مولفه های واریانس استفاده های فراوانی در برنامه های اصلاح نژادی دارد که از آن جمله می توان به پیش بینی ارزش اصلاحی، محاسبه پیشرفت ژنتیکی، بدست آوردن پیش بینی های blup با استفاده از معادلات مدل مختلط، تخمین وراثت پذیری و همبستگی های فنوتیپی، ژنتیکی و محیطی، درک بهتر مکانیسم ژنتیکی و تشکیل شاخص انتخاب اشاره نمود، فلذا در سالیان اخیر روشهای آماری توسعه چشمگیری در جهت تخمین هر چه دقیق تر مولفه های واریانس داشته اند. هدف اصلی از این تحقیق مقایسه دو روش آماری bayesian و reml در برآورد پارامترهای ژنتیکی برخی صفات مهم اقتصادی در گاوهای هلشتاین ایران بود، جهت نیل به این هدف از تعداد 254833رکورد مربوط به سه شکم اول گاوهای هلشتاین ایران که طی سالیان 1378 تا 1387 توسط مرکز اصلاح نژاد دام کشور تهیه شده است استفاده گردید که در آن تعداد حیوانات شجره 608478 عدد بود. صفات مورد مطالعه شامل تولید شیر، مقدار و درصد چربی و مقدار و درصد پروتئین بود. در مدل تک متغیره و تکرارپذیری مورد استفاده در این تحقیق اثر سال-فصل-گله بعنوان اثر ثابت، اثر سن در موقع زایش بعنوان کوواریت و اثر ژنتیک افزایشی حیوانات و محیط دائمی بعنوان اثر تصادفی مورد استفاده قرار گرفتند. برای برآورد مولفه های واریانس در روش بیزی از نرم افزارهای mtgsam و gibbs3f90 و برای روش حداکثر درست نمایی محدود شده از نرم افزار ai-remlf90 استفاده گردید. نتایج بدست آمده نشان دادند که به طور کلی روش بیزی دارای دقت برآورد بیشتر و نیز مقدار عددی بزرگتری می باشد.