلی فلدها و نظریه ی عمومی فردهولم کاربرد گسترده ای در مسائل متنوعی شامل نظریه ی فلوئر, نظریه ی گروموف-ویتن, هومولوژی سایا و نظریه ی میدان همتافته دارند.

معرفی خمینه های چندهمتافته و بررسی مشاهده پذیرهای وابسته به آن ها
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ولی عصر (عج) - رفسنجان - دانشکده ریاضی 1389
  مهناز ترابی   محمد شفیعی

در این پایان نامه مفهوم فرم چند همتافته به هر فرم دیفرانسیل بسته و ناتبهگون روی یک خمینه دلخواه گسترش داده می شود. فرم های همتافته و فرم های حجم بطور طبیعی در زمره فرم های چند همتافته قرار می گیرند. علاوه بر این دو حالت خاص، حالات جالبتری همچون گروه های لی فشرده ساده که حامل یک ساختار 2- همتافته هستند نیز وجود دارد. اولین کسی که بطور دقیق تر خمینه های چند همتافته را مورد بررسی قرار داد مارتین است .البته تعریفی که او برای ساختارهای چند همتافته ارائه داد با تعریفی که در این پایان نامه ارائه خواهد شد قدری متفاوت است. در این پایان نامه علاوه بر معرفی ساختار چند همتافته و ارائه مسائل مهم در این زمینه، فضای مشاهده پذیرهای وابسته به یک ساختار چند همتافته نیر معرفی خواهد گردید و نشان داده خواهد شد این فضا یک لی 2- جبر است. ساختار پایان نامه به این شرح است: فصل اول که شامل تعاریف و مفاهیم اولیه در مورد فضاهای برداری همتافته، گروه ها، جبرهای لی و لی 2- جبرها است. در فصل دوم به معرفی خمینه های چند همتافته می پردازیم و در پایان دو مثال مهم از خمینه های چند همتافته را ارائه می دهیم. در فصل سوم با استفاده از میدان های برداری همیلتونی به تعریف براکت پوآسن می پردازیم و همچنین مشاهده پذیرها را در خمینه های چند همتافته معرفی کرده و براکت پوآسون را روی آن ها تعریف می کنیم.

خالص سازی آنزیم آلفا- آمیلاز از bacillus sp. جداشده از چشمه آبگرم استان اردیبل
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بوعلی سینا - دانشکده علوم کشاورزی 1390
  صمد گودرزی   علی دلجو

آلفا-آمیلاز آنزیمی است که پیوند های آلفا تشکیل دهنده پلی ساکارید هایی همچون نشاسته و گلیکوژن را شکسته و به گلوکز و مالتوز تبدیل می کند. آلفا-آمیلاز های ترموفیل برای استفاده در صنعت بسیار مهم می باشد. آمیلازهای تجاری بیشتر از باسیلوس یا آسپرژیلوس بدست می آید. علی رغم مشابهت توالی پروتئینی آلفا - آمیلاز در باکتری مزوفیلbacillus lichenifromis باb.stearothermophilus و bacillus amyliquuefaciens آنزیم آمیلازی این سویه مقاومت دمایی بیشتری را نشان می دهد به همین دلیل از آلفا-آمیلاز b.licheniformis به طور گسترده ای در فرایند مایع سازی نشاسته استفاده می شود. در این مطالعه آنزیم آلفا-آمیلاز مقاوم به حرارت از باکتری bacillus sp. جدا شده از آبگرم استان اردبیل خالص سازی و خصوصیات آن شرح داده شد. در نخستین گام مشخص شد که شرایط رشد و تولید آنزیم این باکتری دمای 40 درجه سانتی گراد و ph 9 به صورت بهینه است. سپس آنزیم سویه مورد نظر به وسیله کروماتوگرافی تعویض یونی و فیلتراسیون ژلی جدا و خالص سازی شد. مطالعه sds-page وجود تک باند 56 کیلو دالتونی را نشان داد. مطالعات آنزیم شناسی نشان داد که بهینه دمای فعالیت آنزیم 80 درجه سانتی گراد و ph بهینه آن 7 بود. همچنین حضور عناصر mg2+، ca2+ و+ k باعث تحریک فعالیت آنزیم وmn2+ ، zn2+ ، cu2+ ،3+ al ، fe 2+ ،+ li ، ni + ، co+، sds، edtaباعث کاهش فعالیت آنزیم شد، در حالی که بتا- مرکاپتواتانول و pmfs تاثیری بر روی فعالیت آنزیم نداشتند. مقدار vmax و kmبرای نشاسته به ترتیب 35/7 و 48/3 محاسبه گردید. با توجه به خصوصیات به دست آمده این آنزیم می تواند در صنایع غذایی کاربرد داشته باشد.

بررسی و اندازه گیری تغییرات شکل موج سیگنال تخلیه جزئی در اثر پیری حرارتی شین ژنراتور
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعت آب و برق (شهید عباسپور) - دانشکده مهندسی برق 1388
  محمد صادق جمالی   محمد شفیعی

بهره برداری مطمئن از ژنراتورهای بزرگ وابستگی شدیدی به سلامت عایق سیم پیچ استاتور دارد. بنابراین عیب یابی سیم پیچ استاتور، از مهمترین کارهایی است که جهت تضمین عملکرد مطمئن ماشین و افزایش طول عمر آن می بایست اجرا نمود. چرا که خطاهای عایقی از مهمترین عوامل شکست ماشین و از کار افتادگی آن می باشد. تست تخلیه جزئی از مهمترین تست های تشخیص سلامت شینه استاتور بوده و نتایج مفید و قابل اعتمادی در این زمینه در اختیار می گذارد. از سوی دیگر یکی از استرس های موجود روی شینه ژنراتور استرس حرارتی است که اگر این استرس مکررا به سیم پیچ اعمال و از روی آن برداشته شود، منجر به بروز تنش-هایی بین عایق و مس شینه و به تبع باعث ورقه ورقه شدن عایق اصلی می گردد. در نیروگاه های گازی و هیدروژنراتورهایی که در پیک بار مورد استفاده قرار می گیرند، این پدیده به وفور دیده می شود. چراکه در این نیروگاه ها در مدت زمان کمی بار به حالت نامی می رسد (وبه تبع آن دمای سیم پیچ افزایش می-یابد) و بعد از چند ساعت کارکردن مجددا بی بار می شود (و به تبع آن دما کاهش می یابد) به اجرای این فرایند در آزمایشگاه تست سیکل حرارتی می گویند. در این پایان نامه، توسط تست سیکل حرارتی، یک شینه نو یدکی از نیروگاه کارون 3، تحت فرایند پیرسازی حرارتی قرار گرفته است. در این فرایند دمای سیم پیچ به تدریج تا 120oc افزایش و سپس به تدریج تا 50oc کاهش داده می شود و این سیکل 500 بار تکرار شده و هر 25 بار در دمای 50oc در سیکل خنک کردن یک بار تست تخلیه جزئی روی شینه اجرا می گردد. تست سیکل حرارتی مطابق استاندارد ieee 1310-96 اجرا شده است. شکل موج سیگنال تخلیه مشابه پاسخ ضربه یک سیستم است بنابراین در این پایان نامه تغییرات اندازه، دوره (پهنا)، زمان پیشانی، زمان دم، نیم زمان پیشانی، نیم زمان دم و پهنای 70% پیک شکل موج سیگنال تخلیه حین پروسه سیکل حرارتی، بررسی می شود. در مطالعات تخلیه جزئی، توجه خاصی به آنالیز ویولت صورت پذیرفته است. البته این توجه بیشتر معطوف به نویززدایی از داده های تخلیه می باشد. اما موضوعی که اهمیت به سزایی در کاربرد آنالیز ویولت در مطالعات تخلیه جزئی دارد، ویولت مادر است. در مطالعات تخلیه جزئی کدام ویولت بهترین ویولت است؟ در این پایان نامه همچنین سعی شده به این پرسش پاسخ داده شود. از این رو در میان خانواده ویولت هایی که توسط پاسخ ضربه محدود فیلترشان (که رابطه ی آینه ای خاصی بین فیلترها وجود دارد) توصیف می-شوند، بهترین ویولت مادر برای سیگنال تخلیه این شینه در فرایند پیرسازی، جستجو می گردد.

پهنه بندی اکولوژیکی گیلاس در شهرستان سروآباد با استفاده از سیستم اطلاعات جغرافیایی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه بیرجند - دانشکده ادبیات و علوم انسانی 1391
  محمد شفیعی   جواد میکانیکی

تجربه ثابت کرده است که با شناخت شرایط محیطی و برنامه ریزی متناسب با آن می توان بازده تولیدی زمین را بالا برد. پهنه بندی اکولوژیکی_کشاورزی روش و شیوه ای نوین جهت مدیریت و برنامه ریزی بهتر اراضی کاربرد دارد. در این پژوهش پهنه بندی اکولوژیکی گیلاس به جهت اینکه تاکنون مطالعه ای در این زمینه در شهرستان سروآباد صورت نگرفته، از اهمیت بالایی برخوردار است. بیشترین جمعیت شهرستان (حدود 92 درصد) در روستاها بسر می برد و اقتصاد آنها بر پایه کشاورزی است و فعالیت باغداری به دلیل وضعیت خاص منطقه نسبت به زراعت رونق بیشتری دارد. با توجه به اینکه این محصول ارزش اقتصادی بالایی دارد، تعیین مکان های بهینه برای احداث باغ گیلاس به منظور کمک به تولید و اقتصاد جامعه خصوصا جامعه روستایی، از این جهت که درآمد بالایی را می تواند برای آنها داشته باشد، منفعت زیادی را بدنبال دارد. بنابراین پس از بررسی خصوصیات فنولوژیکی و فیزیولوژیکی گیاه، معیارهای اقلیمی و طبیعی (توپوگرافی، خاک، زمین شناسی، پوشش گیاهی، کاربری اراضی، منایع آب، درجه حرارت، بارش، رطوبت و تبخیر) برای تحلیل در نظر گرفته شدند. نقشه های اقلیمی با استفاده از آمار بلند مدت ایستگاههای هواشناسی تهیه شد و سپس از مدل بولین و مدل تحلیلی سلسله مراتبی جهت وزن دهی لایه های 16 نقشه معیار استفاده شد که در نهایت با تلفیق آنها در محیط gis، پهنه هایی با درجه اهمیت متفاوت جهت کاشت گیلاس برای کل اراضی شهرستان سروآباد تعیین گردید. نتایج برآمده از روش بولین در دو پهنه مناسب و نامناسب و مدل تحلیلی سلسله مراتبی 5 پهنه به ترتیب بسیار مناسب، مناسب، متوسط، ضعیف و نامناسب حاکی از آن است که مساحت زیادی از اراضی منطقه برای فعالیت مورد نظر از وضعیت مطلوبی برخوردار است. ضمن اینکه دقت روش تحلیلی سلسله مراتبی از بولین بیشتر است و می توان آن را به عنوان مدلی که با واقعیت تطابق بیشتری دارد معرفی کرد.

ایجاد باکتری e.coli نوترکیب حاوی ژنهای تولیدکننده ی پلی هیدروکسی آلکانوآت (pha)
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید چمران اهواز - دانشکده علوم پایه 1391
  مریم جاری   حمید گله داری

نام خانوادگی: جاری نام: مریم عنوان: ایجاد باکتری e.coli نوترکیب حاوی ژنهای تولید کننده ی پلی هیدروکسی آلکانوآت pha)). اساتید راهنما: دکتر سعید رضا خاتمی- دکتر حمید گله داری استاد مشاور: دکتر محمد شفیعی درجه تحصیلی: کارشناسی ارشد رشته: ژنتیک دانشکده:علوم محل تحصیل: دانشگاه شهید چمران اهواز تاریخ فارغ التحصیلی: 26/6/91 تعداد صفحات: 91 کلمات کلیدی: پلی هیدروکسی بوتیرات (phb)، ralstonia eutropha h16، ژنهای phbcab. چکیده: پلی هیدروکسی بوتیرات (phb)، دسته ای از پلی هیدروکسی آلکانوآت (pha)، گروهی از پلیمرهای ذخیره ای باکتریایی می باشند که بوسیله ی ارگانیسم های متعددی در پاسخ به محدودیت غذایی تولید می گردند. این پلیمر ها، پلاستیک های زیست تخریب پذیر می باشند که می توانند جایگزین خوبی برای پلاستیک های پتروشیمیایی رایج باشند. ralstonia eutropha h16 یکی از تولیدکنندگان بالقوه ی phb می باشد. اگرچه توانایی تولید و انباشته کردن این پلیمر در r.eutropha به اثبات رسیده است، ولی هزینه ی تولید بسیار بالای آن، بکارگیری pha را بعنوان بیوپلاستیک محدود کرده است. از اینرو تلاش های زیادی برای کاهش هزینه ی تولید از طریق ایجاد باکتری های نوترکیب و استفاده ی منبع کربن ارزان انجام شده است. phb طی 3 مرحله ی آنزیمی شامل یک آنزیم ?-کتوتیولاز (phba)، یک استواستیل coa ردوکتاز (phbb) و یک pha پلیمراز (phbc) سنتز می گردد. در این مطالعه اپرون 3 ژن کد کننده ی آنزیمهای تولید کننده ی phb شامل ژنهای phbcab از ژنوم استخراج شده r.eutropha با استفاده از پرایمرهای دارای جایگاه برش آنزیم محدود کننده bamhi و hindiii تکثیر و به وکتور بیانی pet28a کلون گردید و به e.coli سویه ی dh5? و bl21 ترانسفورم و صحت ترانسفورماسیون با کلونی pcr، هضم آنزیمی پلاسمید استخراج شده و تعیین توالی تأیید شد.

تقارن برای معادلات دیفرانسیل و حساب تغییرات
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ولی عصر (عج) - رفسنجان - دانشکده علوم ریاضی 1391
  هادی صادقی   سید محمد حسینی

در این پایان نامه روشی را براساس گروه تقارن و استفاده از جبر لی برای بدست آوردن جوابهای تحلیلی معادلات دیفرانسیل بررسی می کنیم و جوابهای تحلیلی چند معادله دیفرانسیل مشهور مانند گرما، موج و ‎‏کی دی وی و غیره را مورد مطالعه قرار می دهیم. سپس از تئوری jet و علامتگذاری گسترده‏‏‏‏‏تری از معادلات دیفرانسیل قابل استفاده برای فرمول بندی این مفاهیم از نرم افزار maple استفاده می کنیم. هدف اصلی این کار قانون‏های پایداری در دسترس برای محاسبات عملی می‏‏‏‏‏باشد بطوری که ممکن است یک تناظر یک‏به‏یک بین تقارن داده شده در مساله تغییرات‏ ‎(variational problem)‎ و قانون پایداری در هر دو جهت یافت شود. با این هدف دو قسمت موازی در این کار وجود دارد، قسمت نظری که بازنگری و تفسیری از قانون‏های پایداری از طریق قضیه نوتر‏ ‎(noether)‎ است و قسمت عملی کار شامل اجرای همه مفاهیم و الگوریتم ها در نرم افزار maple می‏باشد.

معرفی و بررسی شار خمیدگی همتافته
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ولی عصر (عج) - رفسنجان - دانشکده ریاضی و کامپیوتر 1391
  سیده سمیه شهامی   محمد شفیعی

در این پایان نامه، ضمن معرفی خمینه های هرمیتی، تقریباً هرمیتی، کاهلر و تقریباً کاهلر و نیز معرفی فضای (??(tm هموستارهای هرمیتی متعارف روی خمینه های تقریباً هرمیتی (مانند هموستار چرن) تعریف می شود. علاوه بر این، تاب هموستارهای هرمیتی و برقرار برای آن ارائه شده و نشان داده می شود و نامساوی های برقرار برای آن ارائه شده و نشان داده می شود که برای هر ساختار تقریباً هرمیتی (g,j) روی خمینه m، یک هموستار هرمیتی یکتا با کمترین تاب وجود دارد. در پایان، یکشار سهموی موسوم به شار خمیدگی همتافته روی خمینه های تقریباً کاهلر . معرفی می گردد.

ارتباط هندسه ی همتافته و اختلالات کوانتومی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ولی عصر (عج) - رفسنجان - دانشکده ریاضی و کامپیوتر 1392
  حسن محسنی   محمد شفیعی

هر خمینه ی همتافته ی به لحاظ فیزیکی فضای فاز یک دستگاه مکانیکی کلاسیک است. مشاهده پذیرهای این دستگاه مکانیکی ‎‏همان نگاشت های هموار روی‎ هستند . فرم همتافته ی این خمینه ی همتافته یک براکت لی روی‎ آن القا می کند که فضای مشاهده پذیرها با ‏این براکت‏، یک جبر لی است. در این پایان نامه‎ خمینه های همتافته ای بررسی می شوند که قابلیت کوانتومی شدن را دارند. یک حالت از کوانتوم سازی برزین-تاپلیتز روی‎ این خمینه ی همتافته را در نظر گرفته و تلاش می شود معادل های کوانتومی براکت پواسون و ناورداهای وابسته به آن در این کوانتوم سازی مشخص شوند. در حقیقت نشان داده می شود که می توان آنها را به عنوان اختلال کوانتومی مشاهده پذیرها و اندازه گیری توأم بین آنها در مکانیک کوانتومی عملگری تعبیر کرد. همچنین به کمک نظریه ی فلوئر‎‏‎ ‎و ‎‏خواص براکت پواسون روابطی بین شاخص اختلال و برخی مفاهیم هندسی وابسته به براکت پواسون به دست می آید.

آداب طبابت از دیدگاه فقه
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه جامعه المصطفی العالمیه - دانشکده الهیات و معارف اسلامی 1384
  محمد حسن وحیدی   علی رحمانی زروندی

پژوهش حاضر با روش تحلیل محتوا به بررسی این آموزه ها در لابلای آیات و روایات اسلامی پرداخته است. در اسلام، علم طب در کنار علم دین قرار گرفته، و پرورش روح و جسم در کنار هم مورد توجه است. از نظر فقهی، طبابت یک واجب کفایی توصلی است؛ بنابراین، طبابت برای یک پزشک، فریضه ای الهی است نه یک قرارداد اجتماعی که نسبت به ترک یا انجام آن مختار باشد. هر بیماری هم بر اساس آموزه های اسلامی، باید برای مداوا به طبیب مراجعه کند، و اگر کوتاهی کرد مورد بازخواست الهی قرار می گیرد. یکی از آداب طبابت آن است که طبیب باید رازدار بیمار باشد و اسرار او را حفظ نماید. از دیگر آداب طبابت، دعا برای شفای بیماری است، که منافاتی با به کارگیری راه های طبیعی درمان ندارد. عدم سوء استفاده مالی، عفت و پاک دامنی، نیت صحیح، حلم و بردباری، توجه به اعتقادات مذهبی بیمار، رسیدگی مطلوب به بیمار، و توکل به خدا از آداب دیگری است که در طبابت باید مورد توجه باشد. همچنین در روایات اسلامی، طبابت بدون دانش و تجربه به شدت نکوهش شده، و بر احساس مسئولیت، دقت طبیب، و پرهیز از تجویز داروهای حرام تأکید بسیاری شده است. برخی امور نیز به عنوان آداب پیشگیری، در حیطه فعالیت های طبی قرار می گیرد؛ رعایت بهداشت اجتماعی و فردی، اولین قدم در جهت پیشگیری از ابتلای به امراض است. دقت در انتخاب همسر، پرهیز از روابط نامشروع جنسی، استفاده از تربت امام حسین (ع)، و توجه دقیق به دستورات اسلامی، مهم ترین امور در پیشگیری از ابتلای به امراض و بیماری هاست. همچنین از نظر فقهی، هرگونه ضرر و تلف، موجبات ضمان طبیب را فراهم می آورد، و در هنگام ضرورت لمس و نظر نیز باید حدود مسایل اسلامی مراعات گردد. در ابتدا بررسی اجمالی در مورد طبابت سپس تشابه بین سوگند نامه های پزشکی و دستورات اسلامی طبی را بیان می نماید. فصل سوم نوع وجوب طبابت روشن می گردد. پیشگیری از مهمترین بخشهای این مجموعه است که بهداشت، تزویج و تحریم، رفتارهای اجتماعی و اطعمه و اشربه را در بردارد. در انتهای کلام ضمانت طبیب،اجرت و حد و حدود لمس و نظر در طبابت بررسی می شود.

بررسی همزمان بیان mir-205 و یکی از اهداف پیش بینی شده ی آن، nok/styk1، در نمونه های گرفته شده از بیماران مبتلا به آدنوکارسینومای کولورکتال
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تبریز - دانشکده علوم پایه دامغان 1392
  آیلا ولی نژاد اورنگ   محمدعلی حسینپور فیضی

مقدمه سرطان کولورکتال (crc) از جمله شایع ترین نئوپلاسم ها در سراسر جهان است و زمانی که در مراحل اولیه تشخیص داده شود، این سرطان درمان پذیر است. mirna ها یک کلاس از rnaهای کوچک غیر کدکننده هستند که نقش عمده ای در تنظیم و در اغلب موارد کاهش بیان ژ ن دارند. در سالهای اخیر تجزیه و تحلیل الگوهای بیان mirnaها منجر به ظهور دیدگاه های کاملا جدیدی در بیولوژی سرطان شده است. به علاوه این الگوها یک ابزار نوید دهنده برای پیشرفت مارکرهای جدید تشخیصی و پیش آگاهی است. mir-205 در بافت های اپیتلیال به صورت اختصاصی بیان می شود و انتظار می رود الگو بیان آن در سرطان های مربوط به دستگاه گوارش از جمله سرطان کولورکتال ویژه ی همان سرطان باشد. سرین/ترئونین/تیروزین کیناز1( nok/styk1 ) انکوژن جدیدی است که با میل ترکیبی بالا به لیگاندهای خود (فاکتورهای رشد، سایتوکاین ها و هورمونها) متصل شده و با به راه انداختن آبشارهای سیگنالینگ درون سلولی فرایندهای متنوع سلولی و نیز مراحل تکوین (نمو) جنین انسان (از جمله تزاید سلولی، تمایز و بقای سلولها) را پیش می برد. ابزار های بیوانفورماتیکی متنوعی nok/styk1 را به عنوان یکی از اهداف mir-205 پیش بینی کرده اند. اهداف انتظار می رود با تایید کاهش بیان mir-205 و افزایش styk1 در نمونه های توموری نسبت به سالم از طرفی نقش تومور مارکری mir-205 وstyk1 تائید شده و با تائید همبستگی معکوس بیان این دو ژن، styk1 به عنوان یکی از اهداف احتمالی mir-205 معرفی گردد و از طرف دیگر نقش mir-205 به عنوان مهارکننده تومور و styk1 به عنوان یک انکوژن تائید گردد. مواد و روش ها 38 نمونه ی توموری و 38 نمونه ی سالم حاشیه توموری از همان بیمار جمع آوری گردیده و پس از مطالعه ی مشخصات ، نتایج پاتولوژی بیماران و جداسازی نمونه های مثبت از نظر آدنوکارسینومایی، آزمایش real time pcr برای بررسی میزان بیان mir-205و styk1 در نمونه های توموری و سالم انجام شد و در نهایت ار نرم افزار sigma plot و graphpad prism برای آنالیز داده ها استفاده شد. نتایج بر خلاف انتظار بیان mir-205 اختلاف معنی داری بین نمونه های توموری و سالم نشان نداد. بنابراین نقش احتمالی تومور مارکری آن برای تشخیص سرطان کولورکتال رد شد. اما از طرفی بیان styk1 در نمونه های توموری به طرز چشمگیری بالاتر از میزان بیان در نمونه های سالم بود. از طرفی بیان این ژن در نمونه های توموری با گرید بالا در مقایسه با نمونه ها با گرید پایین اختلاف معنی داری دارد. بحث styk1 به عنوان یک انکوژن در فرایند تومورزایی کولورکتال شناخته شد و نشان داده شد که پتانسیل تومور مارکری بالایی برای تشخیص سرطان کولورکتال دارد. به علاوه از میزان بیان این ژن با درجه اطمینان بالایی می توان برای طبقه بندی گرید های بالا و پایین این سرطان استفاده کرد. اما بر خلاف انتظار میزان بیان mir-205 پتانسیل قابل قبولی برای عملکرد به عنوان تومور مارکری نداشته و متعاقبا احتمال styk1 به عنوان یکی از اهداف پیش بینی شده ی mir-205 رد می شود.

بررسی اثر پلی اتیلن ایمین بر سطح ترانسکریپت ژن هایbim,bax,casp3, bad casp9 در رده سلول آدنوکارسینومای کولون(ht29)
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید چمران اهواز - دانشکده علوم پایه 1392
  الهام پیشاور   محمد رمضانی

پلی اتیلن ایمین (pei) یک پلیمر پلی آمینی است که در مطالعات سلولی و بافتی به عنوان حامل غیر ویروسی کاربردهای موفقیت آمیزی داشته است. متاسفانه این ترکیب معایبی نیز دارد، از جمله اینکه منجر به سمیت سلولی می شود. اما مکانیسم های ایجاد سمیت آن هنوز به درستی شناخته نشده است. استفاده از تکنیک ترانسکریپتوم در شناسایی ژن های درگیر در فرایند آپوپتوزکمک شایانی به مشخص شدن مکانیسم سمیت این ترکیب می کند. هدف ما از این تحقیق بررسی اثر pei بر سطح ترانسکریپت (mrna) ژن های پروآپوپتوز کاسپاز3،کاسپاز9،bax(bcl-2 associated protein x) (bcl-2 associeted cell death )bad,و bim یا (bcl2-interacting mediator of cell death)bcl2l11وسایر ژن ها آپوپتوز در سلول های آدنوکارسینومای کولون بود . تا مکانیسم سمیت آن مشخص شود. در این مطالعه ابتدا سلولهای رده سلولی آدنوکارسینومای کولون در دو گروه کنترل و ترانسفکت شده با pei کشت داده شده وبه وسیله سونیکاتور هموژن گردیدند. جداسازی اسیدنوکلئوئیک و تعیین غلظت و افزودن آنزیم دئوکسی نوکلئاز1،اندازه گیری غلظت rna با نانودراپ ،تبدیل cdna و آنالیز سطح ترانسکریپت bax,bcl2,bim,bad,casp3,casp9,casp8,tnf,bclxl,apaf1,cytoc به روش qpcr(real-time quantitative polymerase chain reaction) اندازه گیری و بررسی شد. این تحقیق، می توان به این نتیجه رسید که پلی اتیلن ایمین منجر به پیشروی روند خارج سلولی آپوپتوز در سلول می شود. بنابراین می توان فرآیند آپوپتوز را مکانیسم پیشنهادی برای ایجاد سمیت pei در سلول درنظر گرفت.

طرح بهینه مقاوم سازی سازه های اسکلتی با جانمایی بهینه دیوارهای برشی (مطالعه موردی نوسازی مدارس استان کهگیلویه و بویراحمد)
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه سیستان و بلوچستان - دانشکده مهندسی 1392
  محمد شفیعی   محمد رضا قاسمی

اکثر ساختمان‎های مهم و کاربردی در کشور(اداری، آموزشی، صنعتی و....) از نوع سازه‎های اسکلتی می‎باشند. تجربیات گذشته نشان داده است که بسیاری از سازه‎های اسکلتی کشورمان در مقابل زلزله آسیب پذیر می‎باشند. مقاوم سازی سازه‎های اسکلتی موجود در برابر نیروهای ناشی از زلزله یکی از راه حل‎های مقابله با زلزله و خسارات ناشی از آن است. مقاوم سازی در علم مهندسی عمران به معنای بالا بردن مقاومت یک سازه در برابر نیروهای وارده بر آن می‎باشد. مقاوم سازی به روش‎های گوناگون و با در نظر گرفتن پارامترهای مختلفی انجام می‎گیرد که هر روش مزایا و محدودیت هایی دارد. انتخاب مناسب ترین سیستم مقاوم سازه ای برای هر ساختمان ویژه همان ساختمان است. به عبارت دیگر برای هر ساختمان با در نظر گرفتن عوامل مختلفی از جمله زلزله خیزی منطقه، هزینه‎های تقویت، کاربری ساختمان، معماری و زیبایی بنا و. .. .، یک راه حل ویژه باید در نظر گرفته شود. یکی از روش‎های مقاوم سازی سازه‎های اسکلتی اضافه نمودن دیوار برشی می‎باشد. دیوار برشی مقاومت، سختی و شکل پذیری سازه را به شدت افزایش می‎دهد و باعث بهبود رفتار لرزه ای سازه و کاهش تغییر شکل‎ها و خسارات وارد بر دیگر المان‎های سازه می‎گردد. با توجه به علم رو به گسترش بهینه سازی در زمینه عمران نیاز به گسترش این بحث در موضوع مقاوم سازی نیز احساس می‎شود. در این تحقیق سازه یک مدرسه مورد مطالعه قرار گرفته است و پس ارزیابی های انجام شده و شناسایی نقاط ضعف سه راهکار (استفاده از هسته برشی، دیوار برشی و مهاربند فولادی) برای مقاوم سازی آن ارائه شد.پس از مقایسه سه گزینه از لحاظ معماری ، فنی ،اجرایی و اقتصادی گزینه برترانتخاب شد .در نهایت جانمایی بهینه سیستم مقاوم لرزه ای ( دیوار برشی ) تحت بهینه سازی با استفاده از الگوریتم فازی قرار گرفت. بهینه سازی بر روی موقعیت قرار گیری دیوارهای برشی در پلان سازه با استفاده از الگوریتم فازی نشان داد که موقعیت سیستم مقاوم جانبی می تواند تاثیر بسزایی در پاسخ سازه از جمله پریود سازه و تنش حداکثر دیوار برشی داشته باشد که از نقطه نظر اقتصادی نیز بهینه شدن این مورد حائز اهمیت است.

بهینه کردن بیان و خالص سازی فاکتور ممانعت کننده از لوکمیایی نوترکیب انسانی تولید شده در باکتری اشرشیا کلای و بررسی عملکردی بودن آن از طریق تیمار سل لاین وابسته
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید چمران اهواز - دانشکده علوم پایه 1392
  هومن کهربا   حمید گله داری

فاکتور باز دارنده لوکمیا یی انسانی (hlif)، گلیکوپروتئینی است که از زیر خانواده ی اینترلوکین-6 (il-6) ا ست که در بسیاری از پستانداران شناسایی شده است. سایتوکاین lif دارای اثرات چندگانه تنظیمی بر روی انواع مختلف بافت ها و سلول ها ا ست. lif بقای نرون ها را تنطیم می کند و در خون سازی نقش دارد در موش هایی که lif ناک اوت شده است لانه گزینی جنینی نیز مشکل دارند کنترل پرتو ا نی سلول های بنیادی، متابولیسم استخوان و چر بی و غیره بوده و برای لانه-گزینی جنین حائز اهمیت است و در پیشبرد تولید مگاکاریوسیت ها در محیط آزمایشگا ه دخالت دارد. rhlif دارای پتان و همین طور lif به عنوان سیتوکائین پیش التهابی وتنظیم کننده ی پاسخ های ایمنی عمل می کند. علاوه بر این نقش ها lif قادر به حفظ حالت پرتوانی سلول های بنیادی جنینی است.مهمترین اهداف تحقیق حاضر بیان، بهینه کردن ، خالص سازی و بررسی فعالیت زیستی این فاکتور است. pet28 (+)وکتور حامل ژن lif و ژن مقاومت به کانامایسین به عنوان مارکر فنوتیپی می باشد که به باکتری اشرشیا کولی، سویه ی bl21 ترانسفورم شد. پس از القا با iptg با به کارگیری سه فاکتور که شامل دما، زمان القا و غلظت القاگر می شد سعی در بهینه کردن بیان پروتئین نوترکیب شد. سپس خالص سازی rhlif توسط یک مرحله کروماتوگرافی تمایلی انجام شد صحت این خالص سازی توسط sds-psge و وسترن بلاتینگ تایید گردید و همین طور فعالیت زیستی این فاکتور توسط mtt assay بررسی گردید.القا بیان rhlif توسطiptg انجام شد و بیان آن با روش sds-page تایید شد و سپس وسترن بلات? تاییدی مضاعف بر صحت rhlif بود.خالص سازی این فاکتور با کمک کروماتوگرافی تمایلی با موفقیت انجام گردید و صحت خالص سازی با sds-page و وسترن بلات تایید شد. نتایج تیمار rhlif خالص سازی شده بر روی رده ی سلولی وابسته به این فاکتور توسط mtt assay بررسی شد که موید کارکردی بودن rhlif بود.

جداسازی و شناسایی باکتری های تولیدکننده فیتاز از منابع محیطی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید چمران اهواز - دانشکده علوم 1392
  مریم ابراهیمیان   حسین معتمدی

فیتیک اسید (میواینوزیتول 1، 2، 3، 4، 5 و 6-هگزاکیس دی هیدروژن فسفات) بیشترین فرم ذخیره ای فسفر در دانه ها و گرده ها می باشد. دو سوم فسفر موجود در دانه غلات، حبوبات و دانه های روغنی به فرم فیتات است، اما تک معده ای ها مثل خوک، ماکیان و انسان به علت فقدان آنزیم های هیدرولیزکننده فیتات، دسترسی کمی به این ماده دارند. فیتاز (میواینوزیتول هگزاکیس فسفات فسفوهیدرولاز) فیتیک اسید را هیدرولیز می کند و به میواینوزیتول و اسید فسفریک تبدیل می کند. هدف از تحقیق حاضر، جداسازی باکتری های مولد فیتاز از منابع محیطی است. برای این منظور نمونه هایی از مزارع ذرت، گندم، جو، خیار، برنج، لوبیا، آفتابگردان، شبدر، مدفوع گاو و گوسفند، مدفوع کبوتر، مرغداری، دستگاه گوارش ماهی کپور و بستر پرورش کپور ماهیان جمع آوری شد. در این پژوهش فیتیک اسید از سبوس گندم تهیه شد. بعد از انجام مرحله غنی سازی و کشت در محیط اختصاصی دارای فیتیک اسید، 70 باکتری دارای هاله جداسازی شد که بعد از کشت آن ها در محیط اختصاصی مایع و انجام سنجش آنزیمی، 23 جدایه توانایی تولید فیتاز را داشتند. از این 23 جدایه، 3 جدایه برتر انتخاب شدند. منحنی رشد سه جدایه در مقادیر مختلف دما و ph رسم شد. همچنین اثر فاکتورهای ph، دما، غلظت فیتیک اسید و سوبستراهای مختلف کشاورزی بر تولید آنزیم توسط سه جدایه بررسی شد. پایداری آنزیم های تولید شده در دما، ph و پروتئازهای مختلف و واحد آنزیمی آن ها نیز محاسبه شد. این جدایه ها با استفاده از تست های بیوشیمیایی و تعیین سکانس ژن 16s rrna تعیین هویت شدند. در نتیجه این تحقیق، سه جدایه که بیشترین میزان تولید را داشتند متعلق به گونه های raoultella terrigena، klebsiella oxytocaو citrobacter farmeri تشخیص داده شدند. شرایط بهینه برای تولید فیتاز توسط جدایه raoultella terrigena عبارت بودند از: دمای 30 درجه سانتی گراد، 7ph و غلظت 0/15 درصد فیتیک اسید و زمان انکوباسیون 48 ساعت و این شرایط برای جدایه klebsiella oxytoca عبارت بودند از: دمای 37 درجه سانتی گراد، 7ph و غلظت 0/25 درصد فیتیک اسید و زمان انکوباسیون 48 ساعت و این شرایط برای جدایه citrobacter farmeri عبارت بودند از: دمای 30 درجه سانتی گراد، 7ph و غلظت 0/25 درصد فیتیک اسید در زمان انکوباسیون 48 ساعت. آنزیم فیتاز raoultella terrigena در دمای 55 درجه سانتی گراد و 5/5ph بهترین فعالیت را داشت و واحد آنزیمی فیتاز و محتوای پروتئینی باکتری آن به ترتیب u/ml25 و mg/ml1 0/17 بود. آنزیم فیتاز klebsiella oxytoca در دمای 55 درجه سانتی گراد و 5/8ph بهترین فعالیت را داشت و واحد آنزیمی فیتاز و محتوای پروتئینی باکتری آن به ترتیب u/ml27/5 و mg/ml0/095 بود.آنزیم فیتاز citrobacter farmeri در دمای 65 درجه سانتی گراد و 5/8ph بهترین فعالیت را داشت و واحد آنزیمی فیتاز و محتوای پروتئینی باکتری آن به ترتیب u/ml31 و mg/ml 0/103 بود. براساس نتایج بدست آمده می توان ادعا کرد که باکتری های جداسازی شده قابلیت بالایی جهت تولید فیتاز دارند و می توان از آن ها جهت اهداف تولید صنعتی یا افزودن به خوراک طیور و آبزیان استفاده کرد.

هندسه ی هوفر یک زیر مجموعه از یک خمینه همتافته
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ولی عصر (عج) - رفسنجان - دانشکده ریاضی 1392
  راضیه معین الدینی   محمد شفیعی

در این پزوهش یک زیر مجموعه ی n از یک خمینه ی همتافته m گروه وابرریختی های همیلتونی ham وابسته شده و روی این گروه نیم نرمی موسوم به نیم نرم هوفر تعریف شده و خواص این گروه وقتی n یک زیر خمینه ی همتافته باشد مورد بررسی قرار گرفته.

ساخت بسته بندی های همتافته و بررسی نشاننده های همتافته از چند دیسک ها
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ولی عصر (عج) - رفسنجان - دانشکده ریاضی و کامپیوتر 1389
  محمد نامه گشای فرد   محمد شفیعی

در این تحقیق به بررسی دو مفهوم متفاوت در حوزه نشاننده های همتافته می پردازیم. ابتدا بسته بندی های صریحی را برای b4(1) و حاصلضرب رویه ها توسط گوی ها و بیضی گون ها ارائه می دهیم که در آن یک k-بسته بندی همتافته از خمینه همتافته m توسط خمینه همتافته n، مجموعه k عضوی از نشاننده های همتافته از n بتوی m با تصاویر مجزا می باشد. سپس در بحث معرفی نشاننده های همتافته روی چند دیسک های باز، شرطی را ارائه می دهیم که طی آن بین دو چند دیسک، نشاننده ای همتافته وجود دارد.

کرانهایی برای مقادیر ویژه اکسترمال رده ای خاص از ماتریسهای سه قطری متقارن
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه صنعتی اصفهان - پژوهشکده ریاضیات 1393
  محمد شفیعی   رضا مختاری

اساس کار در این پایاننامه به دست آوردن یک کران مطلوب برای مقادیر ویژهی اکسترمال رده ای خاص از ماتریسهای سهقطری متقارن تاپلیتز است. در فصل ? یک کران مطلوب برای کوچکترین و بزرگترین مقدار ویژه ماتریسهای سه قطری متقارن تاپلیتز که دو عنصر خارج از قطر اصلی آن دچار آشفتگی می شوند را با استفاده از یک رابطه ی بازگشتی که در متن پایان نامه آورده شده، به دست می آوریم. در ادامه یک مثال کاربردی مهم در حل معادلات با مشتقات پاره ای که این ماتریسها در آنجا ظاهر می شود را مورد بررسی قرار می دهیم و یک کران مطلوب برای کوچکترین مقدار ویژه بدست آورده و با استفاده از لم ??.? که در متن پایان نامه آورده شده است یک کران مطلوب برای کوچکترین مقدار تکین ماتریسهای تاپلیتز و معین مثبت (نه لزوماً متقارن) به دست می آوریم، که حداکثر چهار عنصر خارج از قطر اصلی آن دچار آشفتگی می شوند. در فصل ? یک کران مطلوب برای کوچکترین و بزرگترین مقدار ویژه ماتریسهای سه قطری متقارن تاپلیتز که چهار عنصر خارج از قطر اصلی آن دچار آشفتگی می شوند را با استفاده از یک رابطه ی بازگشتی که در متن پایان نامه آورده شده، به دست می آوریم. در ادامه دو مثال بسیار مهم و کاربردی را مورد بررسی قرار می دهیم. در مثال اول یک دستگاه معادله خطی را که ماتریس ضرایب آن یک ماتریس تاپلیتز و معین مثبت (نه لزوماً متقارن) است که حداکثر هشت عنصر خارج از قطر اصلی آن دچار آشفتگی می شوند. با استفاده از لم ??.? ، یک کران مطلوب برای کوچکترین مقدار تکین آن به دست می آوریم و در مثال ? یک کران مطلوب برای کوچکترین مقدار تکین رده ای خاص از ماتریسهای دوقطری به دست می آوریم که در بسیاری از کاربردها بسیار سودمند است.

مطالعه فراوانی الل hla-drb1*1501 در بیماران مبتلا بهms در استان خوزستان
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید چمران اهواز - دانشکده علوم پایه 1393
  نوشین دلفان   حمید گله داری

مقدمه: بیماری مالتیپل اسکلروزیس یک بیماری خود ایمن، دمیلینه کننده و تخریب کننده سیستم اعصاب مرکزی است. آسیبشناسی این بیماری تا کنون مشخص نشده است، اگرچه شواهدی حاکی از تاثیر عوامل محیطی بر افراد دارای استعداد ژنتیکی وجود دارد. در بسیاری از مطالعات مبتنی بر جمعیت نقش هاپلوتایپ های hla drb1*15 (hla drb1*1501, dqa1*0102, dqb1*0602) در خطر ابتلا به ms تکرار و تایید شده است. با این حال، مطالعات تعدادی از جمعیتها نتایج مختلفی را نشان داده است. هدف از این مطالعه بررسی فراوانی الل hla drb1*1501 در جمعیت خوزستان بود. مواد و روش ها: تعداد 2?? نفر از بیماران مبتلا به مالتیپلاسکلروزیس در این مطالعه فراوانی مورد بررسی قرار گرفتند. نسبت مرد به زن تقریباً 4:1 بود. 7/87% بیماران به عنوان rrms و بقیهی بیماران به عنوان ppms ,prmsو spms دستهبندی شدند. hla typing به روش واکنش زنجیره ای پلیمراز sequence-specific primers (pcr-ssp) صورت گرفت. بیماران دارای الل hla drb1*1501 دو باند bp 197 و bp 356 را نشان می دهند ولی بیمارانی که فاقد این الل هستند فقط باند bp 356 را نشان می دهند.(باند کنترل داخلی) نتایج: 5/41% درصد از بیماران مبتلا به ms استان خوزستان برای این زیرگروه اللی مثبت بودند. نتیجهگیری: فراوانی بدست آمده با دیگر مطالعات مشابه صورت گرفته در ایران و نیز تعدادی ازمطالعات صورت گرفته در دیگر قسمتهای جهان مطابقت دارد.

بررسی بیان ژن های mir-205،mir-216a وmir-217 در آدنوکارسینومای معده
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تبریز - دانشکده علوم طبیعی 1392
  معصومه نعمتی   محمدعلی حسینورفیضی

سرطان معده چهارمین سرطان شایع و دومین علت مرگ و میرهای ناشی از سرطان در جهان است. شناسایی بیومارکرهای مولکولی برای تشخیص اولیه و پیشرفت سرطان معده ضروری می باشد. در سال های اخیر mirnaها به عنوان یکی از قویترین فاکتورهای پیش آگهی و تشخیصی برای انواع سرطان ها مورد توجه زیادی قرار گرفته اند. mirnaها، یک کلاس از rnaهای کوچک غیر کدکننده هستند که بیان ژن های کد کننده پروتئین را در سطح بعد از رونویسی تنظیم می کنند و در فرآیندهای زیستی مختلفی شرکت می کنند. تحقیقات اخیر نشان داده است که پروفایل بیان mirnaها در بافت سرطانی نسبت به بافت سالم متفاوت می باشد و تغییر بیان آن ها در سرطان معده نیز گزارش شده است. بنابراین این مولکول ها می توانند به عنوان بیومارکر در غربالگری، تشخیص و درمان سرطان معده مورد استفاده قرار گیرند. در مطالعه حاضر به بررسی سطح بیان mir-205، mir-216a و mir-217 در آدنوکارسینومای معده و مقایسه آن با بافت نرمال حاشیه تومور پرداخته شد. روش ها: در مجموع 30 نمونه توموری و 30 نمونه حاشیه توموری جمع آوری گردید. پس از استخراج rna کل و سنتز cdna اختصاصی، بررسی میزان بیان mirnaها با استفاده از تکنیک real time pcr انجام گرفت. در نهایت از نرم افزارهای graphpad، sigmaplot و spss برای آنالیز داده ها استفاده شد. یافته ها: نتایج حاکی از افزایش معنی دار سطح بیان mir-205 و mir-216a در بافت های توموری در مقایسه با بافت نرمال حاشیه تومور بود. اما بین میزان بیان mir-217 در بافت های توموری و حاشیه توموری تفاوت معنی داری مشاهده نشد. آنالیزهای آماری با spss نشان داد ارتباط معنی داری بین تغییر سطح بیان این mirnaها با ویژگی های کلینیکی-پاتولوژیکی بیماران وجود ندارد. نتیجه گیری: باتوجه به افزایش بیان معنی دار mir-205 و mir-216a در بافت های توموری نسبت به بافت حاشیه توموری، می-توان نتیجه گرفت این mirnaها می توانند به عنوان بیومارکرهای مناسب و جدید برای تشخیص آدنوکارسینومای معده مطرح شوند. همچنین با توجه به عملکردهای مختلف این mirnaها در مسیرهای مرتبط با سرطان، احتمال می رود با انجام پژوهش های بیشتر بتوان از آن ها به عنوان یک عامل درمانی نیز استفاده نمود.

مقایسه تغییرات پروفایل جامع بیانی micrornaها در نمونه های توموری و غیرتوموری scc مری بیماران استان گلستان
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - پژوهشگاه ملی مهندسی ژنتیک وزیست فناوری 1393
  محمد شفیعی   جواد مولی

سرطان مری ششمین عامل مرگ و میرهای ناشی از سرطان در دنیا می باشد. استان گلستان در شمال شرقی ایران یکی از قطب¬های جهانی با شیوع بالای سرطان مری از نوع کارسینومای سلول سنگفرشی (escc) محسوب می¬شود. مکانیسم¬های مولکولی دخیل در این بیماری هنوز بطور دقیق شناخته نشده است. اخیرا نقش mirnaها در پاتوژنز سرطانها نشان داده شده است. در این تحقیق، پروفایل بیانی بیش از هفتصد mirna در نمونه¬های بافتی پارافینه کارسینومای سلول سنگفرشی و نرمال حاشیه آن در 10 بیمار استان گلستان بررسی شد. استخراج rna و سنتز cdna از ناحیه توموری و سالم انجام گردید و پروفایل بیانیmirnaها به روش pcr array با استفاده ازmercury lnatm universal rt microrna pcr (exiqon) و با کمک دستگاهroche lightcycler® 480 انجام شد. نتایج معنی¬داری در افزایش بیان عمده در mir-519d، mir-512-5p، mir-372، mir-519a، mir-520c، mir-371، mir-524-3p، mir-517c، mir-373، mir-518a-3p، mir-518f، mir-518b، 516a-5p، mir-517a، mir-518c و mir-371-3p و کاهش بیان عمده در mir-338-3p ، mir-20b*، mir-211 و mir-658، mir-375، mir-203، mir-216b، mir-133a، mir-145، mir-133b، mir-139 و mir-143 نشان داده شد. آنالیزهای بیوانفورماتیک برای تعیین mrna هدف mirnaها بر اساس عملکرد مولکولی، فرایندهای زیستی و مسیرهای واکنشی با نرم¬افزار بیوانفورماتیکی cytoscape بیانگر تاثیرات احتمالی آنها در مسیرهای رشد و پیشرفت سرطان مانند مسیرهای مستقیم و غیر¬مستقیم p53، مسیرهای انکوژنی مهم مانند c-myc و مسیرهای تنظیمی آپاپتوز و یا تکثیر سلولی بود. همچنین مطالعات عملکردی mir-211، mir-338-3p و mir-375 نیز نشان داد بیش¬بیان آنها موجب کاهش بیان sox2ot، تغییر در سیکل سلولی و تجمع سلول¬ها در فاز sub-g1 در سلولهای nt-2 می¬شود. نتایج پروفایل بیانیmirnaها در این مطالعه با سایر مطالعات در مواردی همخوانی داشته و در مواردی نیز تفاوت¬هایی مشاهده می¬شود. عمده این تفاوت¬ها در افزایش بیان let-7d، mir-340 و mir-10 در بیماران چینی و نیزmir-16 ، mir-34c، mir-132، mir-137وmir-138 در بیماران ژاپنی می¬باشد. اطلاعات بدست آمده از نتایج این تحقیق برای اولین بار پروفایل بیانی mirnaها را در بیماران escc ایرانی نشان می¬دهد و می¬تواند در مطالعات آتی بیومارکرها و نیز در راستای کنترل escc مورد استفاده قرار گیرد.

بررسی فراوانی hla-dqb1*0602 در بیماران مبتلا به ms در استان خوزستان
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید چمران اهواز - دانشکده علوم 1393
  رضوان ذبیحی   حمید گله داری

مقدمه: بیماری مالتیپل اسکلروزیس یک بیماری التهابی دمیلینه کنندهی سیستم عصبی مرکزی می باشد. مطالعات نشان داده است که فاکتورهای محیطی و ژنتیکی هر دو در آسیب شناسی بیماری نقش دارند. الل های hla class ii (drb1*1501, dqa1*0102, dqb1*0602) احتمالا اثر ژنتیکی مهمی را در بیماری ms دارند. هر چند، ‏این مسئله در جمعیت های مختلف مورد بحث می باشد. با توجه به اینکه تاکنون مطالعه¬ای در ارتباط با بررسی فراوانی hla-dqb1*0602 در استان خوزستان صورت نگرفته است، این پژوهش به مطالعه¬ی فراوانی الل hla-dqb1*0602 به عنوان یکی از مهمترین الل های شناخته شده در بیماری ms پرداخت. روش کار : این مطالعه به بررسی فراوانی hla-dqb1*0602 در 200 بیمار خوزستانی مبتلا به ms و 200 فرد کنترل سالم پرداخت. نسبت زن به مرد 4:1 بود hla typing . با روش pcr-ssp انجام شد. بحث و نتیجه گیری : نتایج نشان داد که? 5/61 از بیماران این الل را داشتند. با توجه به فراوانی بالای این الل در بیماران، 200 نمونه¬ی کنترل را که از لحاظ سنی و جنسی با گروه بیمار مطابقت داشتند، نیز برای بررسی همراهی احتمالی الل با بیماری بررسی شدند اما 5/58? از افراد کنترل نیز برای این الل مثبت بودند و نتایج آماری همراهی معنی¬داری را بین الل مذکور و بیماری ms نشان نداد. این نتیجه با نتیجه¬ی اکثر مطالعات در جمعیت های آسیایی از جمله ایران مطابقت داشته اما در تناقض با نتایج بدست آمده در اکثر جمعیت¬های اروپایی می¬باشد.

اندازه عملگر مقدار، اتساع ها و نظریه قاب ها
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ولی عصر (عج) - رفسنجان - دانشکده علوم ریاضی و مهندسی کامپیوتر 1393
  ابوطالب بهادریان   محمد شفیعی

‏در این پایانامه ارتباط بین نظریه قاب ها و نظریه اندازه های عملگر ‏-مقدار بررسی می شود. همچنین مفهوم اتساع‏، برای اندازه های عملگر-مقداری که روی فضاهای باناخ عمل می کنند و لزوماً کراندار نیستند‏، گسترش داده می شود. سپس نشان داده می شود که می توان به هر قاب و جفت قاب دوگان یک اندازه عملگر-مقدار مناسب متناظر کرد. پس از این تناظر‏، اتساع برای قاب ها (به کمک اتساع برای اندازه های عملگر-مقدار) تعریف شده و خواص آن مورد بررسی واقع می شود.

بررسی همراهی hla-drb5*01 با بیماری مولتیپل اسکلروزیس (ms) در استان خوزستان
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید چمران اهواز - دانشکده علوم 1393
  طاهره لطیفی پاکدهی   حمید گله داری

مقدمه: بیماری مولتیپل اسکلروزیس یک بیماری خود ایمن، دمیلینه کننده و تخریب کننده سیستم اعصاب مرکزی است. آسیبشناسی این بیماری تا کنون مشخص نشده است، اگرچه شواهدی حاکی از تاثیر عوامل محیطی بر افراد دارای استعداد ژنتیکی وجود دارد. در بسیاری از مطالعات نقش الل های hla class ii شامل drb1*1501,drb5*0101, dqa1*0102, dqb1*0602 در خطر ابتلا به ms بررسی شده است. با توجه به اینکه تاکنون مطالعه¬ای در ارتباط با بررسی همراهی hla-drb5*01 با بیماری ms در استان خوزستان صورت نگرفته است، این پژوهش به بررسی همراهی گروه آللی مذکور با بیماری ms پرداخت. روش کار : این مطالعه به بررسی همراهی hla-drb5*01در 202 بیمار خوزستانی مبتلا به ms و 187 فرد کنترل سالم پرداخت. نسبت زن به مرد 4:1 بود hla typing . با روش pcr-ssp انجام شد. بحث و نتیجه گیری : نتایج نشان داد که72/27% از بیماران این لکوس را داشتند.تعداد 187 نمونه¬ی کنترل که از لحاظ سنی و جنسی با گروه بیمار مطابقت داشتند، نیز برای بررسی همراهی احتمالی الل با بیماری بررسی شدند. 39/21% از افراد کنترل نیز برای این الل مثبت بودند و نتایج آماری همراهی معنی¬داری را بین گروه آللی مذکور و بیماری ms نشان نداد.

باز?اب?ترک?بمحدبط?فک?س?کبهوس?لهیط?فتوأم?کدستگاه کوانتوم?
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ولی عصر (عج) - رفسنجان - دانشکده ریاضی و کامپیوتر 1393
  نرجس فیروزی   محمد شفیعی

در ا?ن پا?اننامه خ?صهای از کوانتا?ز کردن ن?مهک?س?ک را ارائه م?کن?م و از آن برای اثباتا?نکهترک?بمحدبط?فن?مهک?س?کخانوادهایازعملگرهایتعو?ضپذ?راز?ک دستگاه کوانتوم? به ترک?ب محدب ط?ف? از دستگاه ک?س?ک مربوط به آن همگراست استفادهم?کن?م.

نگاشت چند تکانه ایی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ولی عصر (عج) - رفسنجان - دانشکده علوم ریاضی 1393
  صفیه پیشگوی   محمد شفیعی

گسترش مفهوم نگاشت تکانه به دلیل نقش مهم آن در پیوند ریاضیات و فیزیک‏، موضوعی درخور توجه برای پژوهشگران است. در این پژوهش‏، مفهوم نگاشت چند تکانه ای وابسته به عمل گروه های لی‏، که یک 3-فرم بسته را حفظ می کنند؛ معرفی می ‏شود. سپس نشان می دهیم این نگاشت‏، در شرایط‏ بسیاری از جمله فرضیات توپولوژیکی ساده روی خمینه ی هدف‏، وجود دارد. همچنین نشان داده می شود برای تمام گروه های لی که دومین و سومین عدد بتی از جبر لی آن ها صفر است؛ نگاشت چند تکانه ایی موجود و یکتاست. در ادامه‏، چندین مثال از این نوع نگاشت ها برای هندسه های متفاوت را مورد بررسی قرار می دهیم.

مطالعه همزمان تغییرات بیان ژن های dcc و rp11-267c16.1 در آدنوکارسینومای کلورکتال در مقایسه با بافت نرمال کلورکتال
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تبریز - دانشکده علوم طبیعی 1393
  مینا کاظم زاده   محمدعلی حسینپور فیضی

سرطان کلورکتال یکی از شایع ترین سرطان ها در سطح دنیا می باشد، این سرطان مثل تمام سرطان ها یک بیماری ژنتیکی چند فاکتوری می باشد که طی آن چندین ژن دچار تغییر در عملکرد و یا تغییر در سطح بیان می شوند. از جمله ژن هایی که دچار تغییر در سطح بیان می شوند می توان به ژن dcc اشاره کرد. علاوه بر نقش ژن های کد کننده در سرطان، در طی مطالعاتی که در ده? گذشته انجام گرفته است، نقش lncrna ها نیز در مراحل مختلف سرطان به اثبات رسیده است. lncrna ها ریبونوکلئیک اسیدهای غیرکدکننده ای هستند که به عنوان یک عامل تنظیمی سطح بیان ژن ها را در سلول کنترل می کنند. این ساختارهای مولکولی در کنترل فرایندهای متنوع تکوینی، فیزیولوژیکی و پاتولوژیکی سلول شرکت می نمایند. مسلم است که هر نوع تغییری در سطح بیان lncrna ها سبب تغییر در سطح بیان ژن های کد کننده خواهد شد. تغییر در سطح بیان lncrna ها، چه به صورت افزایش بیان و چه به صورت کاهش بیان، در برخی از سرطان ها مشاهده شده است. بنابراین می توان از این rnaهای غیر کد کننده به عنوان نشانگرهای زیستی برای تشخیص، پیش بینی و حتی درمان سرطان استفاده کرد. هدف از این مطالعه بررسی همزمان تغییرات بیان ژن dcc و rna غیر کد کننده به نام rp11-267c16.1 در بیماران مبتلا به سرطان کلورکتال می باشد. آنالیز داده ها کاهش بیان دو ژن dcc و rp11-267c16.1 را در نمونه های توموری نسبت به نمونه های سالم تأیید کرد. اما ارتباط معنی داری بین این تغییرات بیان و گریدهای مختلف سرطان کلورکتال، سن افراد مبتلا و جنسیت افراد مبتلا یافت نشد. همچنین برخلاف انتظار این دو ژن پتانسیل قابل قبولی برای عملکرد به عنوان بیومارکر را ندارند

بررسی جهش های احتمالی در اگزون های ژن های hadhb وhadha در بیمار خوزستانی مبتلا به نقص پروتئین سه عملکردی میتوکندریایی (tfp)
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید چمران اهواز - دانشکده علوم 1394
  مهدیه شاهرخی   حمید گله داری

(mitochondrial trifunctional protein (mtp که در غشای درونی میتوکندی متصل است،سه مرحله نهایی چرخه بتا اکسیداسیون اسید های چرب را کاتالیز میکند.این کمپلکس یک هترو-اکتامر کمپلکس است که از 8 قسمت(زیرواحد) تشکیل شده است. 4زیرواحد ? شامل (lceh(long-chain2,3-enoyl-coahydratase و (lchad (long-chain 3- hydroxyacyl coa dehydrogenase می باشد و 4 زیرواحد ? که در برگیرنده فعالیت (lckt(long chain 3-ketoacyl coa thiolase می باشد، که سه مرحله آخر چرخه بتا اکسیداسیون اسیدهای چرب زنجیره بلند را کاتالیز می کنند. این بیماری یک اختلال نادر اتوزومی مغلوب است، که طیفی از علائم را در بر می گیرد. m-tfp deficiency به دو بیماری تفکیک می شود: isolated lchadd و complete m-tfp deficiency. نوع شایعتر isolated lchadd می باشد و به علت وقوع جهش در ژن hadha که کد کننده زیرواحد ? است رخ می دهد.نوع complete mtpd شیوع کمتری دارد.بروز جهش در ژن hadhb که کد کننده زیرواحد ? می باشد و یا جهش در ژن hadha، سبب این نوع ازاختلال است.

شناسایی جهش(های) احتمالی در اگزون های ژن abca3 در یک بیمار ایرانی مبتلا به سندرم زجرتنفسی.
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید چمران اهواز - دانشکده علوم 1394
  فریده رضایی   حمید گله داری

مقدمه. سندرم زجرتنفسی نوزادان (infant respiratory distress syndrome) ، یک بیماری حاد ریوی است که معمولا نوزادان نارس به آن مبتلا می شوند. در این بیماری، ریه نابالغ و غیر عملکردی است. در واقع نقص در سورفاکتانت باعث ایجاد این بیماری می شود. سورفاکتانت باعث کاهش کشش سطحی آلوئول ها می شود و در نتیجه از کلاپس و بسته شدنشان جلوگیری می کند. پروتئین abca3 ترنسپورتر لیپیدهای سورفاکتانت، نقش بسیار مهمی در تولید سورفاکتانت دارد. وقوع جهش در این ژن می تواند تولید سورفاکتانت و عملکرد صحیح ریه را تحت تاثیر قرار دهد.

جداسازی و همسانه سازی ژن اندو 1و4 بتا زایلاناز a از باکتری nesterenkonia sp.strain f در باکتری e.coli.
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید چمران اهواز - دانشکده علوم 1394
  هاجر محمدی   حمید گله داری

nestrenconia sp.strain.f یک جنس نمک دوست از خانواده micrococcacae است که ژنوم آن غنی از cg است. توسط نرم افزار rast ژنوم باکتری را بررسی کردیم. این بررسی نشان داد که ژنوم باکتری حاوی ژن endo-1,4-beta-xylanase است. پروتئین های اندو 1و4 بتا زایلاناز ( ec 3.2.1.8) آنزیم های هیدرولاز هستند که پیوند های 1-4 گلیکوزیدیک را در مولکول زایلان از ترکیب همی سلولوز می شکند.مطالعات دینامیک مولکولی مشخص کرد که این آنزیم دارای جایگاه اتصال به سوبسترای زایلان و برخی کوفاکتور های احتمالی است. همچنین مشخص شد که علارغم وجود تفاوت در توالی آمینو اسیدی، این پروتئین قادر است زایلان را به عنوان سوبسترا تشخیص دهد و می تواند عملکرد آنزیمی خود را روی آن اعمال کند.

رویکرد برنامه ریزی طراحی محور در بافت تاریخی شهرها نمونه موردی: مرکز تاریخی شهر تهران (محدوده حصار ناصری)
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید بهشتی - دانشکده معماری و شهرسازی 1386
  محمد شفیعی   -

چکیده ندارد.

بررسی بعضی از گنجایش های همتافته روی خمینه های همتافته
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ولی عصر (عج) - رفسنجان - دانشکده ریاضی و کامپیوتر 1388
  بهروز طالبی زاده   محمد شفیعی

چکیده ندارد.

خواصی از جاذب ها و شبه جاذب ها
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ولی عصر (عج) - رفسنجان - دانشکده علوم 1387
  وحیده جعفری   محمدرضا مولایی

چکیده ندارد.

آنتروپی توپولوژیک توابع پیوسته
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه ولی عصر (عج) - رفسنجان - دانشکده علوم 1387
  مهدی کوهپایه   محمدرضا مولایی

چکیده ندارد.

بررسی روانی نبوغ
thesis وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی - دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی تهران 1340
  محمد شفیعی

چکیده ندارد.

عوارض موکوویسیدوزیس
thesis وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی - دانشگاه علوم پزشکی و خدمات بهداشتی درمانی تهران 1350
  محمد شفیعی

چکیده ندارد.

تفاسیر شیعه
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تهران 1332
  محمد شفیعی

چکیده ندارد.