خلر زراعی گیاهی زراعی و علوفه ای متعلق به خانواده fabaceae است.توانایی این گیاه در تحمل شرایط خشکی و سیلابی، هزینه پایین تولید، محتوای پروتئینی بالا و ظرفیت اصلاح قدرت باروری خاک منجر به اهمیت این محصول در بسیاری از کشورها شده است. این گیاه غالبا خودگرده افشان است اما مقداری دگرلقاحی هم در آن رخ می دهد که به شرایط ژنتیکی و جغرافیایی وابسته است. تنوع ژنتیکی گونه های گیاهی منبع بی نظیری را برای بهبود ویژگی های محصولات گیاهی و افزایش تنوع این محصولات ایجاد می کند. نشانگرهای ملکولی اطلاعات باارزشی را خصوصا در زمینه مطالعه تنوع ژنتیکی و نقشه یابی ژنومی ارائه می دهد. در این مطالعه از نشانگر ملکولی issr برای مطالعه تنوع ژنتیکی و رابطه فیلوژنتیکی پنج جمعیت lathyrus sativus استفاده شد. استخراجdna ، pcr و الکتروفورز انجام شد و نوارها روی ژل آگاروز 5/1% مشاهده شدند. در مجموع 54 نوار چندشکل تولید شد. اندازه نوارها بین 200 و 2000 جفت باز متغیر بود. میانگین نوارهای چندشکل 5/13بود. تنوع ژنتیکی درون جمعیت ها توسط شاخص شانون بین سوریه (2818/0) و کرج (1532/0) و توسط ضریب نی هم بین سوریه (1919/0) و کرج (1015/0) تخمین زده شد. بیشترین فاصله ژنتیکی بین جمعیت های آلمان و کرج (4291/0) و کمترین فاصله ژنتیکی بین جمعیت های مجارستان و لهستان (0929/0) بر اساس ضریب نی بدست آمد که با نتایج نمونه های بالک توسط ضریب نی مطابقت نداشت. دندروگرام رسم شده بر پایه ضریب نی دو خوشه اصلی را نشان داد که یک خوشه شامل جمعیت کرج و خوشه بعدی شامل چهار جمعیت دیگر بود. این مطالعه اهمیت نشانگر issr را در تخمین تنوع ژنتیکی جمعیت های lathyrus sativus نشان داد.