محبوبه ضرابی

[ 1 ] - شناسایی ژن‌های سیکلوتید در گونه‌های بنفشه و بررسی آثار ضدمیکروبی سیکلوتیدهای استخراج‌شده

اهداف: سیکلوتیدها خانوادة بزرگی از پپتیدهای گیاهی با فعالیت زیستی و ویژگی‌های ساختاری متمایز است که در خانواده‌های گیاهی روبیاسه‌ها، کوکوربیتاسه‌ها و ویولاسه‌ها بیان می‌شود. سیکلوتیدها به‌دلیل فعالیت‌های زیستی متعدد از جمله ضدویروس، ضدباکتری و ضدسرطان، همچنین ساختار منحصربه‌فردی که پایداری حرارتی و آنزیمی بی‌نظیری به آن‌ بخشیده است، انتخابی مناسبی برای مهندسی پروتئین در کاربردهای دارویی و کشاور...

[ 2 ] - بررسی میانکنش پپتید ضد میکروبی سیکلوویولاسین o2 با غشا باکتری با روش شبیه سازی دینامیک مولکولی

چکیده سیکلوتیدها پپتیدهای کوچک غنی از باندهای دی سولفید هستند که از گیاهان جدا شده اند و دارای طیف وسیعی از فعالیت های زیستی شامل فعالیت ضد میکروبی، ضد تومور، حشره کشی وAnti-HIV می باشند. با توجه به افزایش باکتری های مقاوم به دارو، جامعه ی جهانی در حال رویارویی با یک چالش جدی است و نیازی ضروری به ترکیبات جدید برای درمان بیماری ها احساس می شود. سیکلوتید ها به عنوان پپتیدهای کوچک، پتانسیل بالایی ...

[ 3 ] - استخراج و خالص‌سازی نسبی سیکلوتیدهای عصاره‌ی گیاه بنفشه‌ی معطر بومی ایران (Viola odorata) و بررسی تأثیر مواد مؤثرآن بر باکتری S. aureus PTCC 1431

هدف این مطالعه استخراج و خالص‌سازی نسبی سیکلوتیدهای عصاره‌ی گیاه بنفشه‌ی بومی ایران و بررسی اثرهای ضدمیکروبی آن بر باکتری گرم مثبت S. aureus PTTC 1431 است. در این پژوهش استخراج و خالص‌سازی نسبی سیکلوتیدها با روش جزء‌گیری و استفاده از ستون SPE-C18 صورت گرفت. تعیین خلوص و وزن مولکولی سیکلوتیدهای به‌دست آمده، به‌ترتیب، با روش RP-HPLC و Tricine SDS PAGE انجام شد. سنجش اثرهای ضدمیکروبی محلول به...

[ 4 ] - Biochemical and computational study of an alginate lyase produced by Pseudomonas aeruginosa strain S21

Objective(s): Alginates play a key role in mucoid Pseudomonas aeruginosa colonization, biofilm formation, and driving out of cationic antibiotics. P. aeruginosa alginate lyase (AlgL) is a periplasmic enzyme that is necessary for alginate synthesis and secretion. It also has a role in depolymerization of alginates. Using AlgLs in cystic fibrosis patients along with anti...

[ 5 ] - Design, Modeling and Computational Analysis of crRNA to Regulate MetastamiR-10b and MetastamiR-126 in Post-transcriptional Level by CRISPR-C2c2 (Cas13a) Technique

Introduction: Metastasis is one the most important causes of mortality in cancer patients. Recent studies have shown the metastatic potential of a specific group of microRNAs called metastamirs. miR-126 is shown to be correlated with the colorectal liver metastasis. Also, overexpression of miR-10b has been reported in metastatic breast cancer. Therefore, down regulation of these miRNAs at tra...

[ 6 ] - Design, Modeling and Computational Analysis of crRNA to Regulate MetastamiR-10b and MetastamiR-126 in Post-transcriptional Level by CRISPR-C2c2 (Cas13a) Technique

Introduction: Metastasis is one the most important causes of mortality in cancer patients. Recent studies have shown the metastatic potential of a specific group of microRNAs called metastamirs. miR-126 is shown to be correlated with the colorectal liver metastasis. Also, overexpression of miR-10b has been reported in metastatic breast cancer. Therefore, down regulation of these miRNAs at tra...

[ 7 ] - بررسی خصوصیات آنزیم پراکسیداز و تهیه نانوذره پروتئینی از آن با روش محاسباتی و آزمایشگاهی

ساختارهای نانوپروتئینی میتوانند توسط توانایی ذاتی خودتجمعی مولکولها تشکیل شوند که این توانایی می تواند بهوسیله حدواسطها اصلاح گردد. در میان عوامل خودتجمعی ذاتی پروتئین ها، هیدروفوبیسیته مهمترین عامل است. مولکولهایحدواسطی مانند گلوتارآلدئید می تواند باعث تجمع پروتئینی و تشکیل نانوذره گردند. در این پژوهش از نرم افزار Aggrescan 3D برای بررسی پروتئینهایی که خاصیت خودتجمعی دارند استفاده شد و ...